Peamine erinevus – mall vs kodeerimisriba
Paljudes organismides toimib DNA teabehoidjana, RNA aga sõnumitoojana. RNA sünteesi protsessi DNA-st nimetatakse transkriptsiooniks, mis kontrollib geeniekspressiooni ja valkude tootmist paljudes bioloogilistes süsteemides. Selles protsessis antakse kahele DNA ahelale konkreetsed nimed, mis põhinevad nende osalusel. Malli ahel on DNA ahel, mis toimib RNA sünteesi mallina, samas kui teist ahelat nimetatakse kodeerivaks ahelaks. Peamine erinevus nende kahe ahela vahel on see, et matriitsi ahelal on RNA vastupidine alusjärjestus, samas kui kodeerival ahelal on sama RNA alusjärjestus (välja arvatud uratsiili asemel tümiin). Kõiki DNA ahelaid rakus ei transkribeerita RNA-ks. Transkriptsioon sünteesib kõiki RNA tüüpe, sealhulgas mRNA, tRNA, rRNA, snRNA, miRNA ja siRNA. Prokarüootide ja eukarüootide RNA transkriptsioonis on vähe erinevusi. Näiteks eukarüootides on transkriptsiooniprotsess palju keerulisem kui prokarüootides, kuna kaasatud on suur hulk transkriptsioonifaktoreid. Selle artikli eesmärk on aga väljendada erinevust malli ja kodeeriva ahela vahel.
Mis on Template Strand?
Malli ahel on DNA ahel, mis toimib RNA sünteesi matriitsina. RNA polümeraas loeb seda ahelat 3’st 5’ni.’Malli ahel ei osale kodeerimises, seetõttu nimetatakse seda mittekodeerivaks ahelaks. Matriitsi ahela nukleotiidjärjestus on komplementaarne mRNA molekuli ja kodeeriva ahelaga.
Mis on kodeerimisriba?
Kodeeriv ahel määrab RNA ahela järjestuse. Kodeerival ahelal on sama RNA nukleotiidjärjestus, välja arvatud Uratsiil tümiini asemel. Kodeerivat ahelat nimetatakse ka senssahelaks, kuna see määrab RNA järjestuse, mis lõpuks kodeeris teatud valgu aminohappejärjestust. See osa loeb režissööris 5' otsast 3' otsani. 5' ots sisaldab fosfaatrühma, mis on seotud 5' süsinikuaatomiga, samas kui 3' ots on seotud 3' süsinikuaatomiga või hüdroksüülrühmaga, kui see on DNA ahela lõpus.
Mis vahe on mallil ja kodeerimisribal?
Funktsioon:
Malli ahel: malliahel toimib RNA sünteesi mallina.
Kodeeriv ahel: kodeerival ahelal on sama järjestus äsja sünteesitud RNA-ga.
Teised nimed:
Malli ahel: malli ahelat nimetatakse ka antisenss-ahelaks või [-] ahelaks.
Kodeeriv ahel: kodeerivat ahelat nimetatakse sensoorseks ahelaks, [+] või mittemalliliseks ahelaks.
Alusjärjestus:
Malli ahel: malliahel on komplementaarne sünteesitava RNA-ga.
Kodeeriv ahel: RNA järjestus on võrdne kodeeriva DNA ahelaga, kus Uratsiili asemel on tümiin.
