Põhiline erinevus DNA transposoonide ja retrotransposoonide vahel seisneb selles, et DNA transposoonid on liikuvad geneetilised elemendid, mis liiguvad genoomis ühest kohast teise lõikamise ja kleepimise mehhanismi abil, samas kui retrotransposoonid on liikuvad geneetilised elemendid, mis liiguvad ühest kohast. teisele genoomis, kasutades kopeerimis- ja kleepimismehhanismi.
Mobiilsed geneetilised elemendid (MGE) on DNA segmendid, mis kodeerivad spetsiifilisi ensüüme ja valke, mis vahendavad nende liikumist genoomis või mida saab ühelt liigilt teisele üle kanda. Neid tuntakse ka isekate geneetiliste elementidena. Ülekantavad elemendid esindavad ühte mitmest mobiilse geneetilise elemendi tüübist. Transponeeritavaid elemente on kahte peamist tüüpi: DNA transposoonid ja retrotransposoonid. Seetõttu on DNA transposoonid ja retrotransposoonid liikuvad geneetilised elemendid, mis võivad genoomis ühest kohast teise liikuda.
Mis on DNA transposoonid?
DNA transposoonid on liikuvad geneetilised elemendid, mis liiguvad genoomis ühest kohast teise lõikamise ja kleepimise mehhanismi abil. Need kuuluvad II klassi ülekantavate elementide hulka, mis liiguvad läbi DNA vaheühendi. See on vastupidine I klassi transponeeritavatele elementidele (retrotransposoonidele), mis liiguvad läbi RNA vaheühendi. Tavaliselt liiguvad DNA transposoonid genoomis ringi, kasutades lõikamise ja kleepimise meetodit. See meetod nõuab transposaasi ensüümi, mis katalüüsib DNA liikumist selle praegusest asukohast genoomis ja sisestamist uude asukohta.
Joonis 01: DNA transposoonid
Selleks transponeerimiseks on vaja transposoonil kolme DNA saiti (kaks transposooni mõlemas otsas, mida nimetatakse terminaalseteks ümberpööratud kordusteks ja üks sihtsaidis). Transposaasi ensüüm seondub transposooni terminaalsete ümberpööratud kordustega ja vahendab transposooni otste sünapsit. Seejärel eraldab transposaasi ensüüm elemendi algse doonorsaidi külgnevast DNA-st ja vahendab transposooni liitumist genoomi uue sisestuskohaga. Transposooni lisamine uude asukohta põhjustab sisestatud segmendi mõlemal küljel lühikesi lünki. Hostsüsteemid parandavad need lüngad, mille tulemuseks on sihtjärjestuse dubleerimine (TSD), mis on iseloomulik transponeerimisele.
Mis on retrotransposoonid?
Retrotransposoonid on mobiilsed geneetilised elemendid, mis liiguvad genoomis kopeerimis- ja kleepimismehhanismi abil ühest kohast teise. Need kuuluvad I klassi ülekantavate elementide hulka. I klassi transponeeritavad elemendid (retrotransposoonid) liiguvad läbi RNA vaheühendi genoomis. Need on teatud tüüpi geneetilised komponendid, mis kopeerivad ja kleebivad end erinevatesse genoomsetesse asukohtadesse.
Joonis 02: Retrotransposoonid
Esiteks transkribeeritakse need DNA-st RNA-ks. Seejärel toodetud RNA pöördtranskribeeritakse DNA-ks. See kopeeritud DNA sisestatakse hiljem uuesti genoomi uude kohta. Pöördtranskriptsiooni katalüüsib pöördtranskriptaas. Pöördtranskriptaasi kodeerib sageli retrotransposoon ise. Integratsiooni viib läbi ensüüm, mida nimetatakse integraasiks. Lisaks on tavaliselt kolme tüüpi: pikad terminali kordused (LTR), pikad vahelduvad tuumaelemendid (LINE) ja lühikesed vahelduvad tuumaelemendid (SINE).
Millised on DNA transposoonide ja retrotransposoonide sarnasused?
- DNA transposoonid ja retrotransposoonid on liikuvad geneetilised elemendid.
- Mõlemad on klassifitseeritud ülekantavate elementide alla.
- Mõlemat nimetatakse hüppegeenideks.
- Nad võivad genoomis ühest kohast teise liikuda.
- Need on evolutsiooniliselt väga olulised.
Mis vahe on DNA transposoonidel ja retrotransposoonidel?
DNA transposoonid on liikuvad geneetilised elemendid, mis liiguvad genoomis ühest kohast teise lõikamise ja kleepimise mehhanismi abil, retrotransposoonid on aga liikuvad geneetilised elemendid, mis liiguvad genoomis ühest kohast teise koopia ja kleebi abil. pasta mehhanism. Seega on see peamine erinevus DNA transposoonide ja retrotransposoonide vahel. Lisaks kuuluvad DNA transposoonid II klassi ülekantavate elementide hulka, retrotransposoonid aga I klassi ülekantavate elementide hulka.
Allpool olev infograafik näitab erinevusi DNA transposoonide ja retrotransposoonide vahel kõrvuti võrdlemiseks tabelina.
Kokkuvõte – DNA transposoonid vs retrotransposoonid
DNA transposoonid ja retrotransposoonid on liikuvad geneetilised elemendid. DNA transposoonid liiguvad genoomis ühest kohast teise, kasutades lõigatud pasta mehhanismi. Retrotransposoonid liiguvad genoomis ühest kohast teise, kasutades kopeerimis- ja kleepimismehhanismi. Niisiis, see võtab kokku erinevuse DNA transposoonide ja retrotransposoonide vahel.
