Peamine erinevus atsüülimise ja prenüülimise vahel seisneb selles, et atsüülimine viitab rasvhapete kovalentsele seondumisele valkudega, samas kui prenüülimine viitab prenüülrühmade kovalentsele seondumisele valkudega.
Translatsioonijärgsed modifikatsioonid on teatud tüüpi valgu modifikatsioonid, mis toimuvad pärast valkude esialgset sünteesi. Mehhanisme on mitut tüüpi. Atsüülimine ja prenüülimine on kahte tüüpi, mille puhul lipiidirühmade kovalentne kinnitumine muudab valke, et seostuda membraanidega nii rakusiseselt kui ka ekstratsellulaarselt. Prenüülimisel lisatakse valkudele prenüülrühmi, nagu farnesüül või geranüülgeranüül. Atsüülimisel seotakse rasvhapped kovalentselt valkudega. Atsüülimine ja prenüülimine toimuvad paljudes eukarüootsete rakkude valkudes. Selle tulemusena reguleerivad modifitseeritud valgud paljusid bioloogilisi teid, nagu membraanidega kaubitsemine, valkude sekretsioon, signaaliülekanne ja apoptoos.
Mis on atsüülimine?
Atsüülimine on rasvhapete kovalentne sidumine valkudega. Tegemist on translatsioonijärgse modifikatsiooniga. Atsüülimisel võivad sideme tüüp ja rasvhapete liik olla erinevad. Selle põhjal on kaks atsüülimise kategooriat: N-terminaalne müristoüülimine (N-atsüülimine) ja palmitoüülimine (S-atsüülimine).
Joonis 01: Atsüülimine
N-atsüülimine või N-terminaalne müristoüülimine on müristaadi, mis on 14 süsinikuaatomiga küllastunud rasvhape, kinnitumine N-terminaalse glütsiini jäägi külge amiidsideme kaudu. See on pöördumatu protsess. S-atsüülimine või palmitoüülimine seevastu on palmitiinhappe, mis on pika ahelaga küllastunud rasvhape, kovalentne sidumine tsüsteiinijäägiga tioestersideme kaudu. Palmitoüülimine on pöörduv translatsioonijärgne valgu modifikatsioon. Rasvade atsüülimine reguleerib rakusisest inimkaubandust, subtsellulaarset lokaliseerimist, valgu-valgu ja valgu-lipiidi interaktsioone.
Mis on prenüülimine?
Prenüülimine on valkude translatsioonijärgne modifikatsioon. See hõlmab hüdrofoobse rühma lisamist valgule. Tavaliselt lisatakse sihtvalgu C-otsa tsüsteiinile kahte tüüpi prenüülrühmi, kas farnesüül- või geranüülgeranüülrühm. Kolm ensüümi katalüüsivad rakkudes prenüülimist. Need on farnesüültransferaas, Caax proteaas ja geranüülgeranüültransferaas.
Joonis 02: Prenyli grupp
Valkude prenüülimine toimub kolme etapi kaudu, alustades isoprenoidi kinnitumisest, millele järgneb C-terminaalse prenüleeritud tsüsteiini proteolüüs ja metüülesterdamine. Prenüülimine on oluline protsess valgu-valgu interaktsioonide ja valgu-membraani interaktsioonide vahendamisel.
Millised on atsüülimise ja prenüülimise sarnasused?
- Atsüülimine ja prenüülimine on kahte tüüpi translatsioonijärgseid modifikatsioone.
- Mõlemad protsessid muudavad valke hüdrofoobselt.
Mis vahe on atsüülimisel ja prenüülimisel?
Atsüülimine on müristaatrasvhapete kovalentne kinnitumine valgu N-terminaalse glütsiinijäägi ja palmitiinhappe tsüsteiinijäägi külge vastav alt amiidsideme ja tioestersideme kaudu. Prenüülimine on farnesüüli või geranüülgeranüüli kovalentne sidumine tsüsteiiniga spetsiifiliste valkude karboksü-otsas või selle lähedal tioeetersideme kaudu. Niisiis, see on peamine erinevus atsüülimise ja prenüülimise vahel.
All infograafika tabelites on rohkem erinevusi atsüülimise ja prenüülimise vahel.
Kokkuvõte – atsüülimine vs prenüülimine
Atsüülimine ja prenüülimine on kaks translatsioonijärgset valgu modifikatsiooni. Atsüülimine on rasvhapete kovalentne sidumine valkudega. Prenüülimine on prenüülrühmade lisamine valkudele. Nii rasvhapped kui ka prenüülrühmad on valkude hüdrofoobsed modifikaatorid. Atsüülimisel esindavad müristaat ja palmitaat kõige levinumaid rasvhappeid modifitseerivaid rühmi. Prenüülimisel toimivad modifikaatoritena farnesüül- või geranüülgeranüülrühmad. Rasvade atsüülimine reguleerib rakusisest inimkaubandust, subtsellulaarset lokaliseerimist, valgu-valgu ja valgu-lipiidide interaktsioone. Prenüülimine on oluline protsess valgu-valgu interaktsioonide ja valgu-membraani interaktsioonide vahendamisel. Seega on see atsüülimise ja prenüülimise erinevuse kokkuvõte.
