Põhiline erinevus L- ja S-koronaviiruse vahel on see, et L-koronaviirusel on CT-haplotüüp, mille leutsiini koodon on T28, 144, samas kui S-koronaviirusel on TC-haplotüüp, mille seriini koodon on C28, 144.
Raske äge respiratoorne sündroom Koronaviirus 2 ehk SARS-CoV-2 on koroonaviirushaiguse COVID 19 põhjustaja. Varem oli viirus tuntud kui 2019. aasta uus koroonaviirus. See viirus on geneetiliselt tihed alt seotud koroonaviirusega, mis põhjustas 2003. aasta SARS-i puhangu. Seetõttu on uudne koroonaviirus saanud oma nime seose SARS-CoV-1 alusel. COVID 19 on hingamisteede haigus, mis levib piiskade ja füüsilise kontakti kaudu. COVID 19 levinumad sümptomid on palavik, kuiv köha, väsimus ja õhupuudus.
Hiina teadlased on välja selgitanud kaks SARS-CoV-2 tüve, mis levivad inimpopulatsioonis. Need on "L" ja "S" tüüpi. Need kaks tüve on üksteisega väga sarnased. L põlvkond on peamine (ligikaudu 70%), samas kui S on väike (umbes 30%). Nii L- kui ka S-liinidel on täielik seos kahe SNP vahel, mis asuvad asukohtades 8, 782 ja 28, 144.
Mis on L Coronavirus?
L koroonaviirus on üks kahest SARS-CoV-2 tüvest. On leitud, et see on levinud COVID 19 puhangu algstaadiumis Wuhanis. L koroonaviirus pärines vanemast S koroonaviirusest. See tüvi on agressiivsem ja põhjustab 70% COVID 19 juhtudest kogu maailmas.
Joonis 01: SARS-CoV-2
L liinil on täielik seos kahe SNP vahel asukohas 8, 782 (orf1ab: T8517C, sünonüüm) ja 28, 144 (ORF8: C251T, S84L). Sellel on "CT" haplotüüp, kuna T28, 144 asub leutsiini koodonis. Lisaks oli L-liinil kogunenud oluliselt suurem arv tuletatud mutatsioone kui S-liinil.
Mis on S-koronaviirus?
S koroonaviirus on SARS-CoV-2 teine põlvnemine. See on vanem versioon. Arvatakse, et L-tüüp on tuletatud S-tüübist. S koroonaviirus moodustab ligikaudu 30% COVID-i juhtudest. S-tüüpi tüved nakatavad uusi patsiente pidev alt, kuna haigus on kergem ja inimesed kannavad seda enne ravimite võtmist kauem. Seetõttu suurendab see edasikandumise ohtu. Sarnaselt L-liiniga näitab S-liini täielik seos kahes SNP-s. Veelgi enam, sellel on TC haplotüüp, millel on seriini koodon C28, 144.
Millised on L ja S koroonaviiruse sarnasused?
- SARS-CoV-2 on arenenud kaheks suureks liiniks, mida tuntakse “L” ja “S” tüüpidena.
- Terve genoomi võrdlused kinnitavad veelgi L- ja S-liinide eraldamist
- Need tüved näitavad, et viirus muteerub.
- Nii L- kui ka S-koronaviirused näitavad täielikku sidet SNP-des asukohas 8, 782 (orf1ab: T8517C, sünonüüm) ja 28, 144 (ORF8: C251T, S84L).
- Kahel liinil võib edastus- või replikatsioonikiirus olla erinev.
Mis vahe on L ja S koroonaviirusel?
L ja S koroonaviirused on kaks SARS-CoV-2 tüve. L-koronaviirus on levinum tüvi, mis on üks kahest SARS-CoV-2 tüvest. S-koroonaviirus on SARS-CoV-2 vähem tõsine tüvi. Niisiis, see on peamine erinevus L- ja S-koronaviiruse vahel. L-koronaviirus põhjustab umbes 70% juhtudest, S-koronaviirus aga umbes 30% juhtudest.
Lisaks on L- ja S-koronaviiruse teine erinevus see, et L-liinil on CT-haplotüüp, S-liinil aga TC-haplotüüpi.
Allpool toodud infograafikul on toodud rohkem erinevusi L ja S koroonaviiruse vahel.
Kokkuvõte – L vs S koroonaviirus
L ja S on kaks SARS-CoV-2 tüve. Nad on üksteisega sarnasemad. Kuid L-koroonaviirus on levinum ja põhjustab enam kui 70% juhtudest, samas kui S-koronaviirus põhjustab umbes 30% juhtudest. Veelgi enam, L-liinil on CT haplotüüp, S-liinil aga TC haplotüüp. S sugupuu on evolutsiooniline rohkem seotud loomade koronaviirustega. L-liinil oli seevastu kogunenud oluliselt suurem arv tuletatud mutatsioone kui S-liinil. Seega võtab see L- ja S-koronaviiruse erinevuse kokku.
