Põhiline erinevus protomeeride ja kapsomeeride vahel seisneb selles, et protomeerid on oligomeersete valkude struktuuriüksused, samas kui kapsomeerid on üksikud valgud, mis koosnevad protomeeridest, mis on viiruse kapsiidi struktuursed alaühikud.
A viirus on rakusisene kohustuslik parasiit, mis on nakkav osake. Kapsiid on üks kahest viiruseosakese peamisest komponendist. See on valgukate, mis ümbritseb ja kaitseb viiruse genoomi. Kapsiid koosneb protomeeridest, mis on oligomeersete valkude struktuuriüksused. Kapsomeer on viiruse kapsiidi struktuurne alaühik ja see on mitme protomeeri agregaat ühikuna. Seega koonduvad protomeerid kapsomeeriks ja kapsomeerid kapsiidi moodustamiseks.
Mis on promootorid?
Protomeerid on oligomeersete valkude struktuuriüksused. Protomer sisaldab vähem alt kahte erinevat polüpeptiidahelat. Sagedamini sisaldavad need mitut polüpeptiidi. Viiruslikes kapsiidides kogunevad protomeerid ise, moodustades kapsomeerid, mis on kapsiidide morfoloogilised üksused. Protomeerid ühenduvad üksteisega kindlate sidemete kaudu ja monteerivad ise.
Joonis 01: Protomerid
Tubaka mosaiikviiruses agregeeruvad protomeerid, moodustades kahekihilise ketta, mis ümbritseb RNA genoomi. Seega moodustavad need tubaka mosaiikviiruse protomeerid lõpuks pika jäiga õõnsa toru, mis annab sellele spiraalse välimuse. Ikosaeedrilise sümmeetria korral agregeeruvad protomeerid viiest või kuuest kapsomeerist koosnevateks ühikuteks ja kondenseeruvad seejärel 20 võrdkülgse kolmnurga ja 20 tipuga küljeks.
Mis on kapsomeerid?
Kapsomeerid on viiruse kapsiidi struktuursed valgu subühikud. Need on ka viiruste morfoloogilised alaühikud. Struktuuriliselt on kapsiid kapsomeeride kogum. Igal kapsomeeril on mitu protomeeri, mis on üksteisega ise kokku pandud. Veelgi enam, kapsomeerid on kapsiidis paigutatud erinev alt, et anda viiruse kapsiidile kuju. Sellega seoses on spiraalne, ikosaeedriline ja kompleksne kolme tüüpi kapsomeeride paigutus viirustes. Kapsomeeride paigutus on aga iseloomulik konkreetsele viirusele. Kapsomeerid ühinevad üksteisega interkapsomeersete triplekside kaudu, mis koosnevad ühe valgu kahest koopiast ja ühest teise valgu koopiast.
Joonis 02: Kapsomeerid
Lisaks on igal viirusel piiratud arv kapsomeere. B-hepatiidi viirusel on ikosaeedriline kapsiid, mis sisaldab 180 kapsomeeri. Rekombinantsel adenoviirusel on kapsiid, mis sisaldab 252 kapsomeeri. Herpesviiruste kapsiidides on 162 kapsomeeri. Lisaks on enteroviiruse kapsiidis 60 kapsomeeri. Samuti on erinevate viiruste valgukestas erinev arv kapsomeere.
Kapsomeerid täidavad viirustes mitmeid funktsioone. Kapsomeerid kaitsevad viiruse genoomi füüsiliste, keemiliste ja ensümaatiliste kahjustuste eest. Lisaks on kapsomeerid olulised viiruse genoomi peremeesorganismi viimisel, adsorbeerudes kergesti peremeesraku pindadele.
Millised on protomeeride ja kapsomeeride sarnasused?
- Protomeerid ja kapsomeerid on valgustruktuurid.
- Protomeerid on kapsomeeride alaühikud, kapsomeerid aga viiruse kapsiidi allüksused.
- Nii protomeerid kui ka kapsomeerid saavad ise kokku panna.
Mis vahe on protomeeridel ja kapsomeeridel?
Protomeerid on struktuuriüksused, mis toodavad oligomeerseid valke, samas kui kapsomeerid on viiruse kapsiidide morfoloogilised üksused. Niisiis, see on peamine erinevus protomeeride ja kapsomeeride vahel. Lisaks agregeeruvad protomeerid kapsomeerideks, samas kui kapsomeerid agregeeruvad, moodustades kapsiidi.
Allpool toodud infograafik võtab kokku protomeeride ja kapsomeeride erinevused.
Kokkuvõte – promootorid vs kapsomeerid
Protomeerid on kapsomeeride subühikud, kapsomeerid aga viiruse kapsiidi valgu subühikud. Seega on kapsomeer protomeeride agregatsioon, samas kui kapsiid on kapsomeeride agregatsioon. Protomeeride või kapsomeeride paigutus annab konkreetsele viirusele kuju või sümmeetria. Kapsomeeride paigutuse põhjal on spiraalne ja ikosaeedriline kaks viirustes esinevat kuju või sümmeetriat. Niisiis, see võtab kokku erinevuse protomeeride ja kapsomeeride vahel.
