Põhierinevus TATA ja CAAT kasti vahel on see, et TATA kast on konserveerunud nukleotiidpiirkond, millel on TATAWAW konsensusjärjestus, samas kui CAAT box on konserveerunud nukleotiidpiirkond, mille konsensusjärjestus on GGCCAATCT.
TATA kast ja CAAT kast on kaks nukleotiidide piirkonda, mis mõjutavad eukarüootsete geenide transkriptsiooni. Need on mittekodeerivad DNA järjestused, mis on leitud transkriptsiooni initsiatsioonikohast ülesvoolu. Tegelikult leidub neid reguleerivas piirkonnas, mida tuntakse promootorina. Nii TATA kast kui ka CAAT kast vastutavad transkriptsiooni tõhususe eest. Need on konsensusjärjestused, mis ei ole evolutsiooniprotsessi jooksul muutunud.
Mis on TATA Box?
TATA box või Goldberg-Hognessi kast on konsensusjärjestus, mis asub eukarüootsete geenide promootorpiirkonnas. TATA kast on promootori põhielement. See asub 25 aluspaari transkriptsiooni initsiatsioonikohast ülesvoolu. Seda säilitatakse kogu evolutsiooniprotsessi vältel. TATA kasti konsensusjärjestus on TATAWAW, kus W on kas A või T. See on mittekodeeriv DNA järjestus. TATA kast on aga oluline geeni transkriptsiooniks. See on TATA-siduva valgu (TBP) ja teiste transkriptsioonifaktorite sidumissait. Kui need seostuvad TATA kasti, toimub RNA polümeraas II värbamine ja transkriptsiooni õige reguleerimine eukarüootsetes geenides.
Joonis 01: TATA-kast
Kuna TATA kast osaleb transkriptsiooni reguleerimises, võivad TATA kasti mutatsioonid põhjustada fenotüüpseid muutusi, mis põhjustavad selliseid haigusi nagu maovähk, spinotserebellaarne ataksia, Huntingtoni tõbi, pimedus, β-talasseemia, immunosupressioon, Gilberti sündroom, ja HIV-1 jne.
Mis on CAAT Box?
CAAT kast on nukleotiidide piirkond GGCCAATCT konsensusjärjestusega. Sarnaselt TATA kastile asub CAAT kast ka geeni promootorpiirkonnas. Seetõttu asub see umbes 75–80 aluspaari transkriptsioonikohast ülesvoolu.
Joonis 02: CAAT Box
Konkreetsed transkriptsioonifaktorid seostuvad CAAT-kastiga. See seondumine stabiliseerib eelinitsiatsioonikompleksi, et hõlbustada ensüümi RNA polümeraasi sidumist. Samamoodi töötab CAAT-kast regulatiivse jadana. Mutatsioonid CAAT kasti piirkonnas mõjutavad tugev alt promootori vastust ja transkriptsiooni reguleerimist.
Millised on TATA ja CAAT Boxi sarnasused?
- TATA ja CAAT on kaks nukleotiidide piirkonda, mida leidub eukarüootsete geenide regulatoorses järjestuses.
- Need leitakse ülesvoolu transkriptsiooni algatamise saidist.
- Mõlemad on konsensuslikud DNA järjestused.
- Need on olulised transkriptsiooni reguleerimiseks, seega on need regulatoorsed järjestused.
Mis vahe on TATA ja CAAT Boxi vahel?
TATA kast on konserveerunud nukleotiidipiirkond, mis on leitud umbes 25–30 aluspaari transkriptsiooni initsiatsioonikohast ülesvoolu. Teisest küljest on CAAT kast nukleotiidide konserveerunud piirkond, mis on leitud umbes 75–80 aluspaari transkriptsiooni initsiatsioonikohast ülesvoolu. Niisiis, see on peamine erinevus TATA ja CAAT kasti vahel. Lisaks on TATA kastil TATAWAW konsensusjada, samas kui GGCCAATCT on CAAT kasti konsensusjada.
Lisaks on veel üks oluline erinevus TATA ja CAAT kasti vahel see, et TATA kast annab TBP ja transkriptsioonifaktorite sidumiskoha ning osaleb transkriptsiooni reguleerimises, samas kui CAAT kast annab märku RNA transkriptsioonifaktori sidumissaidist.
Allpool infograafikat võetakse kokku TATA ja CAAT kasti erinevused.
Kokkuvõte – TATA vs CAAT Box
TATA kast ja CAAT kast on kaks osa eukarüootsete geenipromootorite konserveeritud piirkonnast. Need asuvad transkriptsiooni initsiatsioonikohast ülesvoolu. Mõlemad mõjutavad geenide transkriptsiooni, pakkudes kohti TATA-d siduvate valkude ja transkriptsiooni initsiatsioonifaktorite sidumiseks. TATA kast asub transkriptsiooni initsiatsioonikohast 25–35 aluspaari ülesvoolu, samas kui CAAT kast asub 75–80 aluspaari transkriptsiooni initsiatsioonikohast ülesvoolu. TATA-kasti konsensusjärjestus on TATAWAW, samas kui CAAT-kasti konsensusjärjestus on GGCCAATCT. Seega on see kokkuvõte erinevusest TATA ja CAAT kasti vahel.
