Põhiline erinevus ssRNA ja dsRNA vahel on see, et ssRNA-l on ainult üks RNA ahel, samas kui dsRNA koosneb kahest komplementaarsest siRNA või miRNA ahelast.
RNA ehk ribonukleiinhape on teatud tüüpi nukleiinhape, mis koosneb ribonukleotiididest. Üldiselt on RNA erinev alt DNA kaksikheeliksist üheahelaline molekul. B altimore'i viiruste klassifikatsioonis kuuluvad III, IV ja V rühma RNA viirused. Mõnel viirusel on ssRNA või üheahelaline RNA genoom. Seetõttu on nende genoom valmistatud ühest RNA ahelast. Lisaks on mõnel viirusel dsRNA või kaheahelaline RNA genoom. Seetõttu on nende genoom valmistatud kahest komplementaarsest RNA ahelast. Sahharoosi või tseesiumkloriidi tiheduse gradiendi tehnikaga saab eraldada ssRNA viirused ja dsRNA viirused. Kergemad osakesed on ssRNA viirused, samas kui tihedamad osakesed sisaldavad dsRNA-d.
Mis on ssRNA?
ssRNA tähistab üheahelalist RNA-d. Üldiselt on RNA üheahelaline. On viiruseid, millel on ssRNA genoom. Neid on kahte tüüpi: positiivne ja negatiivne tunne, mis põhineb RNA tajul või polaarsusel. Positiivse mõttes üheahelaline RNA käitub mRNA-na. Seega võib see muutuda otse valguks. Negatiivne ssRNA on komplementaarne mRNA-ga. Seega tuleks see RNA-st sõltuva RNA polümeraasi abil muuta positiivse sensuaalseks ssRNA-ks. Pärast seda võib see muutuda valguks.
Joonis 01: RNA viirused
B altimore'i klassifikatsioonis kuuluvad positiivse meelega ssRNA viirused IV rühma, negatiivsed ssRNA viirused aga V rühma. Sahharoosi või tseesiumkloriidi tiheduse gradientide korral sisaldavad kergemad osakesed ssRNA viiruseid.
Mis on dsRNA?
dsRNA tähistab kaheahelalist RNA-d. DsRNA-s on kaks komplementaarset RNA ahelat. Need ahelad on omavahel seotud, moodustades sidemeid komplementaarsete aluste vahel. Erinev alt ssRNA-st ei ole dsRNA pikk – see on lühike molekul. dsRNA moodustub, kui komplementaarsed DNA ahelad transkribeeritakse RNA-ks sümmeetrilise transkriptsiooni teel vastandlikelt promootoritelt. Veelgi enam, ssRNA võib moodustada ahelasiseseid topeltheeliksiid, mis on dsRNA-d komplementaarse aluste sidumise teel. dsRNA-d saab moodustada ka transposoonidest ja korduvatest geenidest tulenevate komplementaarsete ssRNA-de aluste sidumise teel.
Joonis 02: dsRNA viirus
Mõnel viirusel on dsRNA genoom. Nendel viirustel on lai peremeeste valik. Rotaviirused ja pikobirnaviirused on dsRNA viirused. Nende viiruste dsRNA genoom transkribeeritakse RNA-st sõltuva RNA polümeraasi abil mRNA-ks. Seejärel muunduvad mRNA molekulid viirusvalkudeks. Lisaks saab positiivse sensatsiooni RNA ahelat kasutada dsRNA genoomide tootmiseks uute viirusosakeste jaoks. B altimore'i klassifikatsioonis kuulub dsRNA III rühma. dsRNA viirused nakatavad kõiki organisme, sealhulgas imetajaid, baktereid, taimi ja seeni.
Väike segav RNA või siRNA on teatud tüüpi dsRNA, mis võib vallandada RNA interferentsi eukarüootides ja samuti interferooni reaktsiooni selgroogsetel.
Millised on ssRNA ja dsRNA sarnasused?
- On viirusi, millel on ssRNA ja dsRNA.
- Üheahelaline RNA molekul võib läbida komplementaarse aluspaarumise, moodustades ahelasiseseid kaksikheeliksiid, mis on dsRNA.
- Nii ssRNA kui ka dsRNA on valmistatud ribonukleotiididest, millel on neli alust; adeniin (A), tsütosiin (C), guaniin (G) või uratsiil (U), riboossuhkur ja fosfaatrühm.
Mis vahe on ssRNA ja dsRNA vahel?
Põhiline erinevus ssRNA ja dsRNA vahel on see, et ssRNNA-l on ainult üks ahel, samas kui dsRNA-l on kaks komplementaarset RNA ahelat, mis on omavahel seotud. Looduses leidub ssRNA-d rohkesti, samas kui dsRNA-d on vähem. B altimore'i klassifikatsioonis on ssRNA viirused IV ja V rühmas, dsRNA viirused aga III rühmas.
Allpool olev infograafik näitab tabeli kujul erinevust ssRNA ja dsRNA vahel.
Kokkuvõte – ssRNA vs dsRNA
Looduses leidub RNA-d üheahelalise molekulina, mis on volditud enda külge. mRNA on üheahelaline RNA molekul, mis muundub ribosoomidel valguks. Paljudel viirustel on RNA genoom. Mõnel viirusel on ssRNA genoomid, samas kui mõnel viirusel on dsRNA genoomid. dsRNA-l on kaks komplementaarset RNA ahelat, mis on omavahel seotud. Positiivne senss ssRNA toimib otseselt mRNA-na ja muundub viirusvalkudeks, samas kui negatiivse sensu ssRNA muundatakse RNA-sõltuva RNA polümeraasi toimel positiivse sensoorse ssRNA-ks ja transleeritakse seejärel valkudeks. RNA-st sõltuv RNA polümeraas transkribeerib dsRNA mRNA-ks ja seejärel muunduvad mRNA molekulid viirusvalkudeks. Seega võtab see kokku erinevuse ssRNA ja dsRNA vahel.
