Põhiline erinevus snRNA ja snRNP vahel on see, et snRNA-d on väikesed tuuma RNA molekulid, samas kui snRNP-d ehk väikesed tuuma ribonukleoproteiinid on väikesed valkudega tuuma RNA molekulid.
snRNA-d on mittekodeerivad, bioloogiliselt aktiivsed väikesed RNA molekulid, mille keskmine suurus on 150 nukleotiidi. Need esinevad tavaliselt koos valkudega looduslikus olekus snRNP-dena. Seega on snRNP-d väikesed tuuma-RNA-d, millel on mitu snRNP-spetsiifilist valku. snRNP-d on seotud translatsioonijärgsete RNA töötlemise sündmuste, nagu splaissimine jne, vahendamises või reguleerimises. Nii snRNA kui ka snRNP leidub eukarüootsete rakkude tuumas.
Mis on snRNA?
snRNA tähistab väikest tuuma RNA-d. Need on väikesed tuuma-RNA molekulid, mida leidub eukarüootsetes rakkudes raku tuuma splaissimise täppides ja Cajal-kehades. SnRNA molekuli keskmine pikkus on 150 nukleotiidi. Neid snRNA-sid transkribeerivad pol II ja pol III. SnRNA põhifunktsiooniks on pre-messenger RNA (hnRNA) töötlemine tuumas. Nad on peamiselt seotud translatsioonijärgsete RNA töötlemise sündmuste, näiteks splaissimisega, vahendamise või reguleerimisega. SnRNA-de toime tõttu toimub intronite täpne joondamine ja õige ekstsisioon. Lisaks osalevad snRNA-d transkriptsioonifaktorite (7SK RNA) või RNA polümeraas II (B2 RNA) reguleerimises ja telomeeride säilitamises.
Joonis 01: snRNA
snRNA-d on mittekodeerivad RNA-d. Need kuuluvad tuumas paikneva väga rikkaliku bioloogiliselt aktiivse RNA klassi. Need on alati seotud valgu molekulidega ja eksisteerivad väikeste tuuma ribonukleoproteiinidena (snRNP). SnRNA-sid on kahte peamist tüüpi: Sm-klassi snRNA ja Lsm-klassi snRNA. U1, U2, U4, U4atac, U5, U7, U11 ja U12 on Sm-klassi snRNA, samas kui U6 ja U6atac on Lsm-klassi snRNA.
Mis on snRNP?
snRNP on väike tuuma RNA molekul, mis on kombineeritud valkudega. Üldiselt sisaldab iga snRNP ühte snRNA-d ja palju valgu molekule. Seetõttu on snRNP-d väikesed tuuma RNA molekulid ja valgud. snRNP-d koos paljude teiste täiendavate valkudega moodustavad kompleksi, mida nimetatakse splaissosoomiks, kus toimub RNA splaissing. snRNP-d vajavad intronite eraldamiseks nii RNA osa kui ka valguosa. RNA komponent vastutab endonukleaasi jaotustükkide eest, kuna sellel on ensümaatiline aktiivsus. SnRNP-sid on erinevat tüüpi ja need lõikavad erinevatest kohtadest.
Joonis 02: snRNP spliceosoomis
Lisaks splaissimisele osalevad snRNP-d mRNA-de primaarsete transkriptide tuumaküpsemises, geeniekspressiooni reguleerimises, splaissimise doonoris mittekanoonilistes süsteemides ja replikatsioonist sõltuvate histooni mRNA-de 3'-otsa töötlemises. SnRNP-sid on kaks spetsiaalset rühma: väikesed nukleolaarsed RNP-d (snoRNP-d) ja väikesed Cajal-keha RNP-d (scaRNP-d).
Millised on snRNA ja snRNP sarnasused?
- Nii snRNA-l kui ka snRNP-l on väikesed tuuma-RNA molekulid.
- snRNA-d ühinevad valkudega, moodustades snRNP-sid.
- Iga snRNP sisaldab ühte snRNA-d.
- Eukarüootsete rakkude tuumas leidub nii snRNA-d kui ka snRNP-d.
Mis vahe on snRNA ja snRNP vahel?
snRNA on väike mittekodeeriv RNA molekul, mis paikneb eukarüootse raku tuumas, samas kui snRNP on üksiku snRNA ja snRNP-spetsiifiliste valkude kompleks. snRNPS on väikesed tuuma ribonukleoproteiini osakesed. snRNA on vaid väike RNA molekul, samas kui snRNP on snRNA molekuli ja tihed alt seotud valkude kompleks. Niisiis, see on peamine erinevus snRNA ja snRNP vahel.
All infograafikul on tabelina näidatud erinevused snRNA ja snRNP vahel.
Kokkuvõte – snRNA vs snRNP
snRNA on mittekodeerivate väikeste tuuma-RNAde klass, mis paikneb eukarüootses tuumas. Nad täidavad olulisi funktsioone, mis on seotud introni splaissimise ja muu RNA töötlemisega. Looduslikus olekus on snRNA seotud valkudega ja eksisteerib väikeste tuuma ribonukleoproteiini osakestena (snRNP-d).snRNP-d koos paljude teiste valkudega osalevad RNA splaissimise läbiviimiseks splaissosoomikompleksi moodustamises. Seega võtab see kokku erinevuse snRNA ja snRNP vahel.
