Põhiline erinevus N-seotud ja O-seotud oligosahhariidide vahel seisneb selles, et N-seotud oligosahhariidid tekivad, kui valkude N-aatomid seostuvad suhkruga, samas kui O-seotud oligosahhariidid tekivad siis, kui seriini või treoniini O-aatomid seonduvad suhkur.
Oligosahhariidid on süsivesikute molekulid, mis sisaldavad kolm kuni kuus ühikut monosahhariide või lihtsuhkruid. N-seotud oligosahhariidid on süsivesikute molekulid, kus oligosahhariid on seotud lämmastikuaatomiga. O-seotud oligosahhariidid seevastu on teatud tüüpi süsivesikud, kus suhkrumolekul on seotud valgu seriini- või treoniinijäägi hapnikuaatomiga.
Mis on N-seotud oligosahhariidid?
N-seotud oligosahhariidid on süsivesikute molekulid, mille oligosahhariidid on seotud lämmastikuaatomitega. See toimub N-glükosüülimise protsessi kaudu. Oligosahhariidid on süsivesikute ühendid, mis sisaldavad mitmeid suhkrumolekule. Neid nimetatakse mõnikord "glükaanideks". N-seotud glükosüülimise protsessis pärineb lämmastikuaatom tavaliselt valgu asparagiinijäägi amiidlämmastikust. Seda protsessi kirjeldatakse kõige paremini biokeemia valdkonnas.
Tavaliselt toimub N-seotud glükosüülimine paljudes eukarüootsetes valkudes. Eukarüootide seas esineb seda laialdaselt arhees, kuid harva bakterites. Me saame määrata N-seotud oligosahhariidi olemuse, mis on seotud glükoproteiiniga valgu ja raku kaudu, milles see ekspresseerub. N-seotud oligosahhariidide tüüp sõltub ka organismide liigist.
Glükoproteiinis on tavaliselt kahte tüüpi sidemeid: side glükaani sahhariidijääkide vahel ning side glükaaniahela ja valgumolekuli vahel. Seal on suhkruosad omavahel seotud glükosiidsidemete kaudu. Glükosiidsidemed on tavaliselt C1-C4 sidemed. Pealegi nõuab side oligosahhariidi ja valgujäägi vahel konsensusjärjestuse äratundmist.
Mis on O-seotud oligosahhariidid?
O-seotud oligosahhariidid on teatud tüüpi süsivesikud, mille puhul suhkrumolekul on seotud valgu seriini- või treoniinijäägi hapnikuaatomiga. Selle sideme moodustumise protsessi nimetatakse O-seotud glükosüülimiseks. See on üleminekujärgne modifitseerimisprotsess, mis toimub pärast valgu sünteesi.
Eukarüootide puhul toimub see süntees endoplasmaatilises retikulumis, Golgi aparaadis ja mõnikord ka tsütoplasmas. Prokarüootidel toimub see tsütoplasmas. On mitmeid eri tüüpi suhkruid, mis võivad seostuda seriini või treoniiniga. See seondumine võib valku mõjutada erineval viisil. Nt. rakkude kaubitsemine immuunsüsteemis, mis võimaldab ära tunda võõrmaterjali.
Mis vahe on N-seotud ja O-seotud oligosahhariididel?
N-seotud oligosahhariidid on süsivesikute molekulid, kus oligosahhariid on seotud lämmastikuaatomiga, samas kui O-seotud oligosahhariidid on teatud tüüpi süsivesikud, kus suhkrumolekul on seotud seriini- või treoniinijäägi hapnikuaatomiga. valk. Seetõttu on N-seotud ja O-seotud oligosahhariidide peamine erinevus selles, et N-seotud oligosahhariidid tekivad siis, kui valkude N-aatom seostub suhkruga, samas kui O-seotud oligosahhariidid tekivad siis, kui seriini või treoniini O-aatomid seostuvad suhkruga.
Allpool olev infograafik näitab erinevusi N-seotud ja O-seotud oligosahhariidide vahel kõrvuti võrdlemiseks tabelina.
Kokkuvõte – N-seotud vs O-seotud oligosahhariidid
Oligosahhariidid on teatud tüüpi suhkrumolekulid. Peamine erinevus N-seotud ja O-seotud oligosahhariidide vahel seisneb selles, et N-seotud oligosahhariidid tekivad siis, kui valkude N-aatomid seostuvad suhkruga, samas kui O-seotud oligosahhariidid tekivad siis, kui seriini või treoniini O-aatomid seonduvad suhkruga.
