Põhiline erinevus Rho-sõltuva ja Rho-st sõltumatu terminatsiooni vahel on see, et Rho-sõltuva terminatsiooni korral seondub Rho faktor transkriptiga ja lõpetab transkriptsiooni, lõhkudes matriitsi ja transkripti vahelised vesiniksidemed, samas kui Rho sõltumatu terminatsioon lõpetab transkriptsiooni juuksenõela silmuse struktuuri ja seejärel U-rikka piirkonna loomine ärakirjas.
Transkriptsioon on üks kahest geeniekspressiooni etapist. See on protsess, mis toodab geeni DNA järjestuses peidetud geneetilisest teabest mRNA järjestuse. Transkriptsioon toimub kolme etapi kaudu: initsiatsioon, pikenemine ja lõpetamine. RNA polümeraasi ensüüm seondub geeni promootorjärjestusega ja hakkab katalüüsima RNA ahela sünteesi. Kuni terminaatorjärjestuse leidmiseni lisab RNA polümeraas nukleotiide ja ehitab RNA ahela. Prokarüootides toimub lõpetamine kahe peamise lõpetamisstrateegia kaudu: Rho-st sõltuv lõpetamine ja Rho-st sõltumatu lõpetamine. Rho tegur on helikaasi aktiivsusega valk.
Mis on Rhost sõltuv lõpetamine?
Rho-sõltuv terminatsioon on üks kahest prokarüootides esinevast transkriptsiooni lõpetamise strateegia tüübist. Rho tegur on helikaasi aktiivsusega valk.
Joonis 01: Rhost sõltuv lõpetamine
Rho valk seondub RNA transkriptiga ja liigub mööda RNA polümeraasi 5’-3’ suunas, soodustades vesiniksidemete dissotsiatsiooni DNA matriitsi ja RNA transkripti vahel. Kui Rho faktor jõuab transkriptsioonimullini, tõmbab see DNA/RNA hübriidi laiali ja vabastab transkriptsioonimullist. Kui see juhtub, lõpetab see transkriptsiooni.
Mis on Rho sõltumatu lõpetamine?
Rho sõltumatu lõpetamine on teine strateegia, mis lõpetab prokarüootse transkriptsiooni. Tavaliselt on terminaatoripiirkonnal ümberpööratud kordusjärjestus. Vahetult pärast ümberpööratud kordusjärjestust on adeniinirikas piirkond (AAAA). Kui RNA polümeraas liigub edasi, toodab see mRNA järjestuse. Kuna need kaks piirkonda on ümberpööratud kordusjärjestuse piirkonnas komplementaarsed, moodustab see vesiniksideme tõttu juuksenõela silmuse struktuuri. Järgmine piirkond on U-rikas piirkond. Juuksenõela struktuur peatab RNA polümeraasi aktiivsuse.
Joonis 02: Rho sõltumatu lõpetamine
Lisaks on U-rikastes piirkondades nõrk interaktsioon ärakirja U-aluste ja malli A-aluste vahel. Need nõrgad adeniini-uratsiili sidemed destabiliseerivad DNA matriitsi ja RNA transkripti ning eraldavad üksteist. Lõpuks vabaneb transkriptsioon transkriptsiooni saidilt.
Millised on Rhost sõltuva ja Rho sõltumatu lõpetamise sarnasused?
- Rho-sõltuv ja Rho-st sõltumatu lõpetamine on kaks peamist prokarüootidel leitud lõpetamisstrateegiat.
- Mõlemad vormid vabastavad transkriptsiooni lõpetamiseks DNA mallist transkripti.
Mis vahe on Rhost sõltuval ja Rho sõltumatul lõpetamisel?
Rho-sõltuvat lõpetamist vahendab Rho valk, samas kui Rho-st sõltumatu lõpetamine toimub juuksenõela silmusstruktuuri moodustumise kaudu. Niisiis, see on peamine erinevus Rhost sõltuva ja Rho sõltumatu lõpetamise vahel. Lisaks kasutab Rho valk ATP energiat, samas kui Rho sõltumatu lõpetamine ei hõlma Rho valku ega kasuta ATP energiat. Seetõttu on see ka oluline erinevus Rho-st sõltuva ja Rho-st sõltumatu lõpetamise vahel.
Allpool olev infograafik näitab rohkem võrdlusi, mis on seotud erinevusega Rhost sõltuva ja Rho sõltumatu lõpetamise vahel.
Kokkuvõte – Rhost sõltuv vs Rho sõltumatu lõpetamine
Rho-sõltuv ja Rho-st sõltumatu terminatsioon on kaks peamist prokarüootides esinevat transkriptsiooni lõpetamise mehhanismi. Rho valk vastutab Rho-sõltuva terminatsiooni transkriptsiooni lõpetamise eest. Seevastu Rho sõltumatu lõpetamine toimub juuksenõela silmuse struktuuri moodustumise kaudu. Niisiis, see on peamine erinevus Rhost sõltuva ja Rho sõltumatu lõpetamise vahel.
