Peamine erinevus – geenide järjestamine vs DNA sõrmejälgede võtmine
DNA järjestamine on molekulaargeneetikas oluline meetod, mille käigus määratakse konkreetse DNA järjestuse nukleotiidjärjestus või organismi kogu genoom. See võimaldab teadlasel või diagnostikul määrata DNA järjestuste mutatsioone ja eristada üht organismi teisest nende geneetilise koostise alusel. Geenide järjestamine on geeni või DNA fragmendi sekveneerimisprotseduur Sangeri sekveneerimise või järgmise põlvkonna sekveneerimise abil. DNA sõrmejälgede võtmine hõlmab tehnikat, mida nimetatakse piirava fragmendi pikkuse polümorfismiks (RFLP), mille käigus kahe või enama subjekti DNA proovid killustatakse ja analüüsitakse isiku identiteedi kindlakstegemiseks. See on peamine erinevus geenide järjestuse ja DNA sõrmejälgede võtmise vahel.
Mis on geenide järjestamine?
Geeni sekveneerimist tehakse konkreetse geeni nukleotiidjärjestuse määramiseks. Kui kogu genoom sekveneeritakse, nimetatakse seda kogu genoomi järjestamiseks. Algselt tehti geenide järjestamiseks keemilisi meetodeid, milles kasutati kahjulikke kemikaale, nagu püridiin; see tehnika katkestati peagi katse mürgisuse tõttu. Praegu toimub geenide sekveneerimine enamasti Sangeri sekveneerimisena tuntud meetodiga, mis kasutab ahela lõpetamise etappi desoksüribonukleiinhapete abil. Reaktsioon viiakse läbi neljas eraldi katseklaasis, kus igas katseklaasis märgistatakse praimer, kasutades fluorestsentsmarkerit, mis määrab lõpuks konkreetse fragmendi järjestuse. Sangeri automaatne sekveneerimine kasutab fluorestsentssignaalide tuvastamiseks ja tulemuste edastamiseks detektorit.
Joonis 01: DNA järjestamine
Järgmise põlvkonna sekveneerimine on sekveneerimismeetodite uusim arendus ja suure jõudlusega tehnika, mis võrdub 1000 Sangeri sekveneerimisreaktsiooni sooritamisega korraga. Järgmise põlvkonna järjestuse peamised funktsioonid on:
- Väga paralleelne – paljud järjestusreaktsioonid toimuvad samal ajal.
- Mikroskaala – reaktsioonid on väikesed ja paljusid saab korraga teha kiibil.
- Kiire – kuna reaktsioonid toimuvad paralleelselt, valmivad tulemused palju kiiremini.
- Lühem pikkus – näidud jäävad tavaliselt vahemikku 505050–700700700 nukleotiidi.
Geenisekveneerimist kasutatakse peamiselt uudse geeni järjestuse määramiseks või haiges seisundis esineva geeni mutatsioonide analüüsimiseks ja haiguste geneetilise aluse kinnitamiseks. Seda kasutatakse ka põllumajandusliku biotehnoloogia valdkonnas, et määrata kindlaks uued taimeliikide sortid ja tuvastada taimegeenid, mis vastutavad kasulike agronoomiliste tunnuste eest, nagu kahjurikindlus, vastupidavus haigustele ja põuakindlus.
Mis on DNA sõrmejälgede võtmine?
DNA sõrmejälgede võtmine on tehnika, mida kasutatakse peamiselt kohtuekspertiisi uuringutes, et kinnitada kohtuekspertiisi uurimisega seotud isiku identiteeti. Esimestel päevadel tehti DNA sõrmejälgede võtmine hübridisatsioonitehnikaga, kasutades fluorestsents- või raadiomärgistatud markereid. Praegu tehakse DNA sõrmejälgede võtmist RFLP tehnikaga. See meetod kasutab restriktsiooniensüüme, mis on ensüümid, mis on võimelised DNA-d spetsiifilistes järjestustes tükeldama. Kui analüüsimiseks tuuakse kaks proovi, lagundatakse mõlemad proovid fragmentide saamiseks samade restriktsiooniensüümidega. Kui kaks proovi on sarnased, peaks elektroforeesi geeli kujutis olema mõlema proovi puhul identne. Kui see pole sarnane, ei ole geelipildid identsed. Seega saab selle tehnika abil isiku identiteeti kinnitada.
DNA sõrmejälgede võtmist kasutatakse kõige sagedamini kuriteopaiga tõelise kahtlusaluse leidmiseks, analüüsides kuriteopaigal olemasolevaid bioloogilisi proove. Nendest saadaolevatest proovidest (juuksed/sperma/sülikad/veri) eraldatakse DNA ja analüüsitakse kahtlusaluste DNA-proovidega, et teha kindlaks tegelik süüdlane.
Millised on geenijärjestuse ja DNA sõrmejälgede sarnasused?
- Mõlemal juhul on analüüsitavaks prooviks DNA proov.
- Mõlema tehnika tulemuste määramiseks kasutatakse elektroforeesi.
Mis vahe on geenide järjestamisel ja DNA sõrmejälgede võtmisel?
Geenijärjestus vs DNA sõrmejälgede võtmine |
|
Geenijärjestus on protsess, mis määrab konkreetse geeni või kogu genoomi nukleotiidjärjestuse. | DNA-sõrmejälgede võtmine hõlmab tehnikat, mille käigus kahe või enama subjekti DNA-proovid killustatakse ja analüüsitakse, et teha kindlaks isiku identiteet. |
Tehnoloogia alused | |
Geenisekveneerimisel kasutatakse sekveneerimismeetodeid, nagu Sangeri sekveneerimine või Next Generation sekveneerimine. | Piiramise fragmendi pikkuse polümorfismi kasutatakse DNA-sõrmejälgede võtmisel kahe subjekti proovi analüüsimiseks. |
Rakendused | |
Geenijärjestamist kasutatakse peamiselt geeniuuringutes, et analüüsida uusi geene, tuvastada mutatsioone ja teha geneetilisel diagnostikal põhinevaid järeldusi. | DNA sõrmejälgede võtmist kasutatakse kohtuekspertiisi uurimisel, et teha järeldusi kahtlustatava isiku kohta. |
Kokkuvõte – geenide järjestamine vs DNA sõrmejälgede võtmine
Geenijärjestusest ja DNA-sõrmejälgedest on saanud kaks populaarset testi, mida tehakse konkreetse geeni iseloomustamiseks või konkreetse isiku tuvastamiseks, kasutades inimese geneetilist sõrmejälge. Need tehnikad on täpsed ja kiired ning neid teostavad kvalifitseeritud töötajad, et saada kinnitatud tulemusi. Geenijärjestuse ja DNA sõrmejälgede võtmise erinevus seisneb selles, et geenide sekveneerimine keskendub geeni täpse nukleotiidijärjestuse leidmisele, samas kui DNA sõrmejälgede võtmine keskendub isikute identiteedi kinnitamisele kohtuekspertiisi uuringutes.
Geenijärjestuse vs DNA sõrmejälgede võtmise PDF-versiooni allalaadimine
Saate alla laadida selle artikli PDF-versiooni ja kasutada seda võrguühenduseta kasutamiseks vastav alt tsitaadi märkusele. Laadige PDF-versioon alla siit Geenijärjestuse ja DNA sõrmejälgede võtmise erinevus