Põhiline erinevus maksimaalse parsimoonia ja maksimaalse tõenäosuse vahel sõltub fülogeneetilise puu väljatöötamisel kasutatud meetodist. Maksimaalne säästlikkus keskendub kogu iseloomuseisundite minimeerimisele fülogeneetilise puu ehitamise ajal, samas kui maksimaalne tõenäosus on statistiline lähenemine fülogeneetilise puu joonistamisel sõltuv alt geneetiliste andmete vahelisest tõenäosusest.
Fülogenees on uudne lähenemisviis organismide klassifitseerimisele ja nomenklatuurile. Fülogenees tugineb geneetilistele andmetele ja evolutsioonilistele suhetele. Geneetilised andmed on DNA sekveneerimise tulemus. Fülogeneesis toimub organismide klassifitseerimine ühise esivanema põhjal. Maksimaalne tagasihoidlikkus ja fülogeneetilise seose maksimaalne tõenäosus suurendavad fülogeneetilise puu täpsust ja usaldusväärsust.
Mis on maksimaalne säästlikkus?
Maksimaalse parsimoonia tehnikas toimub kogu iseloomu oleku muutuste minimeerimine fülogeneetilise analüüsi käigus. Fülogeneetika on bioloogia haru, mis tegeleb evolutsiooniliste suhete uurimisega. Fülogeneetiline puu on puu, mis näitab ühisel esivanemal põhinevaid evolutsioonilisi suhteid. Seega, kui joonistada fülogeneetiline puu, kasutades maksimaalse parsimoonia kontseptsiooni, minimeeritakse paralleelse evolutsiooni hulk. Seetõttu loob maksimaalne säästlikkus puu palju kiiremini kui muud meetodid. Selle põhjuseks on asjaolu, et ainult peamisi eristavaid omadusi võetakse maksimaalselt arvesse.
Joonis 01: Maksimaalne säästlikkus
Maksimaalselt säästliku puu joonistamisel on puu alati võimalikult lühike puu minimaalse taksonite arvuga. Maksimaalse säästliku puu töökindlus on aga väga kõrge. Maksimaalsel parsimoonial põhineva fülogeneetilise seose statistiline järjepidevus ja täpsus varieeruvad. Lisaks on olemas keerukad algoritmid, mis analüüsivad fülogeneetilise seose maksimaalset tagasihoidlikkust.
Mis on maksimaalne tõenäosus?
Maksimaalne tõenäosus on üks enimkasutatavaid statistilisi meetodeid, mis analüüsivad fülogeneetilisi seoseid. Meetod analüüsib fülogeneesi tõenäosusmudeli alusel. Lisaks võtab see meetod arvesse nii keskmist kui ka dispersiooni. Seega saavutatakse fülogeneesis maksimaalne tõenäosus konkreetse organismi antud geneetiliste andmete põhjal.
Joonis 02: maksimaalne tõenäosus
Maksimaalse tõenäosuse statistilise meetodi kasutamisel on nii eeliseid kui ka puudusi. Meetod on väga asjakohane, kui analüüsida lihtsat geneetilist informatsiooni sisaldavat andmekogumit. Kui geneetiliste andmete varieeruvus on väiksem, on maksimaalsed tõenäosusskoorid usaldusväärsed. Maksimaalse tõenäosusega saadud tulemused kinnitavad veelgi konkreetse fülogeneetilise suhte maksimaalseid parsimooniaskoore. Seetõttu toimib maksimaalse tõenäosuse analüüs kinnitava testina.
Võrreldes ülalmainitud eelistega on see meetod aeglane ja intensiivne protsess. Lisaks on ühe andmekogumi puudumisel veaväljund kõrge. Seega muudab see ka tulemuste reprodutseerimise raskemaks maksimaalse tõenäosuse hinnanguga.
Millised on sarnasused maksimaalse säästlikkuse ja maksimaalse tõenäosuse vahel?
- Maksimaalne tagasihoidlikkus ja maksimaalne tõenäosus on kaks lähenemisviisi, mis mängivad fülogeneesis olulist rolli.
- Mõlemad tehnikad kujutavad olemasolevate geneetiliste andmete põhjal organismi suhet tema esivanemaga.
- Fülogeneetilisi puid saab tõlgendada kasutades nii maksimaalset kasinlikkust kui ka maksimaalset tõenäosust.
- Mõlema tehnika puhul põhinevad geneetilised andmed DNA või RNA sekveneerimisel.
- Mõlemad meetodid on fülogeneetiliste puude loomisel olulised.
Mis vahe on maksimaalsel säästlikkusel ja maksimaalsel tõenäosusel?
Nii maksimaalne kassihoidlikkus kui ka maksimaalne tõenäosus on fülogeneetilise puu tõlgendamisel kaks erinevat lähenemist. Maksimaalne säästlikkus usub väheste omaduste analüüsimisse ja organismi iseloomumuutuste minimeerimisse. Seevastu maksimaalse tõenäosuse meetod võtab arvesse nii keskmist kui ka dispersiooni ning annab maksimaalse tõenäosuse konkreetse organismi antud geneetilistele andmetele. Niisiis, see on peamine erinevus maksimaalse tagasihoidlikkuse ja maksimaalse tõenäosuse vahel.
Lisaks ei piisa järelduse tegemiseks ainuüksi maksimaalse säästlikkuse usaldusväärsusest. Kuid maksimaalse tõenäosuse meetod toimib maksimaalse parsimoonia tulemuste kinnitava testina. Seega tuleks järelduste tegemisel kasutada nii maksimaalset tagasihoidlikkust kui ka maksimaalset tõenäosust.
Allpool olev infograafik võtab kokku erinevuse maksimaalse tagasihoidlikkuse ja maksimaalse tõenäosuse vahel.
Kokkuvõte – maksimaalne tagasihoidlikkus vs maksimaalne tõenäosus
Fülogenees mängib olulist rolli evolutsiooniliste suhete tuletamisel fülogeneetiliste puude ehitamise kaudu. Maksimaalne säästlikkus on puu koostamise tehnika minimaalse tähemärkide olekumuutuste arvuga. Seevastu fülogeneetilise puu maksimaalne tõenäosus sõltub geneetiliste andmete maksimaalse sarnasuse kasutamisest. Mõlema analüüsi andmed pärinevad DNA või RNA järjestuse andmetest. Töökindlus ja täpsus on kõrged, kui puu ehitamine toimub mõlemat tehnikat kasutades. Seega võtab see kokku erinevuse maksimaalse tagasihoidlikkuse ja maksimaalse tõenäosuse vahel.
