Põhiline erinevus cis- ja trans-splaissimise vahel seisneb selles, et cis-splaissimine on molekulisisene mehhanism, mis eemaldab intronid ja ühendab eksonid, mis on samas RNA transkriptis, samas kui trans-splaissimine on molekulidevaheline mehhanism, mis eemaldab intronid või outronid ja liitub eksonitega, mis ei asu samas RNA transkriptis.
RNA splaissimine on RNA töötlemise vorm enne valgusünteesi. Selles protsessis muundatakse äsja valmistatud pre-messenger RNA transkript küpseks messenger-RNA-ks. Küps sõnumitooja RNA aitab toota valgumolekuli. RNA splaissimise käigus eemaldatakse intronid (mittekodeerivad piirkonnad) ja eksonid (kodeerivad piirkonnad) liidetakse kokku, et saada küps mRNA. Cis ja trans splaissimine on kahte tüüpi RNA splaissimise mehhanisme.
Mis on Cis splaissimine?
Cis splaissimine on molekulisisene mehhanism, mis eemaldab intronid ja ühendab eksonid, mis on samas RNA transkriptis. Tavaline cis-splaissing töötleb ühte RNA molekuli. Cis splaissimine on tüüpiline pre-mRNA splaissimise protsess, mida teostavad splaissosoomid. Intronis on splaissimiseks väga olulised doonorsait (introni 5' ots), hargnemiskoht (introni 3' otsa lähedal) ja aktseptorsait (introni 3' ots). Splaissingu doonorkoht sisaldab invariantset järjestust GU introni 5' otsas. Splaissingu aktseptori saidil introni 3' otsas on muutumatu AG järjestus. AG järjestusest ülesvoolu on piirkond, mida nimetatakse pürimidiini piirkonnaks (polüpürimidiini trakt). Polüpürimidiini traktist veelgi ülesvoolu on hargnemispunkt, mis sisaldab adenosiini nukleotiidi. See nukleotiid osaleb lariaadi moodustumisel.
Joonis 01: Cis ja Trans splaissimine
Peamised splaissosoomid on U1, U2, U4, U5 ja U6. Nende hulgas on U1 ja U2 väga olulised. Cis-splaissimisel seostub U1 5' splaissimiskohaga ja U2 hargnemispunktiga 3' splaissimiskoha lähedal. U5/U4/U6 seob eksoneid 5' saidil, U6 aga U2-ga. Hiljem ilmub U1. U5 nihkub eksonist introniks ja U6 seondub 5' splaissimiskohas. Lisaks ilmub ka U4. U6/U2 katalüüsib ümberesterdamist, muutes introni 5'-otsa ligeerumiseks introni A-nukleotiidiga. See käivitab lariaadi moodustumise. Lariaadi moodustumisel seob U5 eksonit 3' splaissimiskohas ja 5' sait lõhustub. Splaissimise viimases faasis jäävad U2/U5/U6 seotuks lariidiga ja 3' sait lõhustatakse. Lisaks sellele ligeeritakse eksonid selles faasis ATP hüdrolüüsi abil.
Mis on Transsplicing?
Trans splaissimine on molekulidevaheline mehhanism, mis eemaldab intronid või outronid ja ühendab eksonid, mis ei asu samas RNA transkriptis. Trans-splaissimisel ei ole pre-mRNA molekulis 5' splaissimiskohta U1 valguga seondumiseks. Selle asemel liidetakse splaissingu liider (SL) RNA järjestusele outronis.
Joonis 02: Transliitmine
Outron on pre-mRNA piirkond 5'-korgi ja trans-splaissimiskoha vahel. Kuid U2 valk seondub tavaliselt 3' splaissimiskohaga. Pärast outroni eemaldamist splaisseeritakse splaissingu liidri (SL) ekson pre-mRNA esimese eksoniga. Lisaks on trans-splaissimine mehhanism, mida täheldatakse teatud mikroorganismides, näiteks Kinetoplastae klassi protistides, et ekspresseerida geene.
Millised on Cis-i ja Trans-splaissimise sarnasused?
- Cis ja trans splaissimine on kahte tüüpi RNA splaissimise mehhanisme.
- Mõlema mehhanismi puhul eemaldatakse intronid.
- Samuti ühendatakse mõlemas mehhanismis eksonid, moodustades küpse mRNA.
- Mõlemat mehhanismi leidub eukarüootides.
- Need mehhanismid prokarüootides puuduvad.
Mis vahe on cis- ja transsplaissimisel?
Cis splaissimine on molekulisisene mehhanism, mis eemaldab intronid ja ühendab eksonid, mis on samas RNA transkriptis, samas kui trans-splaissimine on molekulidevaheline mehhanism, mis eemaldab intronid või outronid ja ühendab eksonid, mis ei asu samas RNA transkriptis. ärakiri. Niisiis, see on peamine erinevus cis- ja trans- splaissimise vahel. Lisaks eemaldatakse cis-splaissimisel intronid, et moodustada küps mRNA. Teisest küljest eemaldatakse trans splaissimisel intronid või outronid, et moodustada küps mRNA.
Järgmine infograafik loetleb cis- ja trans-splaissimise erinevused tabeli kujul, et võrrelda neid kõrvuti.
Kokkuvõte – Cis vs Trans splaissimine
RNA splaissimine on RNA töötlemise vorm enne valgusünteesi protsessi. Cis ja trans splaissimine on kahte tüüpi RNA splaissimise mehhanisme, mida leidub eukarüootides. Cis splaissimine on molekulisisene mehhanism, mis eemaldab intronid ja ühendab eksonid, mis on samas RNA transkriptis, samas kui trans-splaissimine on molekulidevaheline mehhanism, mis eemaldab intronid või outronid ja ühendab eksonid, mis ei ole samas RNA transkriptis. Seega on arutelu cis- ja trans- splaissimise erinevuse üle lõpetatud.
