Plasmiidi ja kosmiidi peamine erinevus seisneb selles, et plasmiid on kaheahelaline, ümmargune ja suletud kromosoomiväline DNA, mis esineb bakterites ja arhees, samas kui kosmiid on hübriidvektorisüsteem, mis on moodustunud cos-järjestuse kombineerimise tõttu. lambda faagi ja bakterite plasmiidse DNA.
Geenitehnoloogia on biotehnoloogia edasijõudnute uuring. Geenitehnoloogia tehnika võib muuta või muuta elusorganismide genoomi. Lisaks on geenitehnoloogia abiks geeniteraapias ja geneetiliste häirete ravis. Enne geenide sisestamist teise organismi genoomi on vaja teha rekombinantne DNA molekul, mis suudab kanda soovitud DNA fragmenti ja toimetada peremeesorganismi. Seetõttu tehakse rekombinantse DNA tehnoloogia käigus seda vektorsüsteemi abil. Seega toimib vektor doonori ja peremeesorganismi vahelise kandja või vahendajana. Plasmiid ja kosmiid on kahte tüüpi vektoreid, mida tavaliselt kasutatakse rekombinantse DNA tehnoloogias ja geenitehnoloogias. Mõned neist on looduslikud vektorid, mõned aga kunstlikud vektorid. Plasmiid on looduslik vektor, kosmiid aga kunstlikult konstrueeritud vektor. Mõlemal tüübil on plusse ja miinuseid.
Mis on Plasmid?
Plasmiid on väike ümmargune kaheahelaline DNA, mis esineb prokarüootsetes organismides peamiselt bakterites ja arhees. Need eksisteerivad bakterite sees suletud ringidena. Samuti ei ole plasmiidid genoomne DNA. Seega ei mõjuta plasmiidide olemasolu või puudumine prokarüootsetes rakkudes nende rakkude ellujäämist. Plasmiidid on ekstrakromosomaalne DNA. Plasmiidid pakuvad aga bakteritele ja arheadele täiendavaid eeliseid. Need sisaldavad spetsiaalseid geene, nagu antibiootikumiresistentsus, resistentsus erinevate raskmetallide suhtes, makromolekulide lagunemine jne.
Lisaks on plasmiidid võimelised iseseisv alt paljunema ilma kromosoomidega sidumata. See kannab geene või teavet, mis on vajalik tema enda replikatsiooniks ja säilitamiseks. Pealegi on nad sõltumatu DNA. Nende eripärade tõttu on plasmiidid molekulaarbioloogias vektoritena tohutult kasutusel.
Joonis 01: Plasmiidid
DNA kaheahelaline olemus, antibiootikumiresistentsuse geenid, isepaljunemisvõime ja spetsiaalsed restriktsioonisaidid on olulised omadused, mis muudavad plasmiidid rekombinantse DNA tehnoloogias vektormolekulidena sobivamaks. Lisaks on plasmiide lihtne isoleerida ja peremeesbakteriteks transformeerida.
Mis on Cosmid?
Cosmid on hübriidne vektorsüsteem. See on kunstlik vektor, mis on konstrueeritud lambda faagi osakeste cos järjestuste ja plasmiidi kombineerimisel. Need cos-saidid või järjestused on pikad DNA fragmendid, mis koosnevad 200 aluspaarist. Neil on ühtsed või kleepuvad otsad, mis võimaldavad plasmiidil viiruse DNA-sse sobituda. Seetõttu on cos-saidid DNA pakendamiseks üliolulised. Seal on kolm cos-saiti, nimelt cosN-i sait, cosB-sait ja cosQ-sait. Need saidid hõlmavad DNA ahela nikerdamist terminaasi aktiivsuse kaudu, terminaasi hoidmist ja DNA degradatsiooni takistamist DNaaside poolt.
Joonis 02: Kosmiid
Kosmiidid võivad sobiva replikatsiooni alguspunkti abil replitseerida kas üheahelalist DNA-d või kaheahelalist DNA-d. Need sisaldavad ka antibiootikumiresistentsuse geene, mis võivad olla kasulikud markeritena transformeeritud rakkude valimisel. Seega on kosmiidid sarnaselt plasmiididega head vektorid rekombinantse DNA tehnoloogias.
Millised on plasmiidi ja kosmiidi sarnasused?
- Plasmiid ja kosmiid on vektorid, mida tavaliselt kasutatakse rekombinantse DNA tehnoloogias.
- Mõlemad on võimelised ise paljunema.
- Neil on replikatsiooni alguspunkt.
- Lisaks on neil mitu kloonimissaiti.
- Samuti sisaldavad need antibiootikumiresistentseid geene, mis on kasulikud markeritena.
- Võõr-DNA-d saab sisestada mõlemasse tüüpi ja luua rekombinantseid molekule.
- Lihtsad sõelumismeetodid on saadaval mõlema vektori jaoks.
- Mõlemad on kasulikud genoomsete raamatukogude koostamiseks.
Mis vahe on plasmiidil ja kosmiidil?
Plasmiid ja kosmiid on kahte tüüpi kloonimisvektoreid, mida kasutatakse geenitehnoloogias. Plasmiidid on väikesed ringikujulised kaheahelalised ekstrakromosomaalsed DNA molekulid, mis esinevad bakterites ja arhees. Teisest küljest on kosmiid hübriidvektor, mis on konstrueeritud lambda faagi DNA ja plasmiidse DNA cos järjestustest. See on peamine erinevus plasmiidi ja kosmiidi vahel. Lisaks võivad plasmiidid kanda kuni 25 kb DNA fragmente, samas kui komsiidid võivad sisaldada kuni 45 kb fragmente. Seega on see veel üks erinevus plasmiidi ja kosmiidi vahel.
Plasmiidi ja kosmiidi erinevuse infograafikas on üksikasjalikumat teavet.
Kokkuvõte – plasmiid vs kosmiid
Plasmiid on looduslikult esinev ekstrakromosomaalne DNA, samas kui kosmiid on faagi DNA ja plasmiidse DNA hübriidvektor. Mõlemad on kloonimisvektorid, mida kasutatakse rekombinantse DNA tehnoloogias. Kosmiidid sisaldavad spetsiaalseid kleepuvaid otsi, mida nimetatakse cos-saitideks, mis on vajalikud in vitro pakendamiseks. Teisest küljest sisaldavad plasmiidid mitmeid omadusi, mis muudavad need geenitehnoloogia ideaalseteks vektoriteks. Mõlemad võivad läbida iseseisva replikatsiooni või in vitro pakkida bakterirakkudesse. Plasmiidid on võimelised sisaldama 25 kb pikkust võõr-DNA fragmenti, samas kui kosmiidid võivad sisaldada 45 kb pikkust võõr-DNA fragmenti. Seega on kosmiidid kasulikud suuremate DNA fragmentide kloonimisel, kuna plasmiidvektorid ei suuda kloonida suuremaid fragmente. Seega võtab see kokku erinevuse plasmiidi ja kosmiidi vahel.
