Põhiline erinevus aktivaatori promootori ja repressori vahel on nende funktsioon. Aktivaator hõlbustab transkriptsiooniprotsessi ülesreguleerimist, seondudes võimendajatega, samas kui promootor on koht, kus RNA polümeraas seondub ja toimub transkriptsiooni initsiatsioon, ning repressor reguleerib transkriptsiooni alla, seondudes summutitega.
Transkriptsioon on komplementaarse mRNA sünteesimine DNA matriitsi abil. Protsess toimub eukarüootidel tuumas, prokarüootides aga tsütoplasmas. Transkriptsioonil on kolm peamist etappi: initsiatsioon, pikenemine ja lõpetamine. Aktivaatorid ja repressorid reguleerivad transkriptsiooni initsiatsiooni, samas kui promootorid on olulised RNA polümeraasi sidumisel. RNA polümeraas on peamine ensüüm, mis vahendab transkriptsiooni.
Mis on aktivaator?
Aktivaator on transkriptsioonifaktor, mis seondub võimendaja piirkondadega, et reguleerida transkriptsiooni üles. Kui see on seotud, muutub see matriitsi ahela orientatsioonis, aktiveerides või ülesreguleerides transkriptsiooni. Lisaks soodustab see RNA polümeraasi seondumist promootorsaidiga, et algatada transkriptsioon.
Joonis 01: Aktivaator
Aktivaatorid on sageli valgumolekulid. Nad soodustavad geeniekspressiooni anaboolset rada. Aktivaatori funktsiooni täheldatakse valdav alt eukarüootse transkriptsiooni regulatsioonis.
Mis on edendaja?
Geeni promootorpiirkond on piirkond, kus toimub RNA polümeraasi sidumine transkriptsiooni alguses. Prokarüootide ja eukarüootide promootorpiirkonnad on erinevad. Promootori aktiveerimine on oluline samm transkriptsiooni kontrollimisel ja aktiveerimisel. Prokarüootsed promootorpiirkonnad asuvad transkriptsiooni alguskohast ülesvoolu -35 ja -10 piirkondades. -10 promootori piirkonda nimetatakse ka TATA-kastiks või pribnow-kastiks. Bakteriaalse RNA polümeraasi sigmafaktor tunneb ära promootori ja seondub, moodustades suletud promootorikompleksi. Järgmisena toimub topeltahelate lahtikerimine, mille tulemuseks on avatud promootori kompleks. Lõpuks lahkub RNA polümeraasi sigmafaktor, alustades transkriptsiooni.
Joonis 02: Promootor
Eukarüootides toimub promootori aktiveerimine mitme transkriptsiooni initsiatsioonifaktori kaudu. Eukarüootides on kahte peamist tüüpi promootoreid. Need on TATA-ta promootorid ja TATA-promootorid.
Mis on repressor?
Repressor on transkriptsioonifaktor, mis vähendab transkriptsiooniprotsessi, seondudes summuti piirkondadega. See takistab RNA polümeraasi seondumist promootoriga. See on raku mehhanismi võtmeüksus transkriptsiooni peatamiseks. Siin seostub repressor summuti piirkonnaga ja blokeerib transkriptsiooniprotsessi, vähendades kiirust ja peatades protsessi täielikult.
Joonis 03: Repressor
Transkriptsioonilised repressorid reageerivad välistele stiimulitele. See takistab ka aktivaatori promootorite seondumist promootori piirkondadega. Korepressorid on repressorite alamkategooria ja represseerivad transkriptsiooni initsiatsiooni histooni deatsetülaasi värbamise kaudu. Histooni deatsetülaas suurendab histooni valgu positiivset laengut. See tugevdab DNA ja histoonide vahelist koostoimet ning vähendab DNA ligipääsetavust transkriptsiooniks.
Millised on aktivaatori promootori ja repressori sarnasused?
- Aktivaatorid, promootorid ja repressorid osalevad transkriptsiooniprotsessis.
- Nende peamine roll on transkriptsiooni algatamise ajal.
- Lisaks toimivad need transkriptsiooni reguleerivate teguritena.
- Kõik hõlbustavad RNA polümeraasi täpset sidumist.
Mis vahe on aktivaatori promootoril ja repressoril?
Aktivaator hõlbustab transkriptsiooniprotsessi ülesreguleerimist, seondudes võimendajatega. Samal ajal seondub RNA polümeraas transkriptsiooni initsiatsiooni ajal promootori piirkonnaga. Arvestades, et repressor reguleerib transkriptsiooniprotsessi alla, seondudes summutitega. Seega on see peamine erinevus aktivaatori promootori ja repressori vahel. Lisaks on aktivaatorid ja repressorid sageli valgud, mis reguleerivad transkriptsiooni, samas kui promootor on DNA element, mis asub geeni ülesvoolu piirkondades. Lisaks võimendavad nii aktivaatorid kui promootorid transkriptsiooniprotsessi, samas kui repressorid pärsivad transkriptsiooniprotsessi.
Allpool olev infograafik esitab aktivaatori promootori ja repressori vahelised erinevused tabelina kõrvuti võrdlemiseks.
Kokkuvõte – aktivaator vs promootor vs repressor
Aktivaator, promootor ja repressor on transkriptsioonifaktorid, mis mõjutavad transkriptsiooni kiirust. Peamine erinevus aktivaatori promootori ja repressori vahel on see, et aktivaator hõlbustab transkriptsiooniprotsessi ülesreguleerimist, seondudes võimendajatega, samas kui promootor hõlbustab RNA polümeraasi seondumist transkriptsiooni initsiatsiooni ajal ja repressorid vähendavad transkriptsiooni, seondudes summutitega. Aktivaatorid ja repressorid on sageli valgumolekulid, mis seonduvad geeni regulatoorsete piirkondadega ja põhjustavad DNA orientatsioonimuutusi. Promootorid on saidid ülesvoolu. RNA polümeraasi sidumine toimub promootori saitidel. Niisiis, see on erinevus aktivaatori promootori ja repressori vahel.
