Põhiline erinevus homodimeeri ja heterodimeeri vahel on see, et homodimeer on valk, mis on valmistatud kahest identsest valgust, samas kui heterodimeer on valk, mis on valmistatud kahest erinevast valgust.
Valk on biomolekul, mis koosneb aminohappeahelatest. Valgu dimeer on kvaternaarne valgu struktuur, mis moodustub kahe valgu monomeeri või kahe aminohappeahela liitumisest. Üldiselt seostuvad nad üksteisega mittekovalentsete sidemetega. Valgu dimeerid on kas homodimeerid või heterodimeerid. Homodimeeril on kaks identset valku, mis on mittekovalentselt seotud. Heterodimeeril on kaks erinevat valku, mis on omavahel seotud. See valgu dimeeri interaktsioon on oluline regulatsioonis ja katalüüsis.
Mis on homodimeer?
Homodimeer on teatud tüüpi valgu dimeer, mis koosneb kahest identsest monomeerist. Monomeerid seostuvad mittekovalentsete sidemetega. Üldiselt on homodimeerides keskmiselt 18 H-sidemete arvu. Veelgi enam, korrelatsioonikoefitsient H-sidemete ja homodimeeri liidesejääkide vahel on 0, 85. Lisaks on maksimaalne H-sidemete arv homodimeeri liidese jäägi kohta 0, 44. Mitte ainult seda, vaid ka homodimeerides on rohkem molekulidevahelisi H-sidemeid. Kuid H-sidemete tihedus liidese jäägi kohta on homodimeerides madalam.
Joonis 01: Homodimeer
Kui võtta arvesse homodimeeride näiteid, on 1. klassi RNA-d homodimeerid. Selles homodimeeris vastutab R1 valk nukleotiidide redutseerimise eest, samas kui valk R2 vastutab diraud-türosüüli massiivi hoidmise eest. Teine valgu homodimeer on kilpnäärme poolt toodetud türeoglobuliin. Ksantiinoksüdaas ja etanertsept on samuti valkude homodimeerid.
Mis on heterodimeer?
Heterodimeer on teatud tüüpi valgu dimeer, mis on moodustatud kahest mitteidentsest monomeerist. Teisisõnu on heterodimeer valk, mis koosneb kahest erinevast valgu monomeerist. Üldiselt on heterodimeerides 12 keskmist H-sidemete arvu. Veelgi enam, korrelatsioonikoefitsient heterodimeeri H-sidemete ja liidesejääkide vahel on 0, 83. Lisaks on maksimaalne H-sidemete arv heterodimeeri liidese jäägi kohta 0, 65. Võrreldes homodimeeridega on heterodimeerides vähem molekulidevahelisi H-sidemeid. Kuid H-sidemete tihedus liidese jäägi kohta on heterodimeerides suurem.
Joonis 02: Heterodimeer
Ensüümi pöördtranskriptaas on heterodimeer, mis koosneb kahest erinevast aminohappeahelast. Teine heterodimeeri näide on opioidiretseptorid. Lisaks on tubuliin heterodimeerne valk.
Millised on homodimeeri ja heterodimeeri sarnasused?
- Homodimeer ja heterodimeer on kahte tüüpi valgu dimmerid.
- Mõlemal on kaks monomeeri.
- Need on kvaternaarsed valgustruktuurid.
- Dimerid on levinud katalüüsis ja reguleerimises.
Mis vahe on homodimeeril ja heterodimeeril?
Homodimeer on valgu dimeer, mis koosneb kahest identsest valgu monomeerist, samas kui heterodimeer on valgu dimeer, mis koosneb kahest erinevast valgu monomeerist. Niisiis, see on peamine erinevus homodimeeri ja heterodimeeri vahel. Lisaks on homodimeerides H-sidemete keskmine arv 18, samas kui heterodimeerides on H-sidemete keskmine arv 12.
Lisaks on veel üks erinevus homodimeeri ja heterodimeeri vahel see, et korrelatsioonikoefitsient H-sidemete ja liidesejääkide vahel on homodimeerides 0,85, heterodimeerides aga 0,83.
Allpool olev infograafik homodimeeri ja heterodimeeri erinevuste kohta näitab rohkem võrdlusi mõlema dimeeri vahel.
Kokkuvõte – homodimeer vs heterodimeer
Valgu dimeerid on katalüüsis ja regulatsioonis tavalised. Need võivad olla kas homodimeerid või heterodimeerid. Homodimeerid koosnevad kahest identsest valgu monomeerist. Seevastu heterodimeerid koosnevad kahest mitteidentsest valgu monomeerist. Seega on see peamine erinevus homodimeeri ja heterodimeeri vahel.
