Põhierinevus SEC-i ja TAT-raja vahel on see, et SEC-rada transpordib voltimata valke, samas kui TAT-rada transpordib volditud valke.
Valkude süntees ja transpordimehhanismid on levinud kõikides loomades, taimedes, arhees ja bakterites. Valkude transport viitab valkude liikumisele rakulistest või rakuvälistest sektsioonidest teise. SEC rada ja TAT rada on kaks sellist süsteemi, mis on seotud valkude transportimisega. Need süsteemid transpordivad valke kas läbi tsütoplasmaatilise membraani või plasmamembraani. Sellise transpordi protsess on organismiti erinev, olenev alt arenenud olemusest. SEC rada on arenenum kui TAT rada, kuna see koosneb erinevatest alamkategooriatest ja arenenumatest signaalimissüsteemidest. Mõlema süsteemi transporditeed hõlbustavad endotsütoos, eksotsütoos, valkude translokatsioon ja membraanidega kaubitsemine.
Mis on SEC Pathway?
SEC rada või sekretoorne rada on kandurrada, mis hõlmab üldlevinud ja universaalset ekspordimehhanismi enamiku plasmamembraani integreeritud või selle kaudu ümber paigutatud valkude jaoks. See on bioloogilistes süsteemides oluline rada, mis kutsub esile valkude transpordi rakumembraanile, kus need vabanevad. Paljude valkude puhul toimub SEC rada suhteliselt ühtlase kiirusega. Valkude sünteesi kiirus mõjutab otseselt transpordi kiirust. SEC-raja ajal toimub valkude transport voltimata kujul.
Joonis 01: SEC Pathway organellid
SEC-rajale suunatud valgud koosnevad kahest rühmast. Üks valkude rühm sisaldab valke, mis toimivad ER-s ja Golgis, et tagada valkude õige voltimine ja modifitseerimine (residentvalgud). Teine valkude rühm sisaldab valke, mida töödeldakse ER-s ja Golgis ning transporditakse hilisematesse sektsioonidesse, nagu plasmamembraan, lüsosoomid ja rakuväline ruum. Nendel valkudel on kaks signaalimehhanismi. Üks signaal annab valkudele korralduse siseneda sekretoorsesse rajasse ja teine signaal annab valkudele korralduse lokaliseerida see teatud organellidesse raja sees.
Mis on TAT Pathway?
TAT rada ehk kaksik-arginiini translokatsioonirada on valgu transpordirada, mida leidub taimedes, bakterites ja arhees. Selle raja käigus transporditakse valgud volditud viisil läbi lipiidmembraani kaksikkihi. Taimedes on TAT rada kloroplasti tülakoidmembraanis. Siin liiguvad valgud tülakoidi luumenisse. Bakterites esineb see tsütoplasmaatilises membraanis ja transpordib valgud rakuümbrisesse.
Joonis 02: Valgud TAT-rajas
TAT raja protsessi käigus toimub valkude voltimine enne transporti, kuna need sisaldavad redoks-kofaktoreid, mis sisestatakse tsütoplasmasse. Voltimine aitab vältida ka vale metalliiooni kofaktori sisestamist aktiivsesse kohta. Bakterite ja arheea puhul on TAT-raja nõue erinev. Mõnes organismis on see oluline transpordimehhanism, teistes aga mitteoluline. Mõnes arheas ja bakteris puudub TAT rada täielikult. TAT rada sõltub ka põhilistest transpordimehhanismidest, nagu membraanikaubandus, valkude translokatsioon ja endotsütoos või eksotsütoos.
Millised on SEC-i ja TAT-tee sarnasused?
- SEC- ja TAT-teed on elusüsteemi transpordiks olulised komponendid.
- Nad on seotud valkude transpordiga.
- Lisaks toimivad mõlemad rajad vastav alt konkreetsele signaalimissüsteemile.
- Nii SEC-i kui ka TAT-teed hõlbustavad kas membraanikaubandus, valkude translokatsioon ja endotsütoos või eksotsütoos.
Mis vahe on SEC-i ja TAT-tee vahel?
Põhiline erinevus SEC-i ja TAT-raja vahel on see, et SEC-rada transpordib voltimata valke, samas kui TAT-rada transpordib volditud valke. SEC rada on kõige levinum loomadel. TAT rada on kõige levinum taimedes, arhees ja bakterites. Lisaks on SEC-rada saadaval kõigil loomadel ja toimib olulise komponendina. Teisest küljest võib TAT-rada olla oluline, mitteoluline või üldse puududa.
Allpool olev infograafik esitab SEC-i ja TAT-raja erinevused tabelina kõrvuti võrdlemiseks.
Kokkuvõte – SEC vs TAT Pathway
Valkude süntees ja transpordimehhanismid on levinud kõikides loomades, taimedes, arhees ja bakterites. Valkude transport hõlmab valkude liikumist rakulistest või rakuvälistest sektsioonidest teise. SEC rada ja TAT rada on kaks sellist süsteemi, mis on seotud valkude transportimisega. Peamine erinevus SEC-i ja TAT-raja vahel on see, et SEC-rada transpordib voltimata valke, samas kui TAT-rada transpordib volditud valke. Mõlema süsteemi transporditeed hõlbustavad endotsütoos, eksotsütoos, valkude translokatsioon ja membraanidega kaubitsemine.
