Põhiline erinevus rakuvaba DNA ja ringleva kasvaja DNA vahel on see, et rakuvaba DNA on DNA erinevad vormid, mis ringlevad veres vab alt, samas kui ringlev kasvaja DNA on killustatud kasvajast tulenev DNA, mis ringleb veres.
Rakuvaba DNA ja tsirkuleeriv kasvaja DNA on kahte tüüpi ringlevaid nukleiinhappeid. Tsirkuleerivad nukleiinhapped avastasid Mandel ja Metal aastal 1948. Hiljem avastati, et tsirkuleerivate nukleiinhapete hulk haigetel patsientidel on oluliselt kõrge. See avastus tehti esmakordselt seoses luupuse patsientidega. Lisaks on tsirkuleerivatel nukleiinhapetel kõrgem prognostiline väärtus ja neid saab kasutada biomarkerina erinevate haiguste tuvastamisel.
Mis on rakuvaba DNA?
Rakuvaba DNA (Cf DNA) viitab DNA erinevatele vormidele, nagu ringleva kasvaja DNA, rakuvaba mitokondriaalne DNA ja rakuvaba loote DNA jne, mis ringlevad vab alt veres. Rakuvaba DNA kõrgenenud taset täheldatakse kaugelearenenud haiguste, nagu vähk, trauma, sepsis, müokardiinfarkt, diabeet, insult, sirprakuline aneemia jne korral. Lisaks vähi- ja looteravimitele on rakuvaba DNA kasulik biomarker palju haigusi. Seda DNA-d saab kasutada ka transplantaadi äratõukereaktsiooni tuvastamiseks. Neid kasutatakse ka tavalise stressi, sünnieelse soo eristamise ja isaduse testimisel.
Joonis 01: Rakuvaba DNA
Rakuvaba DNA on tavaliselt kaheahelaline rakuväline DNA molekul. See koosneb väikestest fragmentidest (50 kuni 200 bp) ja suurematest fragmentidest (21 kb). Lisaks on seda juba tunnustatud usaldusväärse biomarkerina eesnäärme- ja rinnavähi diagnoosimisel. Rakuvaba DNA ringleb vereringes valdav alt nukleosoomidena. Nukleosoomid on histoonide ja DNA tuumakompleksid. Cf DNA-d saab kvantifitseerida, kasutades erinevaid meetodeid, nagu PCR, massiliselt paralleelne sekveneerimine, ultraviolettspektromeetria, PicoGreeni värvimine ja ELISA. Kuna Cf DNA tuvastamine vereringes on kiire, lihtne, mitteinvasiivne, korduv meetod, on see tulevikus potentsiaalne biomarker paljude haiguste, nagu autoimmuunsed reumaatilised haigused ja kasvajad, diagnoosimisel.
Mis on ringleva kasvaja DNA?
Tsirkuleeriv kasvaja DNA (Ct DNA) on killustatud kasvajast tulenev DNA, mis ringleb veres. Sellel on kasvaja päritolu. Kuna ringlev kasvaja võib peegeldada kogu kasvaja genoomi, on see pälvinud laialdase atraktiivsuse selle potentsiaalse kasulikkuse tõttu kliinilistes seadistustes. Tsirkuleerivate kasvajate testimiseks võib kasutada vedelaid biopsiaid, mis võtavad verd.
Joonis 02: Tsirkuleeriv kasvaja DNA
Ct DNA vabanemisega tõenäoliselt seotud bioloogilised protsessid hõlmavad apoptoosi ja nekroosi surevatest rakkudest või aktiivset vabanemist kasvajarakkudest. Tervetes kudedes võivad infiltreeruvad fagotsüüdid Ct DNA-d puhastada. Lisaks saab tsirkuleeriva kasvaja DNA analüüsimiseks kasutada erinevaid tehnikaid, nagu tilk-digitaalne PCR, BEAMing, CAPP-Seq (sügav sekveneerimine), ohutu sekveneerimine ja duplekssekveneerimine.
Millised on sarnasused rakuvaba DNA ja tsirkuleeriva kasvaja DNA vahel?
- Rakuvaba DNA ja tsirkuleeriv kasvaja DNA on kahte tüüpi ringlevaid nukleiinhappeid.
- Need koosnevad nukleotiididest.
- Mõlemat tüüpi saab kasutada potentsiaalsete markeritena erinevate haiguste diagnoosimiseks kliinilises plaanis.
- Neid leidub vereringes.
- Mõlemad on DNA molekulide ekstratsellulaarsed vormid.
- Need mõlemad puhastatakse infiltreeruvate fagotsüütidega.
Mis vahe on rakuvaba DNA ja tsirkuleeriva kasvaja DNA vahel?
Rakuvaba DNA on erinevad DNA vormid, nagu tsirkuleeriv kasvaja DNA, rakuvaba mitokondriaalne DNA ja rakuvaba loote DNA jne, mis ringlevad vab alt veres, samas kui tsirkuleeriv kasvaja DNA on fragmenteeritud kasvajast tulenev DNA. mis ringleb veres. Niisiis, see on peamine erinevus rakuvaba DNA ja ringleva kasvaja DNA vahel. Lisaks ringleb rakuvaba DNA fragmentidena vahemikus 50–220 aluspaari, samas kui tsirkuleeriv kasvaja DNA fragmentidena vahemikus 134–144 aluspaari.
Järgmine infograafik esitab kõrvuti võrdlemiseks tabelina rakuvaba DNA ja ringleva kasvaja DNA erinevust.
Kokkuvõte – rakuvaba DNA vs tsirkuleeriva kasvaja DNA
Tsirkuleerivad nukleiinhapped paiskuvad reguleeritud või juhuslike mehhanismide kaudu vereringesse. Rakuvaba DNA ja tsirkuleeriv kasvaja DNA on kahte tüüpi ringlevad nukleiinhapped. Rakuvaba DNA on erinevad DNA vormid, nagu ringleva kasvaja DNA, rakuvaba mitokondriaalne DNA, rakuvaba loote DNA, mis ringleb vab alt veres, samas kui ringleva kasvaja DNA on killustatud kasvajast tulenev DNA, mis ringleb veres. Seega võtab see kokku erinevuse rakuvaba DNA ja ringleva kasvaja DNA vahel.
