Peamine erinevus – ainevahetus vs metaboomika
Metaboliidid on väikesed molekulid, mis osalevad rakkude metaboolsetes reaktsioonides. Metaboliidid hõlmavad metaboolseid vaheühendeid, hormoone, sekundaarseid metaboliite, signaalmolekule jne. Need on rakkude biokeemiliste reaktsioonide funktsioneerivad molekulid. Bioloogilise proovi või üksiku organismi metaboliitide täielikku komplekti nimetatakse metaboloomiks. Metaboloom on dünaamiline kollektsioon, mis muutub kehas iga sekund. Metaboloomika ja metabonoomika on kaks mõistet, mis on seotud organismi metaboolsete ainete uurimisega. Peamine erinevus metaboomika ja metabonoomika vahel on see, et metabonoomika on rohkem mures normaalse endogeense metabolismi ja metaboolse profiilide koostamise pärast raku või elundi tasandil, samas kui metabonoomika tegeleb rohkem metaboolse profiilide koostamise laiendamisega teabega keskkonnateguritest, haigustest, soolestiku põhjustatud ainevahetushäiretest. mikroorganismid ja metaboolsete profiilide võrdlemine jne. Metaboloomikat juhib peamiselt massispektromeetria ja metabonoomika kasutab metaboliitide analüüsiks NMR-spektroskoopiat.
Mis on metaboloomika?
Metaboloomika on rakkudes, biovedelikes, kudedes või organismides toimuvate ainevahetusprotsesside uurimine. See hõlmab rakuliste metaboliitide tuvastamist ja kvantifitseerimist heade analüütiliste ja statistiliste vahendite abil. Ainevahetust peetakse oluliseks uuringuks, kuna see annab teavet organismi ainevahetuse kohta.
Substraatide ja metaboolsete reaktsioonide produktide uurimiseks kasutab metaboolika analüütilise platvormina massispektromeetriat. Massispektromeetria näitab metaboliitide tüüpe ja nende kontsentratsioone, peegeldades rakkude või kudede tegelikku biokeemilist seisundit. Seega võib metaboloomikat pidada organismi molekulaarse fenotüübi parimaks esindajaks. Metaboloomika on organismide väikeste molekulide omiline tehnoloogia, mida võrreldakse teiste oomiliste uuringutega; metaboloomika on väga oluline, kuna see peegeldab otseselt rakkude biokeemilise reaktsiooni hetkeseisu.
Metaboloomikat võib pidada ka proteoomika laienduseks, kuna need tekivad ensüümide aktiivsuse tõttu, mis on valgud, nagu on näidatud järgmisel joonisel.
Joonis 01: Metaboloomika skeem
Mis on metabonoomika?
Metabonoomika on määratletud kui mitmeparameetriliste metaboolsete reaktsioonide kvantitatiivne mõõtmine teatud ajahetkedel seoses patofüsioloogiliste stresside või geneetilise muundamisega. Seda rakendatakse tavaliselt inimeste toitumise ja ravimitele või haigustele reageerimise uuringute kohta. Selle lähenemisviisi algatas Jeremy Nicholson Londoni Imperial College'is ja seda on kasutatud paljudes valdkondades, sealhulgas toksikoloogias, haiguste diagnoosimises, toitumises jne. Ajalooliselt oli metabonoomika üks esimesi meetodeid süsteemibioloogia kohaldamiseks uuringutes. ainevahetusest.
Metabonoomika on rohkem mures biokeemiliste profiilide võrdlemise pärast, mitte üksikute metaboolsete ühendite tuvastamise pärast metaboloomikas. Seetõttu võib metabonoomikat määratleda metaboomika alamhulgana. See rõhutab peamiselt erinevate populatsioonide metaboolsete profiilide võrdlemist haiguste, keskkonnastresside, geneetilise muundamise, toitumise, ravimite jms osas, sest metaboliidid on head markerid, mis annavad märku haigusseisunditest, ravimite mõjudest, keskkonnastressidest, toksiinidega kokkupuutest. jne
Metaboomilised uuringud näitavad nii rakusiseseid kui ka rakuväliseid metaboliite. See kasutab suure läbilaskevõimega tehnikaid suure hulga metaboliitide samaaegseks ja korduv alt analüüsimiseks, võimaldades rakkude füsioloogilise seisundi ajalist uurimist. Samuti näitab see seost metaboliitide ja organismi patoloogilise seisundi vahel. Metabonoomiliste uuringute toetamiseks võib kasutada genoomikat ja proteoomikat, kuna need on omavahel seotud, nagu on näidatud ül altoodud joonisel.
Mis vahe on metaboloomikal ja metaboomikal?
Metaboloomika vs metaboomika |
|
| Metaboloomika on organismi metaboliitide täieliku komplekti uurimine | Metabonoomika on elussüsteemide multiparameetriliste metaboolsete reaktsioonide kvantitatiivne uuring ajaliselt patofüsioloogilistele stiimulitele või geneetilisele modifikatsioonile. |
| Põhimure | |
| Metabolomics tegeleb rohkem metaboolsete profiilide koostamisega ja rakkudes esinevate üksikute metaboliitide tuvastamisega. | Metabonoomika tegeleb rohkem metaboliitide või populatsioonide metaboolsete profiilide võrdlemisega seoses geneetiliste modifikatsioonide, haiguste, keskkonnastresside, patoloogiliste stiimulite, ravimite jne. |
| Teave | |
| Metaboloomika keskendub peamiselt endogeensele ainevahetusele. | Metabonoomika ei piirdu endogeense ainevahetusega. See laiendab teavet sisemiste ja väliste tegurite (nt toitumisharjumuste, toksiinide, haigusprotsesside jne) põhjustatud ainevahetushäirete kohta. |
| Analüütilised tööriistad | |
| See kasutab peamise analüütilise platvormina massispektromeetriat | Metabonomics kasutab peamise analüütilise platvormina NMR-spektroskoopiat. |
Kokkuvõte – ainevahetus vs metaboomika
Metaboloom esindab väikeste molekulide kogumit, mida nimetatakse metaboliitideks, mis esinevad rakus või organismis. Metaboloomika uurib kogu metaboolset profiili metaboolse profiili loomiseks. Metaboloomika võimaldab teadlastel mõõta raku või organismi tegelikku füsioloogilist seisundit. Metabonoomika on osa metaboomikast, mis hõlmab teavet elussüsteemide multiparameetriliste metaboolsete reaktsioonide kohta patofüsioloogilistele stiimulitele ja geneetilistele modifikatsioonidele. Metabonoomika ei ole seotud ainult individuaalse metaboolse profiiliga, nagu metaboomika; see võrdleb metaboolseid profiile muude teguritega, nagu keskkonnastress, haigused, toksiinid jne. Nii metaboomika kui ka metabonoomika hõlmavad organismide metaboliitide uuringuid, et mõõta rakkude tegelikku füsioloogilist seisundit. Seetõttu peetakse mõnikord neid kahte sünonüümideks, arvestamata metaboloomika ja metabonoomika erinevust.
