Põhiline erinevus lincRNA ja lncRNA vahel on RNA pikkus. See on; lincRNA-d on RNA pikad ahelad, samas kui lncRNA-d on suhteliselt lühikesed RNA ahelad.
RNA ehk ribonukleiinhape on oluline biomolekul, millel on erinevad funktsioonid. RNA osas tehakse palju uusi avastusi. lincRNA ja lncRNA on kaks sellist uut avastust. lincRNA tähistab Long Intergenic mittekodeerivat RNA-d. Need on pikad RNA transkriptid, mis esinevad imetajate genoomis. Tundub, et need aitavad kaasa rakkude diferentseerumisele ja raku identiteedile. Võrdluseks, lncRNA või pikk mittekodeeriv RNA on RNA transkriptid, mis ei ole pikemad kui lincRNA ja nad ei kodeeri valke.
Mis on lincRNA?
LincRNA ehk pikk intergeenne mittekodeeriv RNA on suurim RNA klass, mida leidub enamikus imetajate genoomis, sealhulgas inimese genoomis. Need on väga suured ja pikad RNA transkriptid. Samuti on lincRNA-l polüA signatuursabad ja see on kasulik funktsioon nende tuvastamisel. Veel üks viis nende tuvastamiseks on järjestamine. Praegu toimuvad nende lincRNA-de tuvastamiseks genoomi hõlmavad assotsiatsiooniuuringud.
Joonis 01: RNA keemiline struktuur
LincRNA põhifunktsioon on geenispetsiifiline transkriptsioon. Need toimivad transkriptsiooni ajal reguleerivate elementidena. Nad on seotud ka basa altranskriptsiooni reguleerimise masinatega. lincRNA mängib olulist rolli translatsioonijärgsetes modifikatsioonides, mis hõlmavad RNA splaissimist. Lisaks toimivad nad splaissimise ajal vahemolekulidena.
Mis on lncRNA?
Pikk mittekodeeriv RNA või lncRNA on mittekodeeriv RNA transkriptsioon. Need on ligi 200 nukleotiidi pikad. Nende suurus on lncRNA oluline tunnus. Mõnikord nimetatakse neid ka rämps-RNA-ks. LncRNA-d on neli peamist tüüpi: intergeenne lncRNA, introniline lncRNA, senss-lncRNA ja antisenss-lncRNA. Need tüübid viivitavad oma transkriptsioonimehhanisme.
LncRNA põhifunktsiooni pole veel konkreetselt välja selgitatud. Kuid teadlased usuvad, et neil on vähi mehhanismis suur roll, kuna need mõjutavad vähi transkriptsioonimehhanismi. Samuti on neil resistentsus apoptoosi suhtes, angiogeneesi esilekutsumine, metastaaside soodustamine ja kasvaja supressorite vältimine.
Millised on lincRNA ja lncRNA sarnasused?
- lincRNA ja lncRNA on kahte tüüpi RNA-d, mis koosnevad ribonukleotiididest.
- Need on üheahelalised jadad.
- Mõlemad näitavad funktsioone transkriptsioonimehhanismides.
- Lisaks on need mittekodeerivad RNA-d.
- Mõlemad moodustavad teisese struktuuri.
- Lisaks näitavad nad koespetsiifilist väljendust.
Mis vahe on lincRNA ja lncRNA vahel?
lincRNA viitab pikale intergeenilisele mittekodeerivale RNA-le, samas kui lncRNA viitab pikale mittekodeerivale RNA-le. lincRNA esindab kõige pikemat RNA rühma, mis ei kodeeri. Teisest küljest esindab lncRNA teist pikka RNA rühma, millel on ligikaudu 200 nukleotiidi ja mis on lühemad kui lincRNA. Tegelikult moodustab lincRNA lncRNA. Seega on lincRNA ja lncRNA peamine erinevus iga RNA pikkus. See on; lincRNA on pikem kui lncRNA. Veel üks erinevus lincRNA ja lncRNA vahel on see, et lincRNA esineb imetaja genoomis ja asub tuumas, samas kui lncRNA-d on RNA transkriptid, mis asuvad väljaspool tuuma.
Kokkuvõte – lincRNA vs lncRNA
lincRNA ja lncRNA on kaks uudset RNA tüüpi. lincRNA tähistab pikka intergeenset mittekodeerivat RNA-d ja need on pikim RNA, mis on inimese genoomis. Teisest küljest on lncRNA või pikk mittekodeeriv RNA teist tüüpi RNA, mis on RNA transkript. Siiski on lncRNA-d lühemad kui lincRNA-d. Lisaks sisaldavad nad oma järjestustes umbes 200 nukleotiidi. Mõlemad uudsed RNA tüübid mängivad transkriptsioonimehhanismides olulist rolli. Samuti mängivad nad suurt rolli translatsioonijärgsetes modifikatsioonides. Mõlemat RNA tüüpi saab tuvastada sekveneerimise teel. See on kokkuvõte lincRNA ja lncRNA erinevusest.
