Peptiid vs valk
Aminohappeid, peptiide ja valke nimetatakse sageli seotud terminiteks, kuid need on oma omaduste poolest erinevad. Aminohapped on nii peptiidide kui ka valkude ehitusplokid. Aminohape on väike molekul, mis sisaldab aminorühma (-NH2) ja karboksüülhapperühma (-COOH), mis on seotud tsentraalse süsinikuaatomiga koos täiendava vesiniku ja külgahel (R-rühm). See kõrvalahel varieerub kõigi aminohapete vahel; seega määrab see iga aminohappe unikaalsed märgid ja keemia. Nii peptiidide kui ka valkude aminohappejärjestuse määramiseks kasutatakse kindlat geenijärjestust.
Peptiid
Peptiidid koosnevad kahest või enamast aminohappest, mis on omavahel seotud peptiidsidemetega ja esinevad lineaarsete ahelatena. Peptiidi pikkuse määrab selles sisalduvate aminohapete hulk. Tavaliselt on peptiidi pikkus vähem kui ligikaudu 100 aminohapet.
Eesliiteid kasutatakse peptiidide tüübi kirjeldamiseks üldterminoloogias. Näiteks kui peptiid on valmistatud kahest aminohappest, nimetatakse seda dipeptiidiks. Niimoodi kombineeritakse kolm aminohapet, et saada tripeptiide, neli aminohapet kombineeritakse tetrapeptiidide saamiseks jne. Peale nende tüüpide on veel oligopeptiide (koosnevad 2-20 aminohappest) ja polüpeptiide, millel on palju peptiide (vähem kui 100). Peptiidide olulisemad iseloomulikud tunnused määratakse aminohapete koguse ja järjestusega.
Enamiku peptiidide esmane ülesanne on võimaldada tõhusat suhtlust, kandes biokeemilisi sõnumeid ühest kehakohast teise.
Valk
Valgud on kõige mitmekesisem bioloogiliste makromolekulide rühm. Valk koosneb ühest või mitmest pikast hargnemata ahelast, mida nimetatakse polüpeptiidideks, kuid valkude ehitusplokkideks on aminohapped. Aminohapete järjestus määrab valgu peamised omadused, samas kui selle aminohappejärjestuse määrab konkreetne geenijärjestus.
Tavaliselt on valkudel stabiilne kolmemõõtmeline struktuur. Neid struktuure saab arutada nelja tasandi hierarhias; esmane, sekundaarne, tertsiaarne ja kvaternaarne. Esmane struktuur on valgu aminohapete järjestus. Sekundaarne struktuur saadakse vesiniksidemete moodustamisel kahe lähedalasuva aminohappe vahel, mille tulemuseks on struktuurid, mida nimetatakse β-plaaditud lehtedeks ja mähised, mida nimetatakse α-heeliteks. Sekundaarse struktuuriga piirkonnad volditakse seejärel ruumis edasi, et moodustada valgu lõplikud kolmemõõtmelised struktuurid. Mitme polüpeptiidi paigutus ruumis annab tulemuseks valgu kvaternaarse struktuuri.
Valkude peamised funktsioonid on ensüümkatalüüs, kaitse, transport, tugi, liikumine, reguleerimine ja säilitamine.
Mis vahe on peptiidil ja valgul?
• Peptiidid on aminohapete lühikesed lineaarsed ahelad, samas kui valgud on väga pikad aminohapete ahelad.
• Mitmed aminohapped on omavahel seotud, moodustades peptiidsidemetega peptiidi, samas kui mitmed peptiidid on omavahel seotud, et moodustada valgumolekule.
• Tavaliselt on valkudel stabiilne kolmemõõtmeline struktuur. Seevastu peptiidid ei ole organiseeritud stabiilsesse kolmemõõtmelisse struktuuri.
• Peptiidi pikkus on vähem kui ligikaudu 100 aminohapet, samas kui valgu pikkus on üle 100 aminohappe. (On erandeid; seega sõltuvad erinevused pigem molekulide funktsioonist kui nende suurusest)
• Erinev alt peptiididest peetakse valke makromolekulideks.
• Peptiidides moodustavad vesiniksidemeid ainult aminohapete külgahelad. Valkudes aga ei moodusta vesiniksidemeid mitte ainult kõrvalahelad, vaid ka peptiidrühmad. Need vesiniksidemed võivad olla veega või teiste peptiidrühmadega.
• Kõik peptiidid eksisteerivad lineaarsete ahelatena, samas kui valgud võivad eksisteerida primaarsete, sekundaarsete, tertsiaarsete ja kvaternaarsetena.
