Põhiline erinevus 16s ja 18s rRNA vahel on see, et 16s rRNA on prokarüootsete ribosoomide 30S subühiku komponent, samas kui 18s rRNA on eukarüootsete ribosoomide 40S subühiku komponent.
Ribosomaalne RNA ehk rRNA on ribosoomide struktuurne komponent. rRNA osaleb valgusünteesi mehhanismis. Eukarüootide ja prokarüootide ribosoomid on erinevad. Eukarüootidel on 80ndate ribosoomid, prokarüootidel aga 70ndate ribosoomid. Ka rRNA koostis varieerub kahe ribosoomi vahel. Kui eukarüootse ribosoomi väikesed subühikud sisaldavad 18s rRNA-d, siis prokarüootse ribosoomi väikesed subühikud sisaldavad 16s rRNA-d.
Mis on 16s rRNA?
16srRNA või 16s ribosomaalne RNA on prokarüootse ribosoomi 30ndate alaühiku komponent. Seetõttu on see osa ribosoomi väikesest subühikust. 16s rRNA mängib olulist rolli translatsioonimehhanismi stabiliseerimisel koos ribosoomiga. 16s rRNA seondub translatsiooni algatamiseks prokarüootse mRNA särava Dalgarno järjestusega. Samuti seondub see 23s rRNA-ga, moodustades ribosoomi väikesed ja suured subühikud.
Joonis 01: 16s rRNA
16s rRNA geen esineb kõigi bakterite genoomis. See on pikk, spetsiifiline ja väga konserveerunud bakterigenoomi piirkond. Seetõttu on 16s rRNA piirkonna tuvastamine bakterites oluline samm bakterite fülogeneetilisel tuvastamisel. Sellega seoses saab konstrueerida universaalseid praimereid, et amplifitseerida 16s rRNA piirkonda, millele järgneb sekveneerimine.
Mis on 18s rRNA?
18s rRNA või 18s ribosomaalne RNA on osa eukarüootsest ribosomaalsest subühikust 40s. Seega on see eukarüootse ribosoomi väikese subühiku komponent. Ribosoomiga seotud 18s rRNA mängib eukarüootides olulist rolli translatsiooni initsiatsioonis.
Joonis 02: 18s rRNA
18s rRNA-d kodeeriv geen on 18s rRNA geen. Sellest geenist pärinev järjestus on oluline molekulaaranalüüsis, et rekonstrueerida organismide evolutsiooni ajalugu, kuna need on väga konserveerunud piirkonnad. 18s rRNA-l on kõrge eraldusvõime seente taksonoomilistes uuringutes, kus 18s rRNA sisemist transkribeeritud speisseri (ITS) piirkonda kasutatakse peamiselt seente mitmekesisuse uuringutes seente vöötkoodi markerina. ITS piirkonda kasutatakse enamasti metagenoomilises analüüsis.
Millised on 16. ja 18. aasta rRNA sarnasused?
- 16s ja 18s rRNA on osa ribosoomi väikesest subühikust.
- Tsütoplasmas leidub nii 16s kui 18s rRNA-d.
- Mõlemal on vastavad geenid kindla järjestusega.
- Lisaks on mõlemad tõlke algatamisel olulised.
- Neil on fülogeneetilises analüüsis oluline roll.
- Lisaks on need olulised liikide evolutsiooni ennustamisel.
Mis vahe on 16 ja 18 rRNA vahel?
16s RNA leidub komponendina prokarüootse ribosoomi 30. aastate alaühikus. 18s rRNA leidub eukarüootse ribosoomi 40s subühiku komponendina. Seega on see peamine erinevus 16s ja 18s rRNA vahel. 16s rRNA esineb prokarüootides, samas kui 18s rRNA esineb eukarüootides. Veelgi enam, geen, mis kodeerib 16s rRNA-d, on oluline bakteriliikide tuvastamisel ja taksonoomias, samas kui 18s rRNA geen on oluline seente tuvastamisel ja klassifitseerimisel.
Allpool olev infograafik esitab kõrvuti võrdlemiseks tabelina erinevusi 16s ja 18s rRNA vahel.
Kokkuvõte – 16s vs 18s rRNA
Ribosomaalne RNA või rRNA on ribosoomi struktuursed komponendid ja moodustavad ulatuslikke sekundaarstruktuure mRNA-de ja tRNA-de konserveerunud osade äratundmisel. 16srRNA on prokarüootse ribosoomi 30ndate alaühiku komponent. 18s rRNA on osa eukarüootse ribosoomi 40s subühikust. Niisiis, see on peamine erinevus 16s ja 18s rRNA vahel. Kuid mõlemad moodustavad osa ribosoomi väikesest subühikust. Geenid, mis kodeerivad nii 16s kui 18s rRNA-d, mängivad olulist rolli liikide fülogeneetilises analüüsis, kuna need geenid on väga konserveerunud.
