Põhiline erinevus Cosmidi ja Phagemidi vahel on selles, millist tüüpi järjestusi need sisaldavad. Kosmiid sisaldab cos-saiti ja plasmiidi. Seetõttu on see hübriidvektor, samas kui fagemiid on plasmiid, mis sisaldab F1 faagi replikatsiooni alguspunkti F1.
Kosmiide ja fagemiide kasutatakse kloonimiseks, eriti suuremate DNA fragmentide kloonimiseks. Neid kasutatakse laialdaselt eriti erinevate valkude tootmise eest vastutavate geenide kloonimisel. Kosmiide ja fagemiide kas paljundatakse üksi plasmiididena või pakitakse viirusosakestesse ja seejärel paljundatakse.
Mis on kosmiid?
A Kosmiid, mida nimetatakse hübriidplasmiidiks, sisaldab cos saite, mis on ekstraheeritud lambda faagi osakestest ja plasmiidist. Need cos-saidid on pikad DNA fragmendid, millel on 200 aluspaari. Seega on neil ühtsed või kleepuvad otsad, mis võimaldavad plasmiidil viiruse DNA-sse sobituda. Seetõttu on cos-saidid DNA pakendamiseks üliolulised.
Kodu saite on kolm;
- cosN sait – osaleb DNA ahela lõikamisel terminaasi aktiivsuse kaudu
- cosB sait – tegeleb terminali hoidmisega.
- cosQ sait – osaleb DNA degradatsiooni vältimises DNaaside poolt.
Joonis 01: Kosmiid
Samuti võivad kosmiidid replitseerida kas üheahelalist DNA-d või kaheahelalist DNA-d, kasutades sobivat replikatsiooni alguspunkti. Kosmiidid sisaldavad tavaliselt transformantide valiku markeritena antibiootikumiresistentsuse geene. Seega võib kosmiidi kasutamine vektorina hõlbustada kloonimist ja vektori restriktsiooniensüümidega seedimine võib seejärel need fragmendid ekstraheerida.
Mis on fagemiid (phasmiid)?
Phagemid, mida nimetatakse ka Phasmidiks, on ka hübriidvektori tüüp. Fagemiidil on spetsiaalne replikatsiooni alguspunkt, mida nimetatakse replikatsiooni alguspunktiks f1. F1 replikatsiooni lähtekoht ekstraktib f1 faagist.
Phagemid suudab replitseerida nii ühe- kui ka kaheahelalist DNA-d. Replikatsioon võib toimuda plasmiidina, samal ajal läbides iseseisva replikatsiooni või pakitud faagiosakestesse ja lõpuks nakatada bakteriaalset peremeesorganismi E. coli. E coli rakkude nakatamisel nõuab f1 faag piluse olemasolu. Seetõttu on soopilused Phagemiidide in vitro pakkimisel olulised.
Millised on kosmiidi ja fagemiidi sarnasused?
- Nii Cosmid kui ka Phagemid on rekombinantse DNA tehnoloogias kasutatavad kloonimisvektorid.
- Cosmid ja Phagemid suudavad replitseerida ühe- ja kaheahelalist DNA-d.
- Mõlemad võivad läbida iseseisva replikatsiooni, mis sarnaneb plasmiididega.
- Cosmid ja Phagemid võivad läbida in vitro pakendamise ja nakatada bakterirakke.
- Nii Cosmid kui Phagemid nõuavad kloonimiseks sobivat replikatsiooni alguspunkti.
Mis vahe on kosmiidil ja fagemiidil?
Cosmid vs Phagemid |
|
| Cosmid on hübriidvektor, mis sisaldab cos-saiti ja plasmiidi. | Fagemiid on plasmiid, mis sisaldab F1 faagi replikatsiooni alguspunkti F1. |
| Cosi saitide olemasolu | |
| Cos saidid esinevad kosmiidis ja on vajalikud in vitro pakkimiseks. | Cosi saidid phagemidis puuduvad. |
| F1 replikatsiooni lähtekoha olemasolu | |
| Kosmiidis võib fi replikatsiooni alguspunkt esineda või mitte. | F1 replikatsiooni alguspunkt on fagemiidis olemas. |
| Antibiootikumiresistentsete geenide olemasolu | |
| Antibiootikumiresistentsed geenid esinevad kosmiidides, et tuvastada transformante mittetransformantidest. | Antibiootikumiresistentsed geenid fagemiidides puuduvad. |
| In vitro pakendamise nõue | |
| Nõuab cos-i saiti. | Nõuab seksipilust. |
Kokkuvõte – Cosmid vs Phagemid
Cosmid ja Phagemid on kloonimisvektorid, mida kasutatakse rekombinantse DNA tehnoloogias. Kosmiidid on hübriidvektorid, mis sisaldavad spetsiaalseid kleepuvaid otsi, mida tuntakse cos-saitidena. in vitro pakendamiseks on vaja neid cos saite. Kuigi fagemiidid on plasmiidid, mis sisaldavad f1-faagist ekstraheeritud replikatsiooni alguspunkti. Nii kosmiid kui ka fagemiid võivad läbida iseseisva replikatsiooni või in vitro pakkimise bakterirakkudesse. Need on olulised erinevused kosmiidi ja fagemiidi vahel.
