Polüpeptiid vs valk
Aminohape on lihtne molekul, mis moodustub C, H, O, N ja võib olla S. Sellel on järgmine üldstruktuur.
Seal on umbes 20 tavalist aminohapet. Kõikidel aminohapetel on süsinikuga seotud rühmad –COOH, -NH2 ja –H. Süsinik on kiraalne süsinik ja alfa-aminohapped on bioloogilises maailmas kõige olulisemad. R-rühm erineb aminohapete lõikes. Lihtsaim aminohape, mille R-rühm on H, on glütsiin. R-rühma järgi võib aminohappeid liigitada alifaatseteks, aromaatseteks, mittepolaarseteks, polaarseteks, positiivselt laetud, negatiivselt laetud, polaarseteks laenguta jne. Aminohapped esinevad tsvitterioonidena füsioloogilise pH 7,4 juures. Aminohapped on valkude ehitusplokid. Kui kaks aminohapet ühinevad dipeptiidiks, toimub kombinatsioon ühe aminohappe rühmas -NH2 teise aminohappe rühmaga -COOH. Veemolekul eemaldatakse ja moodustunud sidet nimetatakse peptiidsidemeks.
Polüpeptiid
Ahel tekib siis, kui suur hulk aminohappeid on omavahel ühendatud, seda nimetatakse polüpeptiidiks. Valgud koosnevad ühest või mitmest polüpeptiidahelast. Valgu primaarset struktuuri tuntakse polüpeptiidina. Polüpeptiidahela kahest otsast on N-ots, kus aminorühm on vaba, ja c-ots on see, kus karboksüülrühm on vaba. Polüpeptiide sünteesitakse ribosoomides. Aminohappejärjestus polüpeptiidahelas määratakse mRNA koodonitega.
Valk
Valgud on elusorganismide üks olulisemaid makromolekulitüüpe. Sõltuv alt nende struktuurist võib valgud liigitada primaarseteks, sekundaarseteks, tertsiaarseteks ja kvaternaarseteks valkudeks. Aminohapete (polüpeptiidi) järjestust valguses nimetatakse primaarseks struktuuriks. Kui polüpeptiidstruktuurid volditakse juhuslikesse paigutustesse, nimetatakse neid sekundaarseteks valkudeks. Tertsiaarsetes struktuurides on valkudel kolmemõõtmeline struktuur. Kui vähesed kolmemõõtmelised valgufragmendid on omavahel seotud, moodustavad nad kvaternaarsed valgud. Valkude kolmemõõtmeline struktuur sõltub vesiniksidemetest, disulfiidsidemetest, ioonsidemetest, hüdrofoobsetest interaktsioonidest ja kõigist muudest molekulidevahelistest interaktsioonidest aminohapete sees. Valgud mängivad elussüsteemides mitut rolli. Nad osalevad struktuuride moodustamises. Näiteks lihastes on valgukiude nagu kollageen ja elastiin. Neid leidub ka kõvades ja jäikades struktuuriosades, nagu küüned, juuksed, kabjad, suled jne. Lisaks leidub valke sidekudedes, näiteks kõhredes. Peale struktuurse funktsiooni on valkudel ka kaitsefunktsioon. Antikehad on valgud ja need kaitsevad meie keha võõrinfektsioonide eest. Kõik ensüümid on valgud. Ensüümid on peamised molekulid, mis kontrollivad kõiki metaboolseid aktiivsusi. Lisaks osalevad valgud raku signaaliülekandes. Valke toodetakse ribosoomidel. Valku tootv signaal edastatakse DNA geenidest ribosoomile. Vajalikud aminohapped võivad olla toidust või raku sees sünteesitud. Valkude denatureerimine põhjustab valkude sekundaarsete ja tertsiaarsete struktuuride lahtivoltimist ja desorganiseerumist. See võib olla tingitud kuumusest, orgaanilistest lahustitest, tugevatest hapetest ja alustest, pesuvahenditest, mehaanilistest jõududest jne.
Mis vahe on polüpeptiidil ja valgul?
• Polüpeptiidid on aminohappejärjestused, samas kui valke toodavad üks või mitu polüpeptiidahelat.
• Valkudel on suurem molekulmass kui polüpeptiididel.
• Valkudel on vesiniksidemed, disulfiidsidemed ja muud elektrostaatilised vastasmõjud, mis reguleerivad selle kolmemõõtmelist struktuuri erinev alt polüpeptiididest.
