Põhiline erinevus geenide kaardistamise ja geenide järjestamise vahel seisneb selles, et geenide kaardistamine on meetod, mis tuvastab geeni asukoha genoomis ja geenidevahelised kaugused, samas kui geenide järjestamine on meetod, mis tuvastab geenide nukleotiidide täpse järjekorra. geen.
Geeni kaardistamine ja geenide järjestamine on geenidiagnostikas olulised, et tuvastada ja kinnitada geenide olemasolu. Seega mängivad molekulaarsed tehnikad, nagu geelelektroforees ja polümeraasi ahelreaktsioon, olulist rolli geenikaardi tuletamisel. Lisaks on geenijärjestuse genereerimiseks oluline kasutada erinevaid sekveneerimistehnikaid, nagu Sangeri järjestamine ja järgmise põlvkonna sekveneerimine.
Mis on geenide kaardistamine?
Geeni kaardistamine on tehnika kromosoomi geenide asukohtade täieliku kaardi genereerimiseks. Kromosoomide kaardistamine on geenide kaardistamise sünonüüm. Lisaks annab see meetod teavet kromosoomis paiknevate spetsiifiliste geenide kohta. Veelgi enam, geenide kaardistamine kasutab kaardistamise käigus füüsilisi kaardistamismeetodeid.
Joonis 01: Geenikaardistamine
Geenikaardistamine võib aidata leida kromosoomaberratsioone. Seetõttu toimib geneetiline kaart diagnostilise vahendina selliste seisundite tuvastamiseks nagu Downsi sündroom ja Turnersi sündroom jne. Karüotüpiseerimine on üks tehnika, mida saab kasutada geneetilise kaardi loomiseks. Värvimine on oluline meetod geneetilise kaardi koostamisel, kus kasutatakse selliseid plekke nagu etiidiumbromiid, akridiinapelsin ja Giemsa. Geenikaardistamine võib luua ka seostuskaarte, kus toimub seotud geenide asukoha tuvastamine.
Mis on geenide järjestamine?
Geeni sekveneerimine on tehnika, mida kasutatakse geeni täpse aluspaari järjestuse tuvastamiseks ja tuletamiseks. Seega saab geenide sekveneerimise abil tuletada järjestuses adeniini, guaniini, tümiini ja tsütosiini aluste järjekorda. Esimene kogu genoomi järjestamine toimus mikroorganismides. Inimese genoomi järjestamise projekt oli üks pöördepunkte molekulaarbioloogia ajaloos. Praegu mängib geenide järjestamine tööstuses ja meditsiinis olulist rolli. See kinnitab täpselt konkreetse geeni olemasolu genoomis.
Joonis 02: geenide järjestamine
Geeni järjestamiseks on erinevaid tehnikaid. Maxam ja Gilbert olid geenide või DNA järjestamise keemilise meetodi kasutuselevõtu pioneerid. Potentsiaalselt ohtlike kemikaalide kasutamine viib aga keemilise sekveneerimise tehnikast loobumiseni. Hiljem võttis Sanger kasutusele järjestustehnika, milles ei kasutatud ohtlikke kemikaale. Kuid praegu mängivad automatiseeritud järjestamine ja järgmise põlvkonna sekveneerimine olulist rolli konkreetse geeni järjestuse tuletamisel.
Millised on geenikaardistamise ja geenijärjestuse sarnasused?
- Mõlemad tehnikad mängivad geneetilises diagnostikas olulist rolli.
- Need tehnikad suudavad kinnitada geenide olemasolu genoomis.
- Tehnikaid, nagu polümeraasi ahelreaktsioon, saab kasutada mõlemas protsessis.
Mis vahe on geenide kaardistamise ja geenijärjestuse vahel?
Põhiline erinevus geenikaardistamise ja geenide järjestuse vahel on informatsioon, mille kaks tehnikat genereerivad. Geenide kaardistamine annab teavet konkreetse geeni asukoha kohta kromosoomis, samas kui geenide järjestamine genereerib teavet konkreetse geeni aluspaaride järjestuse kohta. Kuid mõlemad tehnikad mängivad geeni iseloomustamisel rolli. Seega on nende kahe tehnika valmimiseks kuluv aeg ja kulu erinevad.
Allpool olev infograafik võtab kokku erinevused geenide kaardistamise ja geenide järjestamise vahel.
Kokkuvõte – geenide kaardistamine vs geenide järjestamine
Geeni kaardistamine ja geenide järjestamine on kaks tehnikat, mis aitavad geeni iseloomustada. Kuigi geenikaart võimaldab geeni asukoha kindlaks teha, annab geenijärjestus selle konkreetse geeni biokeemilisi andmeid. Geenide kaardistamine ja geenide järjestamine on geeniuuringutes ja geenidiagnostikas väga olulised. Lisaks on mõlemad tehnikad nüüd automatiseeritud, et tagada nende kiire ja täpne toimimine. Geenide kaardistamise ja geenide järjestamise kaudu genereeritud teavet kasutatakse molekulaardiagnostika käigus järgnevates protsessides.
