Põhiline erinevus genoomi ja genofondi vahel on see, et genoom viitab organismi kogu DNA-le, samas kui geenifond viitab ristuva populatsiooni ainulaadsete geenide täielikule komplektile.
Geen on pärilikkuse põhiline struktuuriüksus. Geenid edastatakse sugurakkude kaudu vanematelt järglastele. Samuti esinevad need organismi genoomis. Genoom on organismi DNA täielik komplekt. Geenivaramu on samuti sarnane termin. Kuid see esindab kõigi populatsioonis või liigis esinevate geenide kogumit. Erinev alt genoomist on genofond populatsiooni geenide segu. Seega esindab geenivaramu kõiki selles konkreetses populatsioonis esinevaid võimalikke alleele.
Mis on genoom?
Genoom on kogu organismis esinev DNA kogum. Lihtsam alt öeldes on genoom organismi täielik pärilikkusmaterjal. Genoom sisaldab kogu teavet, mida organism vajab toimimiseks. Eukarüootides asub genoom tuuma sees, prokarüootides aga hõljub genoom tsütoplasmas. Lisaks koosneb genoom peamiselt kodeerivast ja mittekodeerivast DNA-st. Samuti on genoomis olemas geenid ja see moodustab väikese protsendi kogu genoomist. Isegi geenides võib näha introneid, mis on mittekodeerivad järjestused. Geenidevahelised piirkonnad, promootorjärjestused, võimendajad ja regulatoorsed järjestused on muud tüüpi järjestused, mis esinevad organismi genoomis.
Joonis 01: Bakteri genoom
Inimestel esindab genoom 46 kromosoomi. See on täielikult DNA genoom. See sisaldab enam kui 3 miljardit aluspaari DNA-d. Enamikul elusorganismidel on DNA genoomid. Kuid on ka RNA genoome. Mõnel viirusel on RNA genoom.
Mis on geenivaramu?
Geenivaramu on populatsiooni või liigi geenide kogum. Seega on tegemist organismide rühma geenide seguga. See ei esinda ühte organismi. Tegelikult esindab genofond selle konkreetse populatsiooni organismide rühma ja alleele. Siin on alleelid geeni alternatiivsed vormid. Veelgi enam, geenivaramus kajastab populatsioonis kõiki võimalikke geenide vorme. Seetõttu võime defineerida terminit geenivaramu kui populatsiooni iga geeni olemasolevate variantide abstraktset kogumit.
Lisaks on igal alleelil sagedus geenivaramus. Seega saab alleeli sagedust kasutada ka evolutsiooni mõõduna. Pealegi on evolutsiooniliinis vaja tõsta soodsaid alleelide sagedusi geenivaramus, samas kõrvaldades se alt ebasoodsad alleelid.
Joonis 02: Geenivaramu
Lisaks on geenivoog ja geneetiline triiv kaks võimalikku asja, mis võivad geenivaramus aset leida. Siin viitab geenivoog geeni ülekandmisele populatsiooni ühest geenifondist sama liigi erineva populatsiooni teise geenifondi. Geneetiline triiv viitab populatsiooni genofondi juhuslikule muutumisele. Kuid mõlema mehhanismi tõttu võivad geenid liikuda geenivaramusse sisse ja se alt välja.
Aretuses ja taimede parendamises on genofond oluline kontseptsioon, kuna see juhendab aretajaid valima hübridiseerimiseks iduplasma.
Millised on genoomi ja genofondi sarnasused?
- Nii genoom kui ka genofond sisaldavad organismide geene.
- Samuti sõltuvad mõlemad ajas muutumisest.
- Pealegi on mõlemad mutatsioonide ja spetsifikatsiooni uurimisel olulised.
Mis vahe on genoomil ja genofondil?
Geenid on olulised, kuna need sisaldavad geneetilist teavet valkude tootmiseks. Organismide genoomid sisaldavad neid geene. Seega on genoom organismi DNA täielik komplekt, mis sisaldab organismi geneetilist teavet. Seevastu genofond on kogu populatsiooni alleelide kogum. Seetõttu sisaldab genofond populatsiooni geneetilist teavet. Seega on see peamine erinevus genoomi ja geenifondi vahel. See toob kaasa ka teise erinevuse genoomi ja geenifondi vahel. See tähendab, et kogu genoomi järjestamine ütleb meile, kuidas organismid on üksteisega geneetikaga seotud, samas kui geenivaramu aitab uurida populatsiooni arengut. Üldiselt esindab genoom üksikut organismi, genoom aga populatsiooni.
Kokkuvõte – genoom vs geenivaram
Genoom ja genofond on kaks terminit, mis tähistavad organismide geene. Genoom esindab kogu organismi DNA komplekti, samas kui geenivaramu esindab populatsiooni iga geeni kõiki võimalikke alleele. Seega on see peamine erinevus genoomi ja geenifondi vahel. Lisaks hõlmab populatsioon kõiki probleemseid indiviide; seega on alleelil sagedus genofondis. Samuti võivad geenides esineda mutatsioonid; eriti alleelides ja mõned soodsad alleelid jäävad geenifondi, samas kui mõned ebasoodsad ja muteerunud alleelid elimineeruvad geenifondist. Seega on alleeli sagedus populatsiooni arengu hea mõõt. Sarnaselt sellele hõlmab genoom ka organismide evolutsiooni. Seoses oma tähtsusega aitavad genoomid mõista, kuidas organismid on omavahel geneetiliselt seotud, samas kui geenifondid on sordiaretuses taimede parandamiseks olulised.
