Põhiline erinevus fükotsüaniini ja allofükotsüaniini vahel on see, et fükotsüaniin neelab ja kiirgab lühematel lainepikkustel kui allofükotsüaniinil.
Pükobiliproteiinid on vees lahustuvate valkude perekond, mida leidub tsüanobakterites ja teatud vetikaliikides. Fükotsüaniin ja allofükotsüaniin on selle perekonna kaks peamist liiget.
Mis on fükotsüaniin?
Phycocyanin on pigmendi-valgu kompleks valgust koguvate fükobiliproteiinide perekonnast. Teised selle perekonna olulised liikmed on allofükotsüaniin ja fükoerütriin. See pigment on klorofülli lisapigment. Üldiselt on kõik fükobiliproteiinid vees lahustuvad kompleksid, mis ei saa eksisteerida membraanides nagu karotenoidid. Membraanides esinemise asemel kipuvad need pigmendid agregeeruma, moodustades klastreid, mis võivad kleepuda fükobilisoomidena tuntud membraanidele.
Joonis 01: Ekstraheeritud fükotsüaniini pigmendid (tsüanobakteritest)
Võime täheldada, et fükotsüaniinil on iseloomulik helesinine värvus, mis võib neelata oranži ja punast valgust (620 nm lähedal) ning kiirata fluorestsentsi (umbes 650 nm). Seda värvipigmenti leiame tsüanobakterites ja nimi "Phycocyanin" pärineb kreekakeelsest tähendusest "Phyco", mis viitab "vetikatele" ja järelliide "tsüaniin" kreekakeelsest tähendusest "Kyanos", mis viitab "tumesinine".
Tavaliselt on fükotsüaniini molekulidel kõigi fükobiliproteiinidega ühine struktuur. Arvestades selle pigmendi struktuuri, algab see fükobiliproteiini monomeeride kokkupanemisest. Need monomeerid on heterodimeerid, mis koosnevad alfa- ja beeta-subühikutest koos nende vastavate kromofooridega. Kromofoorid ja subühikud on omavahel ühendatud keemilise tioeetersideme kaudu.
Pükotsüaniini struktuuri allüksused sisaldavad tavaliselt kaheksat alfa-heeliksit. Monomeerstruktuurid kipuvad spontaanselt agregeeruma, moodustades rõngakujulisi trimeere, millel on pöörlemissümmeetria ja keskne kanal. Lisaks kipuvad trimeerid paarikaupa agregeeruma, moodustades heksameere, mida abistavad täiendavad linkervalgud. Seetõttu sisaldab iga fükobilisoomi varras kahte või enamat fükotsüaniini heksameeri.
Mis on allofükotsüaniin?
Allofükotsüaniin on valgumolekul, mis pärineb fükobiliproteiinide perekonnast ja on klorofülli lisapigment. Teised selle valgust koguva fükobiliproteiini perekonna liikmed hõlmavad fükotsüaniin, fükoerütriin ja fükoerütrotsüaniin. Allofükotsüaniini pigmendid võivad neelata ja kiirata punast valgust ning leiame seda pigmenti kergesti sinivetikatest ja punavetikatest.
Joonis 02: Allofükotsüaniini välimus diagrammil
Saame isoleerida allofükotsüaniini erinevatest puna- või sinivetikaliikidest. Need vetikad toodavad molekuli veidi erinevaid vorme. Üldiselt sisaldab allofükotsüaniini molekul kahte erinevat subühikut, mida nimetatakse alfa- ja beeta-subühikuteks. Igal allüksusel on üks fükotsüanobiliini kromofoor.
Allofükotsüaniini rakendusi on erinevaid; paljud instrumendid on välja töötatud spetsiaalselt allofükotsüaniini jaoks. Näiteks kasutatakse seda komponenti tavaliselt immuunanalüüsides, sealhulgas FACS-is, voolutsütomeetrias jne.
Millised on fükotsüaniini ja allofükotsüaniini sarnasused?
- Fükotsüaniin ja allofükotsüaniin on vees lahustuvad valgud
- Mõlemad kuuluvad fükobiliproteiinide perekonda.
Mis vahe on fükotsüaniinil ja allofükotsüaniinil?
Pükobiliproteiinid on vees lahustuvate valkude perekond, mida leidub tsüanobakterites ja teatud vetikaliikides. Fükotsüaniin ja allofükotsüaniin on selle perekonna kaks peamist liiget. Peamine erinevus fükotsüaniini ja allofükotsüaniini vahel on see, et fükotsüaniin neelab ja kiirgab lühematel lainepikkustel kui allofükotsüaniin.
Allpool infograafikat on kõrvuti võrdlemiseks tabelina toodud rohkem erinevusi fükotsüaniini ja allofükotsüaniini vahel.
Kokkuvõte – fükotsüaniin vs allofükotsüaniin
Pükobiliproteiinid on vees lahustuvate valkude perekond, mida leidub tsüanobakterites ja teatud vetikaliikides. Fükotsüaniin ja allofükotsüaniin on selle perekonna kaks peamist liiget. Peamine erinevus fükotsüaniini ja allofükotsüaniini vahel on see, et fükotsüaniin neelab ja kiirgab lühematel lainepikkustel kui allofükotsüaniin.
