Põhiline erinevus ferredoksiini ja rubredoksiini vahel seisneb selles, et ferredoksiini redokspotentsiaal on tunduv alt väiksem kui rubredoksiinil.
Nii ferredoksiin kui ka rubredoksiin on rauda sisaldavad valgud. Siiski võime leida ferredoksiini bakteriaalsetes vormides ja taimedes, kuna see on kloroplasti valk. Rubredoksiin on aga valk, mida leidub ainult bakterites ja arhees. Nendel kahel ühendil on väga sarnane struktuur.
Mis on Ferredoxin?
Ferredoksiin on rauda väävlit sisaldav valk. See osaleb elektronide ülekande vahendamises mitmesugustes metaboolsetes reaktsioonides. Need on väikesed vees lahustuvad valgud, mis esinevad kloroplastides. Selle valgu raua- ja väävliaatomid on paigutatud raud-väävli klastritesse. Need võivad elektronide vastuvõtmisel ja tühjendamisel toimida bioloogiliste kondensaatoritena. Siin muutub raua aatomite oksüdatsiooniaste +2-lt +3-le. Seetõttu toimivad nad bioloogilises keskkonnas toimuvates redoksreaktsioonides elektronide ülekandjatena. Võrreldes on selle valgu redokspotentsiaal madal. Ferredoksiini valgu molekul võib sisaldada kahte, kolme või nelja raua aatomit valgu molekuli kohta. Ferredoksiine on kolm levinumat tüüpi: Fe2S2 ferredoksiinid, Fe4S 4 ferredoksiine ja Fe3S4 ferredoksiine.
Ferredoksiini peamine roll on eraldada kloroplastis kõrge energiaga elektrone ja need valgud osalevad süsinikdioksiidi fikseerimiseks, nitriili redutseerimiseks, sulfiidi redutseerimiseks, glutamaadi sünteesiks, tsükliliseks elektronivooluks jne vajalike elektronide jaotamisel.
Mis on rubredoksiin?
Rubredoksiin on rauda sisaldav valk, mida leidub bakterites ja arhees. See on teatud tüüpi madala molekulmassiga valk (tavaliselt on valgud suure molekulmassiga ühendid). Kuid erinev alt ferredoksiinist ei sisalda rubredoksiini valk anorgaanilisi sulfiide. Rubredoksiini peamine roll on selles, et see osaleb bioloogilistes süsteemides toimuvates redoksreaktsioonides elektronide ülekandemehhanismides.
Arvestades rubredoksiini struktuuri, sisaldab see keskmist rauaaatomit, millel on peaaegu tetraeedriline geomeetria. Neli rühma, mis on selle rauaaatomiga seotud, on tsüsteiinijäägid. Enamik rubredoksiini valkudest on vees lahustuvad keemilised ühendid. Siiski on mõned lahustumatud liigid, mis eksisteerivad membraaniga seotud valkudena. Nt. Rubredoksiin-A.
Elektronide ülekandemehhanismi käigus muutub keskse rauaaatomi oksüdatsiooniaste +2-lt +3-le. Selle oksüdatsiooniastme muutuse tunneme kergesti ära, kuna värv muutub punasest värvituks. Selle muutumise ajal jääb metalliioon kõrge pöörlemissagedusega olekusse, kuna see aitab minimeerida valgu struktuurimuutusi. Tavaliselt on rubredoksiini redutseerimispotentsiaal suurem kui ferredoksiinil; see on vahemikus +50 mV kuni -50 mV.
Mis vahe on ferredoksiinil ja rubredoksiinil?
Ferredoksiin ja Rubredoksiin on valguühendid, mis sisaldavad komponentidena nii rauda kui ka väävlit. Peamine erinevus ferredoksiini ja rubredoksiini vahel on see, et ferredoksiinil on rubredoksiiniga võrreldes tunduv alt madalam redokspotentsiaal. Ferredoksiini redokspotentsiaal on umbes -420 mV ja rubredoksiini redokspotentsiaal on vahemikus -50 kuni +50 mV. Lisaks võib ferredoksiin sisaldada kahte, kolme või nelja rauaaatomit valgu molekuli kohta, kuid rubredoksiinis on üks keskne rauaaatom. Siiski on mõlemal molekulil rauaaatomite ümber väga sarnane tetraeedriline geomeetria.
Lisaks sisaldab ferredoksiin valgu molekuli komponendina anorgaanilist väävlit, kuid rubredoksiinis ei ole anorgaanilist väävlit. Esinemist arvesse võttes võib ferredoksiini esineda nii bakterivormides kui ka taimedes, kuid rubredoksiini esineb bakterites ja arhees.
Altoodud tabel võtab kokku erinevuse ferredoksiini ja rubredoksiini vahel.
Kokkuvõte – Ferredoxin vs Rubredoxin
Ferredoksiin ja Rubredoksiin on valguühendid, mis sisaldavad komponentidena nii rauda kui ka väävlit. Peamine erinevus ferredoksiini ja rubredoksiini vahel on see, et ferredoksiinil on rubredoksiiniga võrreldes tunduv alt madalam redokspotentsiaal.