Põhiline erinevus DNA profiilide koostamise ja DNA sekveneerimise vahel on see, et DNA profiilide koostamine on meetod, mida kasutatakse isendi tuvastamiseks proovist, vaadates DNA ainulaadseid mustreid, samas kui DNA sekveneerimine on meetod, mida kasutatakse järjestuse määramiseks. nukleotiide indiviidi DNA tükis.
Tehnoloogiad, nagu DNA profiilide koostamine ja DNA sekveneerimine, on populatsioonis pärilikkuse mustri määramisel väga kasulikud. Kuigi DNA profiilide koostamine ja DNA sekveneerimine hõlmavad samu meetodeid, on nende lõppeesmärk erinev. Seetõttu näitab DNA profiilide koostamine indiviidi geneetilist ülesehitust. Seevastu DNA sekveneerimine määrab genoomi ja valgud, mida indiviid kodeerib.
Mis on DNA profileerimine?
DNA profiilide koostamine on meetod, mida kasutatakse isendi tuvastamiseks proovist, vaadates DNA ainulaadseid mustreid. Selle tehnika avastas esmakordselt 1984. aastal professor Sir Alec Jeffreys. DNA profiilide koostamine tuvastab genoomis palju minisatelliite, et luua üksikisiku jaoks ainulaadne muster. Seda nimetatakse DNA-sõrmejäljeks. Tõenäosus, et kahe inimese vahel on sama DNA sõrmejälg, on väga haruldane. Seetõttu, nagu tegelik sõrmejälg, on ka DNA-sõrmejälg inimese jaoks ainulaadne. DNA-profiilide koostamine hõlmab tavaliselt DNA-proovide võtmist ja selle võrdlemist kuriteopaig alt leitud prooviga.
Joonis 01: DNA profileerimine
DNA-profiilide koostamisel eraldatakse DNA esiteks inimmaterjalist. Seejärel kasutatakse DNA lõikamiseks restriktsiooniensüüme. Seejärel eraldatakse saadud DNA tükid geelelektroforeesi abil. Kui DNA tükid on geelis välja sorteeritud, kantakse need nailonmembraanile, et toota üksikuid DNA ahelaid. Nailonmembraani inkubeeritakse radioaktiivsete sondidega. Sondid on minisatelliidid. Nad kinnituvad ainult nende DNA tükkide külge, mis on komplementaarsed. Lõpuks saab sondide külge kinnitatud proovi DNA minisatelliite visualiseerida röntgenfilmide abil. Lisaks on see DNA-muster DNA-sõrmejälg, mis on üksikisiku jaoks ainulaadne.
Mis on DNA sekveneerimine?
DNA sekveneerimine on meetod, mida kasutatakse nukleotiidide järjestuse määramiseks indiviidi DNA tükis. Seda tuntakse ka kui nukleotiidide järjestuse määramist DNA-s. Erinevate DNA sekveneerimismeetodite tulek on tohutult kiirendanud bioloogilisi ja meditsiinilisi uuringuid. See kehtib paljudes valdkondades, nagu meditsiiniline diagnostika, biotehnoloogia, kohtuekspertiisi bioloogia, viroloogia ja bioinformaatika. Tervete ja muteerunud proovide DNA järjestuste võrdlemisel saab diagnoosida erinevaid haigusi, nagu vähk.
Joonis 02: DNA järjestamine
DNA sekveneerimise tuvastas esmakordselt Frederick Sanger 1970. aastatel. Sangeri sekveneerimisel kopeeritakse sihtmärk-DNA-d mitu korda, luues erineva pikkusega fragmente. Sangeri sekveneerimise lõpus sisaldab toru erineva pikkusega fragmente, mis lõpevad algse DNA igas nukleotiidi positsioonis. Selle tehnika puhul tähistavad fluorestseeruva ahela terminaatornukleotiidid fragmentide otsad. Samuti võimaldavad need järjestust määrata. Seega saab detektoris üksteise järel salvestavate värvainete värvide põhjal koostada algse DNA järjestuse.
Viimastel aastatel on välja töötatud erinevaid uusi DNA järjestuse määramise tehnikaid, näiteks järgmise põlvkonna järjestamist. Järgmise põlvkonna sekveneerimine on laiaulatuslik lähenemisviis, mis suurendab DNA sekveneerimise kiirust. See vähendab ka DNA sekveneerimise kulusid.
Millised on DNA profileerimise ja DNA järjestuse sarnasused?
- DNA profileerimine ja DNA sekveneerimine on mõlemad molekulaarbioloogilised tehnikad.
- Need mõlemad põhinevad DNA-l.
- Mõlemad kasutavad ühiselt PCR-i ja geelelektroforeesi.
- Need tehnikad on indiviidi genoomi tuvastamiseks väga olulised.
- Mõlemat tehnikat kasutatakse kohtuekspertiisi valdkonnas laialdaselt.
- Lisaks saab neid rakendada isaduse testimisel.
Mis vahe on DNA profileerimisel ja DNA sekveneerimisel?
DNA profiilide koostamine on meetod, mida kasutatakse isendi tuvastamiseks proovist, vaadates DNA ainulaadseid mustreid. Teisest küljest on DNA sekveneerimine meetod, mida kasutatakse nukleotiidide järjestuse määramiseks indiviidi DNA tükis. Niisiis, see on peamine erinevus DNA profiilide koostamise ja DNA sekveneerimise vahel. Lisaks on DNA profiilide koostamise eesmärk tuvastada inimese DNA varieeruvus minisatelliitide kujul. Seevastu DNA sekveneerimise eesmärk on määrata DNA molekuli moodustavate nukleotiidide järjestus.
Järgmine infograafik esitab tabelina erinevusi DNA profiilide koostamise ja DNA järjestuse määramise vahel.
Kokkuvõte – DNA profileerimine vs DNA sekveneerimine
DNA profileerimine ja DNA sekveneerimine on kaks peamist molekulaarbioloogilise tehnikat. Neil on laialdased rakendused kohtuekspertiisis, meditsiinilises diagnostikas, biotehnoloogias, viroloogias ja biosüstemaatikas. DNA profiilide koostamist kasutatakse indiviidi tuvastamiseks proovist, vaadates DNA ainulaadseid mustreid, samas kui DNA sekveneerimist kasutatakse nukleotiidide järjestuse määramiseks indiviidi DNA tükis. Seega on see kokkuvõte erinevusest DNA profiilide koostamise ja DNA sekveneerimise vahel.
