Põhiline erinevus snRNA ja snoRNA vahel on see, et snRNA hõlmab pre-mRNA alternatiivset splaissimist, samas kui snoRNA hõlmab rRNA ja tRNA muutmist, mRNA redigeerimist ja genoomi jäljendamist.
Väike RNA on polümeersed RNA molekulid, mis koosnevad vähem kui 200 nukleotiidist. Need on tavaliselt mittekodeerivad. Need eksisteerivad signaalide edastamiseks Messenger RNA-de hulgas. Väikesed RNA-d pärinevad täiuslikust kaheahelalisest RNA-st, mida toodetakse RNA-st sõltuva RNA polümeraasi toimel. Väikesed RNA-d mängivad olulist rolli rakkude diferentseerumises, kasvus ja proliferatsioonis, apoptoosis, ainevahetuses, migratsioonis ja kaitses. Seetõttu on väikesed RNA-d olulised ja kriitilised arengu ja füsioloogia regulaatorid. Väike tuuma-RNA ja väike nukleolaarne RNA on väikeste RNA molekulide kaks klassi.
Mis on snRNA?
Väike tuuma-RNA ehk snRNA on eukarüootsete rakkude tuumas leiduvate väikeste RNA molekulide klass. SnRNA keskmine pikkus on ligikaudu 150 nukleotiidi. RNA polümeraas II või RNA polümeraas III transkribeerib snRNA. SnRNA põhifunktsiooniks on pre-messenger RNA töötlemine tuumas. Samuti aitavad need reguleerida transkriptsioonifaktoreid või RNA polümeraas II ja säilitada telomeere.
Joonis 01: Väikese RNA toimemehhanism
On kaks snRNA klassi, mis põhinevad ühistel järjestuse tunnustel ja seotud valgufaktoritel, nagu RNA-d siduv LSm-valk. Need kaks klassi on Sm-klassi snRNA ja Lsm-klassi snRNA. Sm-klassi snRNA koosneb suurest uridiinisisaldusest U1, U2, U4, U4atac, U5, U7, U11 ja U12. RNA polümeraas II transkribeerib SM-klassi snRNA. Pärast pre-snRNA transkriptsiooni saavad nad tavaliselt tuumas 7-metüülguanosiini 5' korgi. Seejärel eksporditakse need tuumapooride kaudu edasiseks töötlemiseks tsütoplasmasse. Lsm-klassi snRNA-l on kõrge uridiinisisaldus U6 ja U6atac. RNA polümeraas III transkribeerib Lsm-klassi snRNA ja see ei lahku tuumast. Kõige tavalisemad inimese snRNA komponendid on U1 splaissosomaalne RNA, U2 splaissosomaalne RNA, U4 splaissosomaalne RNA, U5 splaissosomaalne RNA ja U6 splaissosomaalne RNA.
Mis on snoRNA?
Väike nukleolaarne RNA ehk snoRNA on väikeste RNA molekulide klass, mis juhivad keemilisi modifikatsioone teistes RNA-des, nagu ribosomaalne RNA, ülekande-RNA ja väike tuuma-RNA. Iga snoRNA molekul on modifitseerimisprotsessi käigus seotud RNA/valgu kompleksis ligikaudu nelja tuumvalguga. SnoRNA sisaldab antisenss-elementi, mis on umbes 10-20 nukleotiidi. Need alused täiendavad nukleotiide ümbritsevat järjestust, mis on suunatud modifikatsioonile pre-RNA molekulis.
Joonis 02: Väike nukleolaarne RNA
SnoRNA-sid on kahte klassi. Need on C/D kasti snoRNA ja H/ACA kasti snoRNA. C/D box snoRNA on seotud metüülimisega ja H/ACA box snoRNA on seotud pseudouridüülimisega. Iga snoRNA molekul toimib siht-RNA ühe või kahe modifikatsiooni juhisena. C/D kasti snoRNA sisaldab kahte lühikest konserveerunud järjestuse motiivi C ja D, vastav alt snoRNA 5' ja 3' otsa lähedal. Lühikesed piirkonnad, mis koosnevad 5 nukleotiidist, paiknevad C-kastist ülesvoolu ja D-kastist allavoolu ning moodustavad tüvi-kasti struktuuri. See toob C- ja D-kasti motiivid vahetusse lähedusse. Tüvekarbi struktuur on oluline snoRNA õigeks sünteesiks ja nukleolaarseks lokaliseerimiseks. H/ACA kasti snoRNA-l on sekundaarne struktuur, mis koosneb kahest juuksenõelast ja kahest üheahelalisest piirkonnast. Seda nimetatakse tavaliselt juuksenõel-hinge-juuksenõel-saba struktuuriks. H / ACA kasti snoRNA koosneb ka kahest konserveerunud motiivist H ja ACA. Mõlemad asuvad üheahelalistes piirkondades. H-kast on hinges ja ACA on saba piirkonnas. Kolm nukleotiidi moodustavad järjestuse 3' otsa.
Millised on snRNA ja snoRNA sarnasused?
- snRNA ja snoRNA on väikesed RNA-d.
- Mõlemad esinevad eukarüootsetes rakkudes.
- Mõlemad on mittekodeerivad RNA molekulid.
- Lisaks osalevad nad RNA muutmises transkriptsiooniprotsessi ajal.
Mis vahe on snRNA ja snoRNA vahel?
snRNA osaleb pre-mRNA alternatiivses splaissimises, samas kui snoRNA muudab peamiselt RNA molekule. Seega on see peamine erinevus snRNA ja snoRNA vahel. Lisaks on snRNA-d umbes 150 nukleotiidi pikkused ja sageli leitakse, et need on seotud valkude ja kompleksidega, mida nimetatakse väikesteks tuuma ribonukleoproteiinideks. snoRNA-d on umbes 60–170 nukleotiidi pikkused ja neid leidub peamiselt tuumas.
Lisaks transkribeerib snRNA-sid kas RNA polümeraas II või RNA polümeraas III, samas kui snoRNA-d transkribeerib ainult RNA polümeraas II.
Allpool olev infograafik esitab snRNA ja snoRNA vahelised erinevused tabelina kõrvuti võrdlemiseks.
Kokkuvõte – snRNA vs snoRNA
snRNA ja snoRNA on väikeste RNA molekulide klassid. snRNA osaleb pre-mRNA alternatiivses splaissimises, samas kui snoRNA muudab peamiselt RNA molekule. Seega on see peamine erinevus snRNA ja snoRNA vahel. Väikesed RNA-d on polümeersed RNA molekulid, mis koosnevad vähem kui 200 nukleotiidi pikkusest ja mis tavaliselt ei kodeeri. snRNA-sid leidub eukarüootide tuumas. snoRNA-sid leidub arhedes ja eukarüootides. SnRNA transkriptsioon toimub RNA polümeraas II ja II kaudu, samas kui snoRNA transkribeerimises osaleb ainult RNA polümeraas II. Niisiis, see võtab kokku erinevuse snRNA ja snoRNA vahel.
