Põhiline erinevus aktiivse saidi ja sidumissaidi vahel on see, et aktiivne sait aitab kaasa keemilise reaktsiooni katalüüsile, samas kui sidumissait aitab kaasa ligandi sidumisele suure molekuliga.
Sidumiskoht on valgu, DNA või RNA piirkond, millega ligand võib seonduda. Ensüümid on valgud. Aktiivne sait on ensüümi piirkond, millega substraadid võivad keemilise reaktsiooni läbimiseks seonduda. Sellel spetsiifilisel piirkonnal on ka sidumissait koos katalüütilise saidiga. Seetõttu aitavad sidumissaidid ainult ligandi sidumisel suure molekuliga, samas kui aktiivsed saidid aitavad nii ligandi seondumist suure molekuliga, lastes sellel läbida katalüüsitud keemilise reaktsiooni.
Mis on aktiivne sait?
Aktiivne sait on ensüümi piirkond, millega keemilise reaktsiooni substraadid seonduvad, et läbida katalüüsitud keemiline reaktsioon. see piirkond koosneb kahest alampiirkonnast sidumissaidina ja katalüütilise saidina. Seondumissait sisaldab mõningaid jääke, mis võivad aidata substraadil (reagentidel) ensüümiga seonduda. Katalüütiline koht aitab keemilist reaktsiooni katalüüsida. Pealegi on see piirkond ensüümi kogumahuga võrreldes väga väike; ligikaudu 10-20% kogu ensüümi mahust.
Joonis 01: Aktiivse saidi sidumissait ja katalüütiline sait
Tavaliselt sisaldab aktiivne sait 3-4 aminohapet. ensüümi ülejäänud aminohapped, mis on seotud ensüümi tertsiaarse struktuuri säilitamisega. Veelgi olulisem on see, et aktiivsel saidil on spetsiifiline disain, mis sobib konkreetse substraadiga. Seetõttu reageerivad need ensüümid ainult teatud substraatidega. Kuid mõnikord vajavad ensüümid oma toimimiseks kofaktoreid. Aktiivse saidi peamine ülesanne on vähendada keemilise reaktsiooni aktiveerimisenergiat, suurendades seeläbi reaktsiooni kiirust.
Mis on siduv sait?
Sidumiskoht on valgu, DNA või RNA piirkond, millega ligandid võivad seonduda. Seal võib ligand moodustada selle saidiga keemilise sideme. Need piirkonnad näitavad spetsiifilisust; konkreetne ligand seondub konkreetse sidumissaidiga. Seetõttu on see sait molekuliga seonduda võivate ligandide tüüpide mõõt.
Lisaks kasutame neid piirkondi sageli biomolekulide funktsionaalseks iseloomustamiseks. Näiteks saame iseloomustada aktiivse saidi funktsionaalsust selle sidumissaidi kaudu. Veelgi enam, DNA puhul on spetsiifiliseks sidumissaidiks DNA-s esinev transkriptsioonifaktori sidumissait.
Mis vahe on aktiivse saidi ja siduva saidi vahel?
Aktiivne sait on ensüümi piirkond, millega keemilise reaktsiooni substraadid seonduvad, et läbida katalüüsitud keemiline reaktsioon, samas kui sidumissait on valgu, DNA või RNA piirkond, millega ligandid võivad seonduda. See on peamine erinevus aktiivse saidi ja sidumissaidi vahel. Veelgi enam, aktiivsed saidid esinevad ensüümides ja aitavad suurendada konkreetse keemilise reaktsiooni reaktsioonikiirust, vähendades selle reaktsiooni aktiveerimisenergia barjääri. Sidumissaidid seevastu vastutavad spetsiifilise ligandi seondumise eest konkreetse molekuliga.
Allpool olev infograafik näitab tabeli kujul erinevust aktiivse saidi ja sidumissaidi vahel.
Kokkuvõte – aktiivne sait vs siduv sait
Aktiivsed saidid on ensüümide piirkonnad, mis võivad suurendada keemilise reaktsiooni reaktsioonikiirust, vähendades selle reaktsiooni aktiveerimisenergia barjääri. Seondumissait on mis tahes piirkond, millega ligand võib seonduda. Aktiivne sait sisaldab ka sidumissaiti. Erinevus aktiivse saidi ja sidumissaitide vahel seisneb olemasolus ja funktsionaalsuses. Seetõttu on peamine erinevus aktiivse saidi ja sidumissaidi vahel see, et aktiivne sait aitab kaasa keemilise reaktsiooni katalüüsile, samas kui sidumissait aitab kaasa ligandi sidumisele suure molekuliga.
