Põhierinevus signaaljärjestuse ja signaaliplaastri vahel seisneb selles, et signaaljärjestus on valkude aminohappejärjestus, mis aitab sundida rakku kandma valke organellidesse või rakumembraani, samas kui signaaliplaaster on aminohappejärjestus. valgud, mis aitavad rakkudel valke tsütosoolist tuuma ümber paigutada.
Valkude sihtimine või sorteerimine on bioloogiline mehhanism, mille abil valgud transporditakse sobivatesse kohtadesse rakus või väljaspool seda. Valgus endas sisalduv teave juhib seda kohaletoimetamisprotsessi. Valkude õige sorteerimine on raku jaoks ülioluline. Vead või talitlushäired sorteerimisel võivad põhjustada mitmeid haigusi. Signaalijärjestus ja signaaliplaaster on kaks järjestust, mis koosnevad valkude aminohapetest, mis osalevad valkude sihtimises või sortimises.
Mis on signaalijada?
Signaaljärjestus on valkude aminohappejärjestus, mis sunnib rakku valgud ümber paigutama, tavaliselt organellidesse või rakumembraani. Signaaljärjestust tuntakse ka signaalpeptiidina. See on lühike peptiid, mis sisaldab 16 kuni 30 aminohapet. See esineb enamiku äsja sünteesitud valkude N-otsas (vahel C-otsas). Signaalijärjestus aitab valkudel sekretoorsete radade suunas. Signaaljärjestusi sisaldavad valgud hõlmavad neid, mis asuvad organellides (endoplasmaatiline retikulum, Golgi aparaat või endosoomid), erituvad rakust või sisestatakse enamikesse rakumembraanidesse.
Joonis 01: signaalijada
Tavaliselt on enamikul I tüüpi membraaniga seotud valkudel signaaljärjestused. Kuid enamik II tüüpi ja mitut ulatust hõlmavaid membraaniga seotud valke on suunatud sekretoorsele rajale nende esimese transmembraanse domeeni kaudu, mida nimetatakse sihtpeptiidiks. Veelgi enam, prokarüootides suunavad signaaljärjestused äsja sünteesitud valgud SecYEG valku juhtivale kanalile, mis asub plasmamembraanis. Lisaks eksisteerib eukarüootides homoloogne süsteem, kus signaaljärjestused suunavad äsja sünteesitud valgud Sec61 kanalisse. Kuigi sellel kanalil on struktuuri- ja järjestushomoloogia SecYEG-ga, esineb see endoplasmaatilises retikulumis.
Mis on signaaliplaaster?
Signaaliplaaster on aminohapete järjestus valkudes, mis sunnib rakku kandma valke tsütosoolist tuuma. Signaaliplaaster sisaldab teavet antud valgu saatmiseks näidatud asukohta rakus. Tõenäoliselt suunab signaalitee valgu tsütosoolist tuuma. See koosneb aminohappejääkidest, mis on primaarses järjestuses üksteisest kaugel. Need aminohapped paiknevad aga volditud valgu tertsiaarses struktuuris üksteise lähedal.
Joonis 02: Signaaliplaaster
Erinev alt signaaljärjestustest ei eraldata signaaliplaastreid küpsest valgust pärast sorteerimisprotsessi. Signaaliplaastreid on väga raske ennustada. Tuuma lokaliseerimise signaalid on üldiselt signaaliplaastrid, kuigi on olemas ka mõned signaalijärjestused. Lisaks leitakse tuuma jaoks mõeldud valkudel signaaliplaastreid, mis võimaldavad nende selektiivset transporti tsütosoolist tuuma läbi tuumapooride komplekside.
Millised on signaalijada ja signaalipaiga sarnasused?
- Signaalijärjestus ja signaaliplaaster on kaks järjestust, mis on seotud valgu sihtimise või sortimisega.
- Mõlemad järjestused esinevad valkudes.
- Need järjestused on lühikesed aminohappejärjestused.
- Mõlema järjestuse vead võivad põhjustada valgu sorteerimise talitlushäireid, mille tulemuseks on mitu haigust.
Mis vahe on signaalijada ja signaalipaiga vahel?
Signaaljärjestus on valkudes leiduv aminohappejärjestus, mis sunnib rakku kandma valke organellidesse või rakumembraani, samas kui signaaliplaaster on valkudes leiduv aminohappejärjestus, mis kutsub rakku valkude ümberpaigutamiseks tavaliselt tsütosoolist tuuma. Seega on see peamine erinevus signaalijada ja signaaliplaastri vahel. Veelgi enam, küpsed valgud lõhustavad signaaljärjestuse pärast sorteerimist, samas kui küpsed valgud pärast sorteerimist signaaliplaastrit ei lõika.
Järgmine tabel võtab kokku signaalijada ja signaaliplaastri erinevused.
Kokkuvõte – signaalijada vs signaaliplaaster
Signaalijärjestus ja signaaliplaaster on kaks valkudes leiduvat järjestust. Need on vajalikud valkude sihtimiseks või sorteerimiseks. Signaalijärjestus sunnib rakku valgud ümber paigutama, tavaliselt organellidesse või rakumembraani. Teisest küljest sunnib signaaliplaast rakku valke ümber paigutama, tavaliselt tsütosoolist tuuma. Niisiis, see on peamine erinevus signaalijada ja signaaliplaastri vahel.
