Põhiline erinevus geneetilise ja füüsilise kauguse vahel on järjestuse tüüp, mida kasutatakse sama liigi kahe populatsiooni vahelise kauguse analüüsimisel. Geneetiline kaugus mõõdab geneetilist lahknevust liikide või liigi sees olevate populatsioonide vahel, samas kui füüsiline kaugus mõõdab nukleotiidide arvu kahe markeri vahel.
Geneetiline kaugus ja füüsiline kaugus annavad ülevaate liigi kahe populatsiooni vahelistest evolutsioonilistest suhetest. Seetõttu pakuvad kauguskaardid populatsioonide seostamist geneetiliste andmete põhjal. Genoomi järjestamisel ja bioinformaatika analüüsil on oluline roll nii geneetiliste kui ka füüsiliste kauguste määramisel.
Mis on geneetiline kaugus?
Geneetiline kaugus on liikide või populatsioonide geneetilise lahknevuse mõõt. Seda kaugust mõõdetakse esivanemate suhete ja evolutsioonimustrite abil. Geenide sarnasus on oluline geneetilise kauguse mõõtmisel. Geneetiline kaugus määrab ka liigi kauguse tema esivanemast. Veelgi enam, geneetilisi kaugusi kasutatakse peamiselt populatsioonide vaheliste suhete hindamisel kogu maailmas. Seetõttu seostab see inimliikide populatsioone kogu maailmas nende geneetiliste mustrite alusel.
Geneetilise kauguse arvutamine toimub liikide ja populatsioonide kui terviku geneetilise sarnasuse leidmise teel. Seetõttu mängib bioinformaatika olulist rolli erinevate liikide ja populatsioonide vahelise geneetilise kauguse määramisel.
Lisaks on olemas erinevad mudelid, mis esindavad populatsioonide vahelisi geneetilisi kaugusi. Nende hulka kuuluvad Nei geneetiline kaugus, Cavalli-Sforza ja Edwardsi mõõdud ning Reynoldsi, Weiri ja Cockerhami geneetiline kaugus.
Mis on füüsiline kaugus?
Füüsiline kaugus on kahe liigi või populatsiooni vahelise nukleotiidide arvu mõõtmine. Seega läheb füüsikalise kauguse arvutamisel mõõtmistase edasi monomeersetes tasemetes. See hõlmab üksikute nukleotiidjärjestuste või tervete genoomide kui terviku analüüsimist. Markergeenide vaheline füüsiline kaugus mängib nendevaheliste nukleotiidide arvu määramisel olulist rolli.
Seega, kui füüsiline kaugus kahe populatsiooni vahel suureneb, suureneb ka geneetiline kaugus. See võib omakorda suurendada ka organismide keerukust. Nii geneetiline kui ka füüsiline kaugus loovad kahe populatsiooni vahel evolutsioonilise suhte.
Millised on geneetilise kauguse ja füüsilise kauguse sarnasused?
- Geneetiline kaugus ja füüsiline kaugus määravad evolutsioonilised suhted liigi kahe populatsiooni vahel.
- Mõlemad kasutavad kauguste analüüsimiseks bioinformaatika- ja järjestusandmeid.
- Need on täpsed tehnikad, mis viitavad evolutsioonilistele ja esivanemate suhetele.
- Lisaks suurendab ühe suurendamine teist.
Mis vahe on geneetilisel ja füüsilisel kaugusel?
Põhiline erinevus geneetilise ja füüsilise kauguse vahel sõltub kauguskaardi tuletamisel kasutatud järjestuste tüübist. Geneetiline kaugus on kahe populatsiooni vaheline kaugus seoses geneetilise lahknemisega, samas kui füüsiline kaugus mõõdab nukleotiidide kaugust kahe populatsiooni vahel.
Allpool olev infograafik annab rohkem teavet geneetilise kauguse ja füüsilise kauguse erinevuse kohta.
Kokkuvõte – geneetiline kaugus vs füüsiline kaugus
Geneetiline kaugus ja füüsiline kaugus viitavad mõlemad liigi kahe populatsiooni evolutsioonilisele ja esivanemate seosele. Seetõttu on mõlemad olulised, et jõuda järeldusele evolutsiooniliste kauguste kohta. Geneetiline kaugus viitab kahe populatsiooni vahelisele kaugusele spetsiifiliste geneetiliste markerite suhtes, samas kui füüsiline kaugus viitab kaugusele valitud markergeenidega külgnevate nukleotiidjärjestuste vahel. Seega on see peamine erinevus geneetilise ja füüsilise kauguse vahel.
