Sigmafaktori ja rho-faktori peamine erinevus seisneb selles, et sigmafaktor on valk, mis on vajalik transkriptsiooni käivitamiseks bakterites, samas kui rho-faktor on valk, mis on vajalik transkriptsiooni lõpetamiseks bakterites.
Sigma faktor ja rho faktor on kaks olulist bakterite transkriptsiooni tegurit. Bakteriaalne transkriptsioon on protsess, mille käigus bakteri DNA tükk kopeeritakse äsja valmistatud mRNA ahelasse (messenger RNA). Seda protsessi katalüüsib ensüüm, mida nimetatakse RNA polümeraasiks. Bakterid sõltuvad suuresti transkriptsioonist ja tõlkimisest, et oma keskkonnale õigesti reageerida. Bakteriaalne RNA polümeraas koosneb tuumast ja holoensüümstruktuurist. Tuum sisaldab subühikuid β, β', α ja 2ω, samas kui holoensüüm sisaldab sigmafaktorit. Veelgi enam, RNA polümeraasi abifaktor, mida nimetatakse rho faktoriks, on samuti väga oluline bakteriaalse transkriptsiooni jaoks.
Mis on Sigma Factor?
Sigma faktor või spetsiifilisusfaktor on valk, mis on vajalik transkriptsiooni käivitamiseks bakterites. See on bakteriaalne transkriptsiooni initsiatsioonifaktor. See tegur võimaldab RNA polümeraasi ensüümi seondumist DNA spetsiifilise piirkonnaga, mida nimetatakse promootorpiirkonnaks transkriptsiooni ajal. Sigma faktor on tavaliselt homoloogne arheaalse transkriptsioonifaktoriga B ja eukarüootse transkriptsioonifaktoriga TF11B. Veelgi enam, antud geeni spetsiifiline sigmafaktor varieerub sõltuv alt geenist ja keskkonnasignaalidest. Promootorid valib RNA polümeraas sõltuv alt sellega seotud sigmafaktorist.
Joonis 01: Sigma tegur
Sigmafaktorit võib plastiid-kodeeritud polümeraasi (PEP) osana leida ka taimede kloroplastist. Sigmafaktor ja RNA polümeraas on kokku tuntud kui RNA polümeraasi holoensüüm. Sigmafaktori molekulmass on umbes 70 kDa. Pärast transkriptsiooni algust dissotsieerub sigma faktor kompleksist. Seejärel jätkab RNA polümeraas pikenemist, kuni transkriptsioon lõpeb.
Mis on Rho Factor?
Rho tegur on prokarüootne valk, mis osaleb transkriptsiooni lõpetamises. Rho faktor seondub tavaliselt transkriptsiooni terminaatori pausi saidiga. See sait on üheahelalise RNA paljastatud piirkond avatud lugemisraami lähedal tsütosiinirikaste guaniinivaeste järjestuste juures. See on prokarüootides oluline transkriptsioonivalk. Escherichia coli puhul on rho faktoriks ligikaudu 274,6 kDa identsete subühikute heksameer. Igal subühikul on RNA-d siduv domeen ja ATP hüdrolüüsi domeen. Pealegi on rho faktori funktsioon helikaasi aktiivsus.
Joonis 02: Rho tegur
Rho faktor seondub RNA molekuliga ja kasutab seejärel selle ATPaasi aktiivsust, et anda energiat RNA molekulide ümberpaigutamiseks. Rho faktor teostab translokatsiooni, kuni see jõuab RNA-DNA spiraalsesse piirkonda, kus see kerib lahti hübriidse (RNA-DNA) dupleksstruktuuri. See protsess peatab RNA polümeraasi terminatsioonikohas, lõpetades transkriptsiooniprotsessi.
Millised on Sigma faktori ja Rho faktori sarnasused?
- Sigma-faktor ja rho-faktor on kaks olulist bakteriaalse transkriptsiooni tegurit.
- Mõlemad esinevad ainult prokarüootides.
- Need on aminohapetest koosnevad valgud.
- Mõlemad on nukleiinhappeid siduvad valgud.
- Prokarüootid sõltuvad suuresti nendest teguritest, et genereerida mRNA-d, mis võivad toota omapäraseid valke ja aidata neil keskkonnale spetsiifiliselt reageerida.
Mis vahe on Sigma faktoril ja Rho faktoril?
Sigma faktor on valk, mis on vajalik transkriptsiooni käivitamiseks bakterites, samas kui rho faktor on valk, mis on vajalik transkriptsiooni lõpetamiseks bakterites. Niisiis, see on peamine erinevus sigma-teguri ja rho-teguri vahel. Lisaks on sigmafaktor DNA-d siduv valk, samas kui rho-faktor on RNA-d siduv valk.
Allpool olev infograafik esitab sigma- ja rho-teguri vahelised erinevused tabelina kõrvuti võrdlemiseks.
Kokkuvõte – Sigma Factor vs Rho Factor
Transkriptsioon on protsess, mille käigus DNA-s sisalduv teave kopeeritakse uude molekuli, mida nimetatakse mRNA-ks (messenger RNA). See m-RNA osaleb lõpuks spetsiifilise valgu tootmises. Sigma faktor ja rho faktor on bakterite transkriptsiooni kaks olulist tegurit. Need on valgud. Sigma faktor osaleb transkriptsiooni käivitamisel bakterites. Rho faktor vastutab transkriptsiooni lõpetamise eest bakterites. Seega on see sigmafaktori ja rho-teguri erinevuse kokkuvõte.
