Peamine erinevus – üldised vs spetsiifilised transkriptsioonitegurid
RNA polümeraas vajab mRNA sünteesimisel DNA matriitsi ahelale toimimiseks transkriptsioonifaktoreid. Transkriptsioonifaktoreid on erinevat tüüpi. Need transkriptsioonifaktorid moodustavad DNA ahelaga kompleksi. Need kas muudavad matriitsi ahela kinnitust või suurendavad RNA polümeraasi ensüümi afiinsust mRNA sünteesi suhtes, mida nimetatakse transkriptsiooniks. Transkriptsioonifaktoreid on kahte peamist tüüpi. Need on üldised või põhilised transkriptsioonifaktorid ja spetsiifilised transkriptsioonifaktorid. Üldised transkriptsioonifaktorid on tegurid, mida kasutatakse initsiatsioonieelse kompleksi moodustamiseks transkriptsiooniprotsessi ajal. Neid leidub peaaegu kõigis eukarüootides ja prokarüootides moodustavad nad vähem keeruka kompleksi. Spetsiifilised transkriptsioonifaktorid on kas võimendajad või repressorid, mis on spetsiifilised DNA järjestused, mis aktiveerivad või represseerivad üldist transkriptsiooniprotsessi. Mõned spetsiifilised transkriptsioonifaktorid võivad muuta DNA järjestust ennast. Peamine erinevus üldiste transkriptsioonifaktorite ja spetsiifiliste transkriptsioonifaktorite vahel põhineb funktsionaalsusel. Üldised transkriptsioonifaktorid on seotud transkriptsiooniprotsessi initsiatsioonieelse kompleksi moodustamisega, samas kui spetsiifilised transkriptsioonifaktorid osalevad kas transkriptsiooniprotsessi aktiveerimises või mahasurumises.
Mis on üldised transkriptsioonitegurid?
Üldised või põhilised transkriptsioonifaktorid on tegurid, mis on seotud initsiatsioonikompleksi moodustumisega transkriptsiooni ajal. Need on transkriptsiooniprotsessi jaoks hädavajalikud, seega mängivad nad edukas transkriptsioonis olulist rolli. On kuus peamist üldist transkriptsioonifaktorit. Nemad on; TFIID, TFIIB, TFIIH, TFIIE, TFIIF ja TFIIA. Nad mängivad initsiatsioonikompleksi moodustamisel erinevaid rolle.
- TFIID – see transkriptsioonifaktor (TF) osaleb promootorjärjestuse äratundmises (TATA kast).
- TFIIB – TFIIB tunneb ära promootori /TFIID kompleksi. See annab signaali peamise katalüüsiva ensüümi RNA polümeraasi sidumiseks.
- TFIIF – see transkriptsioonifaktor on seotud RNA polümeraasiga. Seega osaleb TFIIF protsessis, värbades RNA polümeraasi õigesse asukohta.
- TFIIE ja TFIIH – nende transkriptsioonifaktorite seondumine tähistab initsiatsioonieelse moodustumise lõppu. Nende sidumine suurendab initsiatsioonieelse kompleksi moodustumise efektiivsust.
- TFIIA soodustab TFIID-i sidumist TATA-kastiga.
Joonis 01: Üldised transkriptsioonitegurid
Eespool nimetatud üldised transkriptsioonifaktorid on spetsiifilised RNA polümeraasi II suhtes, mis on RNA polümeraasi tüüp, mis pikendab mRNA ahelat. RNA polümeraasiga I ja III on seotud üldised transkriptsioonifaktorid. Üldised transkriptsioonifaktorid võivad samuti erineda sõltuv alt rakutüübist, millele see toimib.
Mis on spetsiifilised transkriptsioonifaktorid?
Spetsiifilised transkriptsioonifaktorid on piirkonnad, mis asuvad samuti DNA järjestustes. Need on enamasti kas võimendajad või repressorid. Spetsiifilised transkriptsioonifaktorid on spetsiifilised cis-toimivad elemendid matriitsi DNA ahelas, mis läbivad transkriptsiooni. Nende spetsiifiliste võimendajate ja repressorite aktiveerimine osaleb ensüümi afiinsuse suurendamises, muutes DNA molekuli orientatsiooni või toimides signaalipiirkondadena. Spetsiifilisi transkriptsioonifaktoreid kasutatakse ka DNA matriitsi ahela modifikatsioonide esilekutsumiseks. Need modifikatsioonid hõlmavad peamiselt kovalentseid modifikatsioone, näiteks metüülimist. Seega toimivad metüülitud DNA piirkonnad transkriptsiooniprotsessi eriliste võimendajatena või repressoritena.
Joonis 02: spetsiifilised transkriptsioonifaktorid
Konkreetsed transkriptsioonifaktorid sõltuvad liigi tüübist ja neid ei leidu tavaliselt kõigis eukarüootides. Neid transkriptsioonifaktoreid aktiveerivad erinevad metaboolsed tingimused signaaliülekande radade kaudu. Aktiveerimisel reguleerivad nad geeni ekspressiooni transkriptsiooni tasemel.
Millised on üldiste ja spetsiifiliste transkriptsioonifaktorite sarnasused?
- Transkriptsiooniprotsessis on vajalikud mõlemad tegurid.
- Mõlemad tegurid mõjutavad organismi geeniekspressiooni.
- Mõlemad tegurid aitavad reguleerida RNA polümeraasi funktsiooni transkriptsiooniprotsessis.
- Mõlemat tegurit leidub enamasti eukarüootides.
Mis vahe on üldistel ja spetsiifilistel transkriptsioonifaktoritel?
Üldine vs spetsiifiline transkriptsioon |
|
| Üldised transkriptsioonifaktorid on tegurid, mida kasutatakse initsiatsioonieelse kompleksi moodustamiseks transkriptsiooniprotsessi ajal. | Spetsiifilised transkriptsioonifaktorid on kas võimendajad või repressorid, mis on spetsiifilised DNA järjestused, mis aktiveerivad või represseerivad üldist transkriptsiooniprotsessi. |
| Molekuli tüüp | |
| Üldised transkriptsioonifaktorid on valgupõhised. | Spetsiifilised transkriptsioonifaktorid on nukleotiidjärjestused. |
| Moodustamine | |
| Üldised transkriptsioonifaktorid moodustavad transkriptsiooni initsiatsiooni ajal initsiatsioonieelse kompleksi. | Spetsiifilised transkriptsioonifaktorid toimivad transkriptsiooni võimendajatena või repressoridena. |
| Tüübid | |
| Seal on kuus peamist tüüpi; Üldiste transkriptsioonifaktorite TFIID, TFIIB, TFIIH, TFIIF, TFIIE ja TFIIA. | Spetsiifilised transkriptsioonifaktorid liigitatakse peamiselt võimendajateks ja repressoriteks. |
Kokkuvõte – üldised vs spetsiifilised transkriptsioonifaktorid
Transkriptsioonifaktorid on transkriptsiooniregulatsiooni jaoks olulised ning need on vajalikud protsessi tõhususe ja täpsuse suurendamiseks. Transkriptsioonifaktoreid on kahte peamist tüüpi; Üldine / Basaal ja spetsiifiline. Üldised transkriptsioonifaktorid on seotud initsiatsioonieelse kompleksi moodustumisega transkriptsiooni ajal, samas kui spetsiifilised transkriptsioonifaktorid on DNA enda piirkonnad, mis toimivad võimendajatena või repressoridena. Üldised transkriptsioonifaktorid on valgupõhised ja seda nõuavad kõik eukarüootid. See ei ole lai alt varieeruv ja jääb ühtlaste molekulidena. Konkreetne transkriptsioonifaktor võib olla väga erinev ja sõltub inimese geneetilisest ülesehitusest. See on erinevus üldiste ja spetsiifiliste transkriptsioonifaktorite vahel.
Laadige alla PDF-versioon jaotisest Üldised vs spetsiifilised transkriptsioonifaktorid
Saate alla laadida selle artikli PDF-versiooni ja kasutada seda võrguühenduseta kasutamiseks vastav alt tsitaadi märkusele. Laadige PDF-versioon alla siit. Üldiste ja spetsiifiliste transkriptsioonifaktorite erinevus
