Põhierinevus – 16s rRNA vs 16s rDNA
Ribosoomid on kõigi elusorganismide valgusünteesi bioloogilised kohad. Ribosoomid sisaldavad kahte komponenti; väike allüksus ja suur allüksus. Prokarüootsed organismid ja eukarüootsed organismid erinevad neis sisalduva ribosoomi koostise poolest. Iga subühik koosneb ribosomaalsest RNA-st ja erinevatest valkudest. Need kaks alaühikut sobivad kokku ja töötavad valgusünteesi ajal ühena. Prokarüootsed ribosoomid on 70S ja need koosnevad 30S väikesest subühikust ja 50S suurest subühikust. Eukarüootsed ribosoomid on 80S ja koosnevad väikesest 40S ja suurest subühikust 60S. Prokarüootides tuntakse ribosoomide väikese subühiku ribosomaalset RNA-d kui 16s rRNA-d. See 16s rRNA transkribeeritakse kromosomaalsest DNA-st, mis on tuntud kui 16s rDNA. 16s rDNA on geen, mis toodab transkriptsiooni teel 16s rRNA-d. Peamine erinevus 16s rRNA ja 16s rDNA vahel on see, et 16s rRNA on transkribeeritud üheahelaline ribosomaalne RNA, mis on prokarüootide väikese subühiku komponent, samas kui 16s rDNA on kaheahelaline kromosomaalne DNA või geen, mis kodeerib 16s rRNA-d.. 16s rRNA geen on 16s rDNA.
Mis on 16s rRNA?
rRNA on ribosoomide komponent. 16s rRNA on prokarüootse ribosoomi 30S väikese subühiku spetsiifiline komponent, mis seondub Shine-Dalgarno järjestusega. See 16s rRNA järjestus näitab bakteriliikide vahel suurt varieeruvust. Seetõttu saab seda kasutada bakterite fülogeneesis ja taksonoomias.
Mis on 16s rDNA?
Prokarüootidel on 70S ribosoomid. Prokarüootsete ribosoomide väike subühik on 30S.30S väikese subühiku ribosomaalne RNA (rRNA) on tuntud kui 16s rRNA ja geen 16s rDNA kodeerib seda. Seega on 16s rDNA tuntud kui 16s rRNA geen. 16s rDNA on kromosomaalne DNA. See on kaheahelaline ja see on geen, mis koosneb kodeerivatest ja mittekodeerivatest piirkondadest. Kui 16s rDNA geen transkribeeritakse, toodab see 16s rRNA järjestust. 16s rDNA on universaalne DNA järjestus prokarüootides. Siiski on 16s rDNA järjestus prokarüootide seas erinev. See hõlbustab 16s rDNA järjestuse kasutamist bakteriliikide täpsel tuvastamisel ja ka uute bakteriliikide avastamisel.
16s rDNA mängib olulist rolli bakterite fülogeneesis ja taksonoomias. Seetõttu kasutatakse seda usaldusväärse molekulaarse markerina prokarüootide fülogeneetilistes uuringutes, kuna see on erinevate liikide vahel väga konserveerunud. 16s rDNA nukleotiidjärjestusel on üheksa hüpervarieeruvat piirkonda (V1-V9), mis on hea allikas bakterite ja arhee diferentseerumiseks.
Joonis 01: DNA ja RNA
16s rDNA geeni järjestamine on hõlbustanud bakterite ümberklassifitseerimist uuteks liikideks või perekondadeks. Seetõttu kasutatakse seda geeni molekulaarlaborites kõige tavalisema majapidamismarkerina mikroobide tuvastamiseks. On mitmeid põhjuseid, miks 16srDNA on mikroobide tuvastamisel parim marker, näiteks 16srDNA olemasolu kõigis bakterites, 16srDNA geeni funktsiooni muutumatu olemus aja jooksul ja 16srDNA suur suurus, mis muudab selle. piisav alt teavet.
Millised on sarnasused 16s rRNA ja 16s rDNA vahel?
- Mõlemad on nukleiinhapped.
- Mõlemad koosnevad nukleotiididest.
- Mõlemad on seotud ribosomaalse RNA-ga.
Mis vahe on 16s rRNA ja 16s rDNA vahel?
16s rRNA vs 16s rDNA |
|
| 16s rRNA on prokarüootide 30s ribosoomi väikese subühiku ribosomaalne RNA komponent. | 16s rDNA on kromosomaalne DNA, mis kodeerib prokarüootide 16s rRNA järjestust. |
| Kiudude arv | |
| 16s rRNA on üheahelaline. | 16s rDNA on kaheahelaline |
| Geen või järjestus | |
| 16s rRNA on geeni transkribeeritud RNA. | 16s rDNA on geen. |
| Kodeerimisjärjestus | |
| 16s rRNA-l on ainult kodeeriv järjestus. | 16s rDNA-l on nii kodeerivad kui ka mittekodeerivad ahelad. |
| Uracili alus | |
| 16s rRNA sisaldab oma nukleotiidjärjestuses Uratsiili aluseid. | 16s rDNA ei sisalda oma nukleotiidjärjestustes alust Uratsiili. |
| Thymin Base | |
| 16s rRNA ei sisalda oma nukleotiidjärjestuses tümiini aluseid. | 16s rDNA sisaldab oma nukleotiidjärjestuses tümiini aluseid. |
| Süntees | |
| 16s rRNA valmistatakse 16s rDNA geeni transkriptsioonil. | 16s rDNA on prokarüootide genoomis. |
Kokkuvõte – 16s rRNA vs 16s rDNA
16s rRNA on prokarüootide ribosoomide väikese subühiku ribosomaalne RNA komponent. Geen 16s rDNA kodeerib seda RNA järjestust. 16s rRNA on üheahelaline ja 16s rDNA on kaheahelaline. See on erinevus 16s rRNA ja 16s rDNA vahel.
Laadi alla PDF 16s rRNA vs 16s rDNA
Saate alla laadida selle artikli PDF-versiooni ja kasutada seda võrguühenduseta kasutamiseks vastav alt tsitaadi märkusele. Palun laadige PDF-versioon alla siit. Erinevus 16s rRNA ja 16s rDNA vahel
