Põhiline erinevus võnkumise ja degeneratsiooni vahel on see, et võnkumine viitab hüpoteesile, mis selgitab mitte-Watsoni ja cricki paaristumist mRNA ja tRNA vahelise koodoni ja antikoodoni sidumise ajal. Samal ajal on koodoni degeneratsioon võime toota mitmest koodonist ühte aminohapet.
Molekulaarbioloogia keskne dogma selgitab protsessi, milles toimub funktsionaalsete valkude ekspressioon. Ja see protsess koosneb erinevatest etappidest, sealhulgas geneetilise materjali replikatsioonist, millele järgneb DNA järjestuse transkriptsioon mRNA järjestusse ja mRNA järjestuse translatsioon aminohappejärjestuseks.
Tõlkes mängivad olulist rolli võnkumise hüpoteesi ja koodoni degeneratsiooni mõisted. Wobble viitab üksiku tRNA võimele ära tunda rohkem kui üks koodon. See põhjustab koodonite degeneratsiooni. Degeneratsioon on nähtus, mille puhul ühte aminohapet võib täpsustada rohkem kui üks koodon. Lihtsam alt öeldes viitab degeneratsioon ühe aminohappe mitme koodi olemasolule.
Mis on Wobble?
Võõbumise hüpotees on oluline hüpotees, mis selgitab mitte-Watson Cricki baaside sidumist, mis toimub tõlkeprotsessi ajal. Siin on translatsioon molekulaarne protsess, mis muudab mRNA koodoni aminohappejärjestuseks. Selle hüpoteesi kohaselt on tRNA antikoodoni esimene alus võimeline siduma mRNA ahelas oleva koodoni kolmanda alusega mitte-Watsoni ja Cricki sidumismustri järgi. Seega ei järgi nad tavapäraseid adeniini-uratsiili või tsütosiini-guaniini sidumismustreid. Seda tuntakse antikoodoni aluse 1 ja koodoni aluse 3 võnkumismustrina.
Joonis 01: õõtsuva aluse sidumine
Vängupaarid hõlmavad uratsiili asemel adeniini ja inosiini sidumist. Uratsiil seostub adeniini, guaniini ja inosiiniga. Samuti on guaniin ja tsütosiin võimelised inosiiniga siduma. Seega on tRNA-s sisalduv inosiin üks ebatavalisi aluseid, mis läbivad võnkuva aluspaari.
Võõbuva aluspaari sidumine on vähem tugev, kuna see ei pruugi järgida Watsoni ja Cricki komplementaarset sidumist. Peale selle toob see kontseptsioon kaasa geneetilise koodi degeneratsiooni põhimõtte.
Mis on degeneratsioon?
Geneetilise koodi degeneratsioon viitab geneetilise koodi liiasusele. Seega võib olla palju aluspaaride kombinatsioone, mis täpsustavad ühte aminohapet. Üldiselt koosneb organismide koodon kolmest nukleotiidalusest. Degeneratsiooni mõistes võivad need kolm aluse kombinatsiooni muutuda, kuigi need põhjustavad sama aminohapet. Pealegi on seal rohkem kui 20 koodonit, kuigi looduses on ainult 20 aminohapet. Seega seletab degeneratsioon konkreetse aminohappe jaoks mitme koodoni olemasolu.
Joonis 02: Degeneratsioon
Degeneratsiooni korral võib kolmas alus kahe koodoni vahel muutuda. Seega glutamiinhapet täpsustavad nii koodonid GAA kui GAG, leutsiini aga koodonid UUA, UUG, CUU, CUC, CUA ja CUG.
Seetõttu on degeneratsiooni mõiste mutatsioonimäärade puhul väga oluline. Tänu sellele on genoomis toimuvad punktmutatsioonid talutavad ja tunduvad siiski olevat vaigistatud. Seega ei põhjusta seda tüüpi punktmutatsioonid aminohappejärjestuse mutatsiooni ega muutumist. Kui punktmutatsioonid viivad aga kodeeritud aminohappe vaheldumiseni, võib see põhjustada tõsiseid genotüübi- ja fenotüübilisi muutusi.
Millised on võnkumise ja degeneratsiooni sarnasused?
- Mõlemad on olulised hüpoteesid, mis esitatakse elu keskse dogma selgitamiseks seoses tõlkeprotsessiga.
- Pealegi mängivad mõlemad protsessid olulist rolli kolme aluspaari koodoni keele tõlkimisel 20 aminohappejärjestuseks.
- Need protsessid aitavad kaasa ka organismide evolutsioonimudelitele.
Mis vahe on võngel ja degeneratsioonil?
Põhiline erinevus võnkumise ja degeneratsiooni vahel on eelkõige asjaolu, et võnkumine põhjustab geneetilise koodi degeneratsiooni. Wobbling viitab mitte-Watsoni ja Cricki paaristumisele koodoni 3rd aluse ja antikoodoni 1st aluse vahel. Seevastu degeneratsioon on paljude kolmikkoodoni kombinatsioonide võime kodeerida ühte aminohapet.
Allpool olev infograafik võtab kokku võnkumise ja degeneratsiooni erinevuse.
Kokkuvõte – võnkumine vs degeneratsioon
Vinkumise hüpotees ja geneetilise koodi degeneratsioon on tõlkimise fenomeni kaks olulist mõistet. Siin on translatsioon kolmikkoodonite aminohapeteks muundamise protsess. Koodoni seondumisel antikoodoniga viitab mitte-Watsoni ja Cricki aluspaari avastamine võnkehüpoteesile. See kirjeldab aluste võnkumist koodoni ja antikoodoni vahel. Seevastu geneetilise koodi degenereerumine, mille tulemuseks on võnkumine, on nähtus, kus ühte aminohapet kodeerivad paljud erinevad koodonid. Niisiis, see on kokkuvõte erinevusest võnkumise ja degeneratsiooni vahel.
