Struktuurse ja funktsionaalse genoomika peamine erinevus seisneb selles, et struktuurne genoomika uurib genoomide füüsilist olemust, sealhulgas genoomide järjestamist ja kaardistamist, samas kui funktsionaalne genoomika uurib genoomi ekspressiooni ja funktsiooni.
Genoomika on bioloogia valdkond, mis käsitleb elusorganismide genoomide struktuuri, organisatsiooni, funktsiooni, evolutsiooni ja kaardistamist. See hõlmab ka genoomide järjestamist, organismi poolt kodeeritud valkude komplekti määramist ning geenide ja ainevahetusradade toimimist organismis. Lihtsam alt öeldes on genoomika geenirühma ulatuslik uuring. Seetõttu viiakse uuringud läbi genoomi tasemel. Struktuurne genoomika ja funktsionaalne genoomika on genoomika kaks peamist haru. Struktuurne genoomika keskendub genoomi kogu geenikomplekti iseloomustamisele ja asukoha määramisele. Seevastu funktsionaalne genoomika keskendub funktsioonile ja omadusele.
Mis on struktuurigenoomika?
Struktuurigenoomika on genoomi füüsikalise olemuse uurimine. Seetõttu puudutab struktuurne genoomika peamiselt genoomide järjestamist ja kaardistamist. Organismi genoomide või valkude täieliku järjestuse määrab struktuurne genoomika. Geneetilised ja füüsilised kaardid koostatakse struktuurigenoomikas. Lisaks hõlmab struktuurne genoomika ka genoomi järjestamist ja iga genoomi geenide poolt kodeeritud valgu kolmemõõtmelise struktuuri määramist.
Mis on funktsionaalne genoomika?
Funktsionaalne genoomika on genoomika haru, mis tegeleb geenide ekspressiooni ja nende funktsioonidega. See puudutab ka geeniekspressiooni ja metaboolsete radade mustrit. Funktsionaalne genoomika kasutab geenide funktsioonide ja interaktsioonide kirjeldamiseks tohutut hulka genoomiprojektide käigus saadud andmeid.
Geeni funktsioonide määramisel analüüsitakse genoomikas ka transkriptsiooni ja translatsiooni. Ekspressiooniprofiilide koostamine analüüsib, millal ja kus konkreetseid geene ekspresseeritakse. Spetsiifiliste geenide funktsioonide määramine toimub soovitud geenide valikulise muteerimisega.
Millised on struktuurse ja funktsionaalse genoomika sarnasused?
- Struktuurne ja funktsionaalne genoomika on genoomika kaks peamist haru.
- Mõlemad uuringud keskenduvad genoomide erinevatele aspektidele.
Mis vahe on struktuursel ja funktsionaalsel genoomikal?
Struktuurigenoomika on uuring, mis püüab järjestada kogu genoomi ja kaardistada genoomi, samas kui funktsionaalne genoomika on uuring, mis püüab määrata kõigi organismi genoomi poolt kodeeritud geeniproduktide funktsiooni. Seetõttu on struktuurne genoomika peamiselt seotud genoomi sekveneerimise ja kaardistamisega, funktsionaalne genoomika aga peamiselt genoomi ekspressiooni ja funktsiooni uurimisega. Niisiis, see on peamine erinevus struktuurse ja funktsionaalse genoomika vahel. Lisaks määrab struktuurne genoomika genoomi füüsilise olemuse, funktsionaalne genoomika aga kõigi geenide ekspressiooni ja nende funktsioonid.
All infograafika näitab üksikasjalikum alt struktuurse ja funktsionaalse genoomika erinevust.
Kokkuvõte – struktuurne vs funktsionaalne genoomika
Struktuurne ja funktsionaalne genoomika on genoomika kaks valdkonda. Struktuurigenoomika keskendub genoomide järjestamisele ja kaardistamisele. Genoomis kogu geenikomplekti sekveneerimisel ja asukoha määramisel püüab see kindlaks teha iga genoomi poolt kodeeritud valgu struktuuri. Funktsionaalne genoomika seevastu keskendub geenide ekspressioonile ning nende funktsioonidele ja omadustele. See püüab kindlaks teha geenide ja nende toodete koostoimeid. Seega võtab see kokku erinevuse struktuurse ja funktsionaalse genoomika vahel.
