Peamine erinevus – plasmiid vs episoom
Organismidel on kromosomaalne DNA ja kromosomaalne DNA. Kromosomaalne DNA on pärilikkusinfot sisaldava geneetilise materjali põhiosa. Ekstrakromosomaalne DNA on samuti oluline organismide jaoks; prokarüootides on ekstrakromosomaalsel DNA-l spetsiaalsed geenid, nagu antibiootikumiresistentsus, resistentsus erinevate raskmetallide suhtes ja makromolekulide lagunemine. Plasmiid ja episoom on kahte tüüpi organismide ekstrakromosomaalne DNA. Plasmiidid on suletud, ringikujuline ja kaheahelaline bakterite DNA. Episoom on teist tüüpi suhteliselt suurem ekstrakromosomaalne DNA, mida omavad organismid. Peamine erinevus plasmiidi ja episoomi vahel on see, et plasmiidid ei suuda integreeruda bakteriaalse kromosomaalse DNA-ga, samas kui episoomid on võimelised integreeruma kromosomaalse DNA-ga.
Mis on plasmiid?
Plasmiid on väike ringikujuline kaheahelaline DNA. Bakterid sisaldavad kromosomaalse lisamaterjalina plasmiide. Plasmiidid on võimelised ise paljunema ilma kromosoomidega sidumata. Nad kannavad geene või teavet, mis on vajalik nende enda replikatsiooniks ja säilitamiseks. Seetõttu peetakse neid iseseisvaks DNA-ks.
Plasmiidid on väga väikese suurusega. Need eksisteerivad bakterite sees suletud ringidena. Plasmiidid sisaldavad bakterite olulisi geene. Need geenid kodeerivad erilisi omadusi, mis on kasulikud bakteritele, nagu antibiootikumiresistentsus, makromolekulide lagunemine, raskmetallide taluvus ja bakteriotsiinide tootmine.
Plasmiide kasutatakse molekulaarbioloogias vektoritena tohutult. DNA kaheahelaline olemus, antibiootikumiresistentsuse geenid, isepaljunemisvõime ja spetsiaalsed restriktsioonisaidid on olulised omadused, mis muutsid plasmiidid rekombinantse DNA tehnoloogias vektormolekulidena sobivamaks. Plasmiide on ka lihtne isoleerida ja peremeesbakteriteks transformeerida.
Joonis 01: Plasmiidid
Mis on episood?
Episoom on ekstrakromosomaalne geneetilise materjali tükk, mis võib mõnda aega eksisteerida iseseisva DNA-na ja mõnel teisel korral integreeritud vormina organismi genoomsesse DNA-sse. Episoome peetakse väheolulisteks geneetilisteks elementideks. Need pärinevad enamasti väljaspool peremeesorganismi viirusest või mõnest teisest bakterist. Nad võivad siseneda peremeesorganismi ja eksisteerida ekstrakromosomaalse DNA-na ning hiljem integreeruda genoomse DNA-ga ja paljuneda. Kui need eksisteerivad integreerimata üksustena, hävitab peremeesrakk need. Integreerimise korral luuakse episoomide uued koopiad ja edastatakse need ka tütarrakkudesse.
Episoome saab plasmiididest eristada nende suurema suuruse tõttu. Mõned näited hõlmavad insertsioonijärjestusi, bakterite F faktorit ja teatud viiruseid.
Joonis 02: Episoomid
Mis vahe on plasmiidil ja episoomil?
Plasmiid vs episoom |
|
| Plasmiid on väike, ringikujuline, kaheahelaline ekstrakromosomaalne bakterite DNA molekul. | Episoom on omamoodi kromosoomiväline DNA, mis on suurem kui plasmiidid. |
| Isepaljunemise võimalus | |
| See sisaldab enesepaljundamiseks vajalikku teavet. | See ei sisalda teavet enesepaljundamiseks. |
| Link kromosomaalse DNA-ga | |
| Need ei suuda seostuda bakterite kromosomaalse DNA-ga. | Neid saab integreerida kromosomaalse DNA-ga. |
| Erigeenide kodeering | |
| Mõned plasmiidides asuvad geenid pakuvad bakteritele erilisi tunnuseid, nagu antibiootikumiresistentsus, raskmetallide taluvus jne. | Episoomid ei sisalda erigeene. F-plasmiid sisaldab ainult F-faktori DNA-d. |
| Kasuta vektoritena | |
| Vektoritena kasutatakse plasmiide. | Episoome ei kasutata vektoritena. |
Kokkuvõte – plasmiid vs episoom
Episoom ja plasmiid toimivad bakterite kromosoomivälise DNA-na. Plasmiidid on isepaljunevad väikesed ringikujulised DNA molekulid, millel on erilised tunnused, nagu antibiootikumiresistentsus jne. Plasmiide kasutatakse rekombinantse DNA tehnoloogias vektoritena. Plasmiidid ei saa integreeruda bakterikromosoomi. Episoom on teist tüüpi bakterite ekstrakromosomaalne DNA. Nad on võimelised integreeruma bakterikromosoomidesse ja kanduma replikatsiooni käigus tütarrakkudesse. Need on suuremad kui plasmiidid, mis sisaldavad rohkem aluspaare. See on erinevus plasmiidide ja episoomide vahel.
