Põhierinevus VNTR ja sondi vahel on see, et VNTR on lühike nukleotiidjärjestus, mis esineb genoomis tandemkordusena, samas kui sond on kunstlikult sünteesitud DNA või RNA lühike järjestus, mida saab radioaktiivselt märgistada.
VNTR tähistab muutuva arvu tandemkordust. See on lühike nukleotiidjärjestus, mis on genoomis järjestatud tandemkordustena. VNTR-id esinevad meie genoomis loomulikult. Sond on kunstlikult sünteesitud lühike DNA või RNA järjestus. Nii sond kui ka VNTR on nukleiinhapped või lühikesed nukleotiidjärjestused. Neid kasutatakse tohutult erinevates molekulaarbioloogilistes tehnikates, peamiselt kohtuekspertiisi uuringutes. VNTR-il ja sondil on nii sarnasusi kui ka erinevusi. Seetõttu püüab artikkel esile tuua erinevuse VNTR ja sondi vahel.
Mis on VNTR?
VNTR on lühike nukleotiidjärjestus, mis eksisteerib meie genoomis tandemkordusena. VNTR-id esinevad paljudes kromosoomides. Lisaks erinevad VNTR-id erinevatel isikutel pikkuste poolest, kuna korduste arv on erinevate inimeste VNTR-ides erinev. Põhimõtteliselt on see tingitud nende vanematelt päritud alleelidest. Seetõttu kasutame VNTR-e peamiselt vanemate tuvastamiseks (pärimiseks) või isiklikel eesmärkidel. Samamoodi on neid võimalik kasutada ka geneetikas, kohtuekspertiisi, bioloogiliste uuringute ja DNA sõrmejälgede võtmisel. Seetõttu on VNTR oluline tööriist molekulaarbioloogias.
Joonis 01: VNTR
Pärimise puhul analüüsime VNTR-i andmeid, kasutades kahte põhiprintsiipi: pärandi sobitamine ja identiteedi sobitamine. Pärandi sobitamise ajal peab isikul olema iga vanema alleel, mis kattub. Identiteedi sobitamise ajal peavad mõlemad VNTR alleelid olema genoomi kindlas asukohas.
Mis on sond?
Molekulaarbioloogia kontekstis on sond kunstlikult sünteesitud DNA või RNA fragment pikkusega 100–1000 alust. Saame need sondid radioaktiivselt märgistada. Seetõttu kasutame neid sihtmärk-nukleotiidjärjestuste tuvastamiseks, mis on komplementaarsed sondi järjestusega. Kui lisame proovile sonde, toimub hübridiseerumine komplementaarsete järjestuste või sihtjärjestustega ja muudab sihtjärjestuste tuvastamise lihtsaks. Kuna sondid kannavad radioaktiivsust, saame neid kergesti tuvastada.
Joonis 02: sond
Kohtuekspertiisi teaduses kasutame me tavaliselt sonde DNA profiilide koostamise tehnikates, nagu lühikeste tandemkorduspiirkondade tuvastamine, restriktsioonifragmendi pikkuse polümorfism ja DNA sõrmejälgede võtmine.
Millised on VNTR ja Probe sarnasused?
- Nukleiinhapped on VNTR ja Probe ehitusplokid.
- Kasutame neid geenituvastusprotsessides.
- Samuti on nende mõlema pikkused varieeruvad.
- Need on olulised vahendid kohtuekspertiisi uuringutes, DNA sõrmejälgede võtmises, geneetikas jne.
Mis vahe on VNTR-il ja sondil?
VNTR on genoomi piirkond, mis on organiseeritud tandemkordustena, samas kui sond on lühike DNA või RNA järjestus, mis sünteesitakse kunstlikult, et tuvastada proovis sihtjärjestusi. Niisiis, see on peamine erinevus VNTR ja sondi vahel. Oluline erinevus VNTR-i ja sondi vahel on ka see, et erinev alt VNTR-idest saame sonde radioaktiivselt märgistada.
Lisaks teostavad VNTR-id enamasti vanemate tuvastamist, samas kui sondid aitavad tuvastada DNA või RNA proovides sihtmärk-nukleotiidjärjestusi, mis on sondi järjestusega komplementaarsed. Seega on see ka oluline erinevus VNTR ja sondi vahel.
Järgmine infograafik annab rohkem teavet VNTR ja sondi erinevuse kohta.
Kokkuvõte – VNTR vs Probe
VNTR-i ja sondi kasutatakse tavaliselt molekulaaranalüüsi tehnikates, nagu kohtuekspertiisi uuringud ja DNA sõrmejälgede võtmine. Mõlemad koosnevad muutuva pikkusega. Peamine erinevus VNTR ja sondi vahel on aga see, et VNTR on genoomi piirkond, mis on paigutatud tandemkordustega, samas kui sond on DNA või RNA fragment, mida saab radioaktiivselt märgistada. Veelgi enam, VNTR-id esinevad genoomis. Kuid sondid sünteesitakse kunstlikult ja neid saab radioaktiivselt märgistada, et tuvastada DNA või RNA proovides sihtmärk-nukleotiidjärjestusi, mis on sondi järjestusega komplementaarsed. Seega on see VNTR ja sondi vahelise erinevuse kokkuvõte.
