Geel- ja paberielektroforeesi peamine erinevus seisneb selles, et geelelektroforeesi eralduskeskkonnaks on agaroosgeel, samas kui paberielektroforeesi eralduskeskkonnaks on puhverlahusesse sukeldatud pabeririba.
Elektroforees on analüütiline meetod, mis on kasulik proovi analüüsimiseks, kasutades selles proovis sisalduvate keemiliste liikide elektrilisi omadusi. Siin saame jälgida hajutatud lahustunud aine liikumist analüüsitud keskkonnas. Seetõttu saame määrata keemiliste liikide liikumise söötme suhtes. Geelelektroforees ja paberi elektroforees on keemias kaks olulist tehnikat.
Mis on geelelektroforees?
Geelelektroforeesi võib kirjeldada kui makromolekulide eraldamise ja analüüsi meetodit sõltuv alt suurusest ja laengust. Makromolekulid võivad selles kontekstis viidata DNA-le, RNA-le, valkudele ja nende fragmentidele. See meetod on kasulik kliinilises keemias valkude eraldamiseks laengu või suuruse järgi. Lisaks on biokeemias ja molekulaarbioloogias oluline DNA ja RNA fragmentide segapopulatsiooni eraldamine nende pikkuse järgi, et hinnata DNA ja RNA fragmentide suurust. Lisaks saame seda kasutada valkude eraldamiseks nende laengu järgi.
Joonis 01: Geelelektroforeesi seadmed
Me saame eraldada nukleiinhappemolekule, rakendades elektrivälja negatiivselt laetud molekulide liikumiseks läbi agaroosi või muude ainete maatriksi. Selles protsessis saavad lühemad molekulid liikuda kiiremini, samas kui pikemad molekulid liiguvad aeglasem alt. Seda seetõttu, et lühemad molekulid võivad kergesti geelipooridest läbi liikuda. Me nimetame seda fragmentide liikumist läbi pooride "sõelumiseks". Lisaks ei saa me tavaliselt selle meetodiga valke nende suuruse järgi eraldada, kuna valgud on liiga suured, et neid geelipooridest välja sõeluda. Siiski saame seda protsessi kasutada nanoosakeste eraldamiseks.
Mis on paberielektroforees?
Paberi elektroforeesi võib kirjeldada kui eraldamist, kasutades puhverlahuses leotatud filterpaberit. Üldjuhul kasutame puhverlahusena dietüülbarbituurhapet ja leelises lahustatud barbituurhapet. Selle puhverlahuse pH väärtus on 8,6. Lisaks võime paberile asetada väikese koguse seerumit ja seejärel juhitakse seda mitu tundi läbi alalisvoolu.
Paberi elektroforees on oluline väikeste laetud molekulide, sealhulgas aminohapete ja väikeste valkude eraldamiseks. Siin peame niisutama filterpaberi riba puhvriga ja kastma riba otsad puhvermahutitesse, mis sisaldavad elektroode. Esimene inimene, kes seda meetodit kasutas, oli Konig aastal 1937. Oma leidudes tutvustas ta tsoonielektroforeesi jaoks paberiga immutatud puhvrit ja soovitas ka UV-tuvastust.
Mis vahe on geeli- ja paberielektroforeesil?
Elektroforees on analüütiline meetod, mis on kasulik proovi analüüsimiseks, kasutades selles proovis sisalduvate keemiliste liikide elektrilisi omadusi. Geelelektroforees ja paberelektroforees on kaks olulist elektroforeesi meetodit. Peamine erinevus geeli- ja paberielektroforeesi vahel on see, et geelelektroforeesi eralduskeskkonnaks on agaroosgeel, samas kui paberelektroforeesi eralduskeskkonnaks on puhverlahusesse sukeldatud pabeririba.
Allpool on kõrvuti võrdlemiseks kokkuvõte geeli ja paberi elektroforeesi erinevusest tabeli kujul.
Kokkuvõte – geel vs paber elektroforees
Geelelektroforees on makromolekulide eraldamise ja analüüsi meetod sõltuv alt suurusest ja laengust, paberi elektroforees aga eraldamine, kasutades puhverlahuses leotatud filterpaberit. Peamine erinevus geeli ja paberi elektroforeesi vahel on see, et geelelektroforeesi eralduskeskkond on agaroosgeel, samas kui paberelektroforeesi eralduskeskkond on puhverlahusesse sukeldatud pabeririba.
