Põhierinevus aminoatsüül-tRNA ja peptidüül-tRNA vahel on see, et aminoatsüül-tRNA on tRNA molekul, mis on seotud ribosoomi A-kohaga, samas kui peptidüül-tRNA on tRNA-molekul, mis on seotud ribosoomi P-kohaga.
Transfer RNA (tRNA) on RNA molekul, mis aitab dekodeerida messenger RNA (mRNA) järjestust valguks. Valgusünteesi käigus moodustab tRNA molekul aluspaare oma komplementaarse järjestusega mRNA-l (messenger RNA). See tagab sobiva aminohappe sisestamise kasvavasse polüpeptiidahelasse (valgumolekuli). Seetõttu on tRNA valgusünteesi translatsioonietapi oluline komponent. Aminoatsüül-tRNA ja peptidüül-tRNA on kahte tüüpi tRNA molekulid, mis osalevad valgusünteesi translatsioonietapis.
Mis on aminoatsüül-tRNA?
Aminoatsüül-tRNA on tRNA molekul, mille otsas on üks aminohape. Tavaliselt seostub see ribosoomi A-saidiga. Aminoatsüül-tRNA koos konkreetsete elongatsioonifaktoritega toimetab spetsiifilise aminohappe ribosoomi, et see translatsiooni ajal polüpeptiidahelasse lülitada. Igal aminohappel on oma spetsiifiline aminoatsüül-tRNA süntetaasi ensüüm. Aminohapped kasutavad seda ensüümi spetsiifilise tRNA-ga keemiliseks sidumiseks. tRNA seondumine selle sugulasaminohappega on ülioluline. See tagab, et valgusünteesi käigus kasutatakse ainult spetsiifilist aminohapet, mis ühtib tRNA antikoodoniga. Translatsioonivigade vältimiseks on aminoatsüül-tRNA süntetaasi ensüümil korrektuurivõime. Õige tRNA molekuliga misatsüülitud aminohapped läbivad tavaliselt hüdrolüüsi. Seda teostab aminoatsüül-tRNA süntetaasi ensüümi deatsüülimismehhanism. Lisaks tuleks valesti laetud tRNA-d hüdrolüüsida, et vältida valkude ebaõiget sünteesi.
Joonis 01: Aminoatsüül-tRNA
Lisaks valkude sünteesi funktsioonile võib aminoatsüül-tRNA toimida ka lipiidide modifitseerimiseks ja antibiootikumide biosünteesiks vajalike aminohapete doonorina. Lisaks on mõistetav, et geeniklastrid võivad kodeeritud polüpeptiidide sünteesi reguleerimiseks kasutada aminoatsüül-tRNA-d.
Mis on peptidüüli tRNA?
Peptidüül-tRNA on tRNA molekul, mis on seotud ribosoomi P saidiga. Pärast initsiatsioonikompleksi korralikku moodustumist toimub translatsioon polüpeptiidi pikenemise teel. Ribosoomil on tRNA sidumiseks kolm kohta: P (peptidüül), A (aminoatsüül) ja E (olemas).
Joonis 02: Peptidüül-tRNA
Initsiaatormetionüül-tRNA on alati seotud P-kohaga. Järgmine aminoatsüül-tRNA seondub A saidiga elongatsioonifaktori (prokarüootidel EF-Tu ja eukarüootidel eEf-1α) ja GTP abil. Pärast seondumist vabaneb GDP (hüdrolüüsitud GTP) molekul. Hiljem moodustub peptiidside metionüül-tRNA P-kohas ja teise aminoatsüül-tRNA-saidis A-saidis. Seda reaktsiooni katalüüsib peptidüültransferaasi ensüüm. See reaktsioon kannab metioniini aminoatsüül-tRNA-sse A-kohas, moodustades seega peptidüül-tRNA. Veelgi enam, translokatsioonifaasis liigub peptidüül-tRNA pikenemisfaktorite (prokarüootides EFG ja eukarüootides eEf-2) ja GTP hüdrolüüsi abil ribosoomi P-saiti. Lisaks liigub laenguta tRNA esm alt ribosoomi E-saiti, seejärel lahkub protsessi lõpus E-saidist.
Millised on aminoatsüül-tRNA ja peptidüül-tRNA sarnasused?
- Aminoatsüül-tRNA ja peptidüül-tRNA on kahte tüüpi tRNA molekulid, mis osalevad translatsioonis.
- Mõlemad on tRNA molekulid, mis koosnevad ribonukleotiidalustest: adeniin, tsütosiin, guaniin ja uratsiil.
- Aminohapped on seotud mõlema molekuliga.
- Neil on oluline roll valgusünteesis.
- Mõlemad osalevad tõlke pikenemisetapil.
Mis vahe on aminoatsüül-tRNA ja peptidüül-tRNA vahel?
Aminoatsüül-tRNA on tRNA molekul, mis on seotud ribosoomi A saidiga, samas kui peptidüül-tRNA on tRNA molekul, mis on seotud ribosoomi P saidiga. Niisiis, see on peamine erinevus aminoatsüül-tRNA ja peptidüül-tRNA vahel. Lisaks on aminoatsüül-tRNA otsas üks aminohape, samas kui peptidüül-tRNA otsas on peptiidahel.
Allpool olev infograafik loetleb kõrvuti võrdlemiseks tabelina aminoatsüül-tRNA ja peptidüül-tRNA erinevused.
Kokkuvõte – aminoatsüül-tRNA vs peptidüül-tRNA
tRNA on molekul, mis aitab mRNA järjestust valguks dekodeerida. Aminoatsüül-tRNA ja peptidüül-tRNA on kahte tüüpi tRNA molekulid, mis osalevad translatsiooniprotsessis. Aminoatsüül-tRNA on seotud translatsiooniprotsessi käigus ribosoomi A-saidiga, peptidüül-tRNA aga translatsiooniprotsessi käigus ribosoomi P-saidiga. Seega võtab see kokku erinevuse aminoatsüül-tRNA ja peptidüül-tRNA vahel.
