Põhiline erinevus PFGE ja CRP analüüsi vahel seisneb selles, et PFGE on laboritehnika, mida kasutatakse suurte DNA molekulide eraldamiseks perioodiliselt muutuva elektrivälja abil, samas kui CRP (c-reactive protein) analüüs on meetod, mis tuvastab vereplasmas rõngakujulise valgu.
PFGE ja CRP analüüs on kaks tehnikat, mida teadlased kasutavad erinevate inimkeha kahjustavate patogeensete organismide tuvastamiseks. Impulssvälja geelelektroforees (PFGE) on otsene laboritehnika, mis tuvastab patogeeni, eriti bakteriisolaadi DNA-sõrmejälje. Teisest küljest on CRP kaudne test, mida kasutatakse põletikust tingitud spetsiifilise valgu tuvastamiseks veres. Need põletikud on tavaliselt põhjustatud bakteriaalsete või muude patogeenide põhjustatud infektsioonidest.
Mis on PFGE?
Pulssvälja geelelektroforees on tehnika, mida kasutatakse suurte DNA molekulide eraldamiseks geelmaatriksis elektrivälja rakendamisega. Elektriväli muudab perioodiliselt oma suunda. Seda võib kasutada erinevate organismide geenitehnoloogia või genotüpiseerimise jaoks. PFGE protseduur on suhteliselt sarnane standardse geelelektroforeesi tehnikaga. Ainus erinevus on pinges, mis perioodiliselt muutub kolme suuna vahel. Üks suund kulgeb läbi geeli kesktelje, ülejäänud kaks aga mõlemal küljel 60-kraadise nurga all. Kuna impulsi aeg on igas suunas võrdne, põhjustab see DNA edasisuunalise migratsiooni.
Joonis 01: PFGE analüüs
See protseduur võtab eraldatavate fragmentide suuruse tõttu kauem aega kui üldine geelelektroforees. PFGE tehnikas reageerivad elektrivälja suuna muutustega erineva pikkusega DNA muutustele erineva kiirusega. Suured DNA fragmendid joonduvad aeglaselt, võrreldes väiksemate DNA fragmentidega, mis joonduvad kiiresti. Seetõttu on selle tehnika abil võimalik DNA fragmente paremini eraldada.
PFGE-d kasutatakse tavaliselt bakteriaalsete patogeenide (nt Listeria monocytogenes) tuvastamiseks. See on populaarne meetod kliiniliste infektsioonide tuvastamiseks.
Mis on CRP-analüüs?
C-reaktiivne valk (CRP) on rõngakujuline (rõngakujuline) pentameerne valk, mida leidub vereplasmas. Üldiselt suureneb CRP kontsentratsioon vastusena põletikule. CRP analüüs põhineb selle valgu tuvastamisel vereplasmas. CRP-valku sünteesib maks vastusena teatud teguritele, mida sekreteerivad makrofaagid ja rasvarakud. CRP valk on esimene mustrit tuvastav retseptor (PRR), mis on tuvastatud.
Joonis 02: CRP analüüs
Suurenenud CRP valgu taset võib täheldada pärast traumat, südameinfarkti, autoimmuunhäireid ja bakteriaalseid infektsioone, nagu sepsis. Normaalne CRP valgu tase vereplasmas on 0,3-10 milligrammi liitri kohta (mg/l). Veri võetakse veenist, tavaliselt patsiendi käest. Analüüs viiakse läbi biokeemilise mõõtmismeetodi abil. CRP-testi tulemustes on CRP tasemed üle 10 mg/l tõsise infektsiooni (sepsise) tunnuseks. CRP-test ei selgita põletiku asukohta ega põhjust. Seetõttu peavad arstid soovitama täiendavaid uuringuid, et selgitada põletiku põhjust. Mõnikord tõuseb CRP valgu tase suitsetamise, rasvumise ja harjutuste puudumise tõttu.
Millised on PFGE ja CRP analüüsi sarnasused?
- PFGE ja CRP analüüs on laborites kasutatavad testimisprotseduurid.
- Mõlemad testid on suunatud biomolekulidele.
- Neid kasutatakse inimeste haiguste tuvastamiseks.
- Need testid on võimelised tuvastama patogeene.
Mis vahe on PFGE ja CRP analüüsil?
PFGE on laboritehnika, mida kasutatakse suurte DNA molekulide eraldamiseks perioodiliselt muutuva elektrivälja rakendamisel. Seevastu CRP analüüs on meetod, mis tuvastab rõngakujulisi valke vereplasmas. Seega on see peamine erinevus PFGE ja CRP analüüsi vahel. Lisaks tuvastab PFGE patogeenid otse, CRP analüüs aga kaudselt.
Allpool on loetelu olulistest erinevustest PFGE ja CRP analüüsi vahel tabeli kujul.
Kokkuvõte – PFGE vs CRP analüüs
PFGE ja CRP analüüs on kaks kliinilistes laborites rutiinselt kasutatavat testi. PFGE on laboritehnika, mida teadlased kasutavad DNA sõrmejälgede, eriti bakteriaalsete patogeenide saamiseks. C-reaktiivse valgu (CRP) testi kasutatakse põletiku tuvastamiseks, tuvastades vereplasmas suurenenud c-reaktiivse valgu. Mõlemad testid on olulised inimeste haiguste tuvastamisel. Seega võtab see kokku erinevuse PFGE ja CRP analüüsi vahel.
