siRNA vs miRNA
RNA-d on väga olulised molekulid, mis aitavad üles ehitada organismide elu. Hiljuti on teadlased avastanud väikesed RNA-d, mida nimetatakse RNA interferentsiks või RNAi-ks, mis toimivad pärast transkriptsiooni ja kontrollivad geeniekspressiooni. Väikeste RNA-de kaks peamist tüüpi on mikro-RNA või miRNA ja väike segav RNA või siRNA. Need molekulid reguleerivad põhiliselt geeniekspressiooni, surudes maha sihtgeeni. Nii miRNA-l kui ka siRNA-l on väga sarnased biogeneesirajad, kuigi nende vahel on mõningaid erinevusi. MiRNA ja siRNA pärinevad dsRNA molekulidest. Küpsed miRNA-d on struktuurilt sarnased siRNA molekulidega.
miRNA
Mikro-RNA-d või miRNA-d on väikesed RNA-molekulid, mis vahendavad translatsioonilise geeniregulatsiooni viimast kontrolli. MiRNA dereguleerimine võib põhjustada vähki ja teiste haiguste arengut. Seetõttu on miRNA mittekodeerivas piirkonnas kodeeritud teabe õige reguleerimine paljudes raku põhiprotsessides väga oluline.
siRNA
siRNA-sid nimetatakse ka lühikeseks segavaks või vaigistavaks RNA-ks ja need koosnevad kaheahelalisest RNA-st, millel on 20–25 aluspaari. SiRNA peamine roll on segada komplementaarsete nukleotiidjärjestustega spetsiifiliste geenide ekspressiooni. siRNA koosneb lühikesest kaheahelalisest RNA-st, millel on fosforüülitud 5' otsad ja hüdroksüülitud 3' otsad kahe üleulatuva nukleotiidiga.
Mis vahe on siRNA ja miRNA vahel?
• miRNA tuleneb spetsiifilistest genoomsetest lookustest, siRNA aga mRNA-st, transposoonidest, viirustest või heterokromaatilisest DNA-st.
• MiRNA sünteesi töödeldakse pikematest eelkäija juuksenõela transkriptidest (primaarne tuuma miRNA järjestus RNaasi III endonukleaasi abil), samas kui siRNA sünteesi töödeldakse pikkadest bimolekulaarsetest RNA dupleksidest.
• Iga miRNA juuksenõela prekursormolekul toodab ühe miRNA dupleksi, samas kui iga siRNA prekursormolekul toodab mitu siRNA dupleksi.
• siRNA järjestused on harva konserveerunud, samas kui miRNA järjestused on hästi konserveerunud.
• Kõik siRNA-s olevad alused aitavad kaasa selle sihtmärgispetsiifilisusele, samas kui ainult 5' pool miRNA-st aitab kaasa selle sihtmärgi spetsiifilisusele.
• miRNA seondub sageli sihtmärk-transkriptide 3-tollise transleerimata piirkonnaga, samas kui siRNA-d moodustavad komplementaarse dupleksi kõikjal mööda sihtmärk-mRNA-d.
• miRNA määrab „heterovaigistamise“, samas kui siRNA kasutatakse „automaatseks vaigistamiseks“.
• miRNA toimib translatsiooni takistava signaalina, samas kui siRNA takistab tõlkimist füüsiliselt.
