Põhiline erinevus komposiit- ja mitteliittransposoonide vahel on see, et liittransposoonidel on kaks külgnevat sisestusjärjestust, samas kui mitteliittransposoonidel on külgnevate sisestusjärjestuste asemel ümberpööratud kordused.
A transposoon on DNA fragment, mis võib bakteri genoomis ümber paikneda. Need on liikuvad DNA järjestused. Nad liiguvad genoomi uutesse kohtadesse. Need liikumised muudavad bakteri genoomi järjestust, põhjustades olulisi muutusi geneetilises teabes. Need on ülekantavad geneetilised elemendid, mis vastutavad uute geneetiliste järjestuste loomise eest bakterites. Transposoone nimetatakse ka hüppegeenideks, kuna need hüppavad järjestused võivad blokeerida geenide transkriptsiooni ja korraldada ümber bakteri geneetilise materjali. Lisaks vastutavad nad ravimiresistentsuse, antibiootikumiresistentsuse geenide liikumise eest plasmiidide ja kromosoomide vahel. On kahte tüüpi transposoone, liit- ja mittekomposiitseid transposoone.
Mis on liittransposoonid?
Komposiittransposoon on DNA segment, mida ääristavad kaks sarnaste sisestusjärjestuse elementide koopiat. Komposiittransposoonis on keskne valku kodeeriv piirkond. Geenid on sageli antibiootikumiresistentsed geenid. Need võivad sisaldada ka kataboolseid geene. Lisaks koosnevad liittransposoonid kahest ümberpööratud kordusest.
Joonis 01: liittransposoon
Komposiittransposooni kogu pikkus liigub ühe tervikliku ühikuna. Tn10 on liittransposoon. See koosneb 6,5 kb pikkusest tsentraalsest kodeerivast piirkonnast (tetratsükliiniresistentne geen) ja 1,4 kb ümberpööratud sisestusjärjestuse elementidest mõlemas otsas.
Mis on mittekomposiittransposoonid?
Mittekomposiittransposoonid on teist tüüpi prokarüootsed transposoonid, millel ei ole kahest otsast külgnevaid sisestusjärjestusi. Sarnaselt komposiittransposoonidele on ka mitteliittransposoonidel geenid, mis kodeerivad antibiootikumiresistentsust. Veelgi enam, nende otstes on korduvad järjestused. Neid korduvaid järjestusi on vaja transponeerimiseks. Tn3 on mittekomposiitne transposoon. Tn3 mittekomposiittransposoonil on kolm geeni keskmises ja 38 aluspaari ümberpööratud terminaalsetes kordustes. Mittekomposiittransposoonide geenid võivad kodeerida virulentsust ja kataboolseid ensüüme, välja arvatud antibiootikumiresistentsus. Tn21 on teine mittekomposiittransposoon.
Millised on komposiit- ja mittekomposiittransposoonide sarnasused?
- Nii liit- kui ka mitteliittransposoonidel on antibiootikumiresistentsed geenid.
- Neil on ka ümberpööratud kordused.
- Lisaks on need liikuvad DNA segmendid; seega saavad nad genoomis liikuda.
Mis vahe on komposiit- ja mittekomposiittransposoonidel?
Komposiittransposoonid on teatud tüüpi transposoonid, millel on terminaalse sisestusjärjestuse elemendid ja keskne kodeeriv piirkond. Mittekomposiittransposoonid on teatud tüüpi transposoonid, millel puuduvad külgnevad sisestusjärjestuse elemendid. Need sisaldavad mõlemas otsas ainult ümberpööratud kordusi. Niisiis, see on peamine erinevus komposiit- ja mittekomposiittransposoonide vahel. Tn10 on liittransposon, samas kui Tn3 ja Tn21 on mitteliittransposoonid.
Allpool infograafikat võetakse kokku liit- ja mitteliittransposoonide erinevused.
Kokkuvõte – liit- ja mittekomposiittransposoonid
Komposiit- ja mitteliittransposoon on kahte tüüpi prokarüootsed transposoonid. Mõlemat tüüpi transposoonidel on keskne kodeerimispiirkond. Kuid komposiittransposoonidel on kaks külgnevat ümberpööratud sisestusjärjestuse elementi, samas kui mittekomposiittransposoonidel ei ole külgnevaid sisestusjärjestuse elemente. Selle asemel sisaldavad need ülevõtmiseks vajalikke korduvaid järjestusi. Seega on see peamine erinevus komposiit- ja mittekomposiittransposoonide vahel. Tn10 on liittransposon, samas kui Tn3 ja Tn21 on kaks mittekomposiittransposooni. Mõlemat tüüpi transposoonidel on geenid, mis kodeerivad antibiootikumiresistentsust ja kataboolseid ensüüme. Lisaks on neil terminali ümberpööratud kordused.
