Põhierinevus oligopeptiidi ja polüpeptiidi vahel on see, et oligopeptiidid sisaldavad vähe aminohappejääke, samas kui polüpeptiidid sisaldavad palju aminohappejääke.
Terminad oligopeptiidid ja polüpeptiidid kuuluvad valkude kategooriasse. Peptiidid on aminohapete lühikesed ahelad. Aminohapped seostuvad üksteisega peptiidsidemete kaudu. Seetõttu saame need peptiidid kategoriseerida nendes peptiidides sisalduvate aminohapete arvu järgi. Nt dipeptiidid, tripeptiidid, tetrapeptiidid, oligopeptiidid ja polüpeptiidid.
Mis on oligopeptiid?
Oligopeptiid on aminohapete ahel, mis sisaldab väikese arvu aminohappeid molekuli kohta. Me nimetame neid molekule sageli üldmõistena "peptiidideks". Nendes peptiidimolekulides esinevate aminohappejääkide arv võib olla vahemikus kaks kuni kakskümmend aminohapet. Oligopeptiidid võivad hõlmata ka mõningaid väikeseid peptiidivorme, nagu dipeptiidid, tripeptiidid jne. Mõned levinud näited looduslikult esinevatest oligopeptiididest on näiteks mikroviridiin, tsüanopeptoliinid, mikrotsüstiinid jne.
Joonis 01: Tripeptiidi struktuur
Neid oligopeptiide toodavad mitteribosomaalsed peptiidide süntaasid ehk NRPS. Kuid on ka erandeid. Näiteks tsüklamiide ja mikroviridiini sünteesitakse ribosoomiliste radade kaudu. Oligopeptiidide eraldamise protsess hõlmab oligopeptiidide rikastamist, puhastamist ja identifitseerimist. Identifitseerimisprotsessiks saame kasutada geelkromatograafiat, HPLC-d, HPLC-massispektroskoopiat, ioonvahetuskromatograafiat jne.
Mis on polüpeptiid
Polüpeptiid on aminohappejääkide ahel, mis sisaldab suurt hulka aminohappeid. Valk sisaldab ühte või mitut polüpeptiidahelat. Nendes polüpeptiidahelates on aminohapped omavahel seotud peptiidsidemete kaudu, mis on kovalentsete keemiliste sidemete tüüp. Iga polüpeptiidahel sisaldab kahte otsa: N-terminaalne ja C-ots. N-ots on aminoots, mis lõpeb vaba aminorühmaga, samas kui C-ots on karboksüülots, mis lõpeb vaba karboksüülrühmaga. Peptiidis sisalduvate aminohapete järjestuse määravad mRNA koodonid, mis osalevad polüpeptiidi või valgu tootmises matriitsi ahela translatsiooni kaudu.
Vastav alt polüpeptiidide arvule ja paigutusele valguses on neli peamist valgustruktuuri tüüpi:
- Esmastruktuur – valgu esmane struktuur sisaldab ühte polüpeptiidahelat, millel on disulfiidsillad mõne samas ahelas oleva aminohappe vahel, mis moodustab volditud struktuuri.
- Sekundaarne struktuur – valgu sekundaarstruktuuril on kaks peamist vormi: alfa-heeliksi struktuur ja beeta-lehtstruktuur.
Joonis 02: Alfa-spiraali struktuur
- Tertsiaarne struktuur – see on väga volditud võrgustruktuur. See struktuur on väga oluline, kuna see määrab valgu funktsiooni.
- Kvaternaarne struktuur – see on kahe või kolme omavahel seotud polüpeptiidahela väga keeruline struktuur.
Mis vahe on oligopeptiidil ja polüpeptiidil?
Oligopeptiidid ja polüpeptiidid on kaks erinevat valgukategooriat. Need erinevad üksteisest sõltuv alt valgu molekulides sisalduvate aminohappejääkide arvust. Seetõttu on peamine erinevus oligopeptiidi ja polüpeptiidi vahel see, et oligopeptiidid sisaldavad vähe aminohappejääke, samas kui polüpeptiidid sisaldavad palju aminohappejääke.
Allpool olev infograafik võtab kokku erinevuse oligopeptiidi ja polüpeptiidi vahel.
Kokkuvõte – oligopeptiid vs polüpeptiid
Oligopeptiidid ja polüpeptiidid on kaks erinevat valgukategooriat. Need erinevad üksteisest sõltuv alt nendes valgu molekulides sisalduvate aminohappejääkide arvust. See tähendab, et peamine erinevus oligopeptiidi ja polüpeptiidi vahel on see, et oligopeptiidid sisaldavad vähe aminohappejääke, samas kui polüpeptiidid sisaldavad palju aminohappejääke.
